以后更以齐备的祭田祭器、完备的学规章程、丰富的藏书而位居杭城四大书院之首，成为浙江省最高学府，学生遍及全省１１个府，造就了无数人才。清代后期，书院屡修屡圮，终因地处僻处而生源骤减。为此，光绪十八年（１８９２年），浙江巡抚叶赫崧骏和布政使刘树堂筹款购屋，将书院迁至城东葵巷，更名为“敷文讲学之庐”。光绪二十八年改为安定中学堂。
２００２年，杭州市人民政府按明式旧制在原遗址上重建书院，再现了５００年前的“名校”风采。传说梁山伯与祝英台到杭州读书，同窗三载就在万松书院，为书院增添了一份特殊的情怀。
【紫阳书院】始建于清康熙四十二年（１７０３年），由两浙都转盐运使高熊征及盐商汪鸣瑞等捐资建造，初名“紫阳别墅”，主要招收商人子弟。
书院位于杭州城内紫阳山南麓太庙巷，旁多名胜，“得一丘一壑之胜，山泉云脚时注于庭”。在那里俯视城市，可见万屋鳞次；远眺钱塘江，如在襟带之间，虽临闹市却别具幽趣。书院主要祭祀南宋理学家朱熹，采用《白鹿洞书院揭示》为学规。地处城区，交通方便，生徒众多。乾隆年间，书院学生多达３００余人。当时因书院学生太多，经费完全靠安徽盐商捐赠已入不敷出，于是清政府多次拨给两浙盐务项下官款，资助书院膏火。咸丰十一年（１８６１年），院舍毁于兵燹。同治四年（１８６５年），布政使蒋益澧重建，更名为“紫阳书院”。光绪二十八年（１９０２年），改为仁和县高等小学堂。其遗址为现杭州紫阳小学原址。
【瀛山书院】位于淳安县郭村乡东北之瀛山，始建于北宋。据明万历壬子《遂安县志》载：“瀛山书院，在县西北四十里。北宋熙宁年间，邑人詹安辟建于山之冈，凿方塘于麓，其孙仪之与朱晦翁往来论学于此。”瀛山，旧名银峰，北宋詹安在此构建双桂学堂，延师授业，詹氏子孙学风日盛。因该书院先后有２４人考中进士，１人中状元，于是以“登瀛”之意，将银峰改名为瀛山，将双桂学堂改名为瀛山书院。南宋着名理学家朱熹曾先后三次应詹安孙子、吏部侍郎詹仪之邀请，前来书院讲学。朱熹总结自己半生治学体会的着名诗篇《咏方塘》（《观书有感》）即源出于此。朱熹在讲学期间，经常漫步于方塘，见方塘虽小，却有源头活水，清澈如镜，深有感触，即吟咏道：“半亩方塘一鉴开，天光云影共徘徊。问渠哪得清如许，为有源头活水来。”从此，瀛山书院更加声名远播，文人雅士纷纷慕名而至，以至于后世有人称“瀛山一席与白鹿洞、鹅湖并成鼎足”之势。书院现已坍圮，仅存遗址，其中大观亭、得源亭尚存，均系民国十二年（１９２３年）重修。
【求是书院】清光绪二十三年（１８９７年），杭州知府林启利用杭州蒲场巷普慈寺创办求是书院，这是浙江省第一所新型高等学府，在中国近代教育史上具有一定地位。林启，字迪臣，福建侯官人。清同治甲子（１８６４年）中进士，担任过编修、陕西学政、杭州知府，后又任浙江道监察御史，提出过“简文法以核实政、汰冗员以清仕途、崇风尚以挽士风、开利源以培民命”的政治主张，其最大政绩在于他兴办教育，开了杭州近代教育的先河。林启墓位于孤山北麓。求是书院占地颇广，闹中取静，环境幽雅。
寺大殿作书院办公室，殿后有东、西两斋，为学生教室和宿舍。书院以“振兴中华、御侮图强”为办学方针，注重实学，反对科举，在教授数、理、化等课的同时，也十分重视国文教育，注意培养学生的民族自强意识，造就出浙江第一批具有科学文化知识的新型人才，如邵飘萍、陈独秀、许寿裳等。书院屡经更名，光绪二十七年（１９０１年）改称“浙江求是大学堂”，翌年改称“浙江大学堂”，光绪二十九年又改称“浙江高等学堂”，１９１４年停办，１９２０年复校，又几经更名，１９２８年定名为国立浙江大学。书院旧址位于现杭州市大学路浙江省中医学院内，仅存原普慈寺大殿，是晚清比较有代表性的古建筑，也是中国近代教育的纪念地。
【蚕学馆】清光绪二十三年（１８９７年），主张“蚕丝为浙特产，而蚕业之兴衰，关系国计民生至大”的杭州知府林启，创办了蚕学馆，以实现其实业救国、教育救国的宏愿。这是我国最早创办的新学教育机构之一。蚕学馆创办之初，确立了“除微粒子病，制造佳种，精求饲育，改良土丝，传授学生，推广民间”的办学宗旨。作为我国创办的第一所纺织学校，蚕学馆揭开了我国近代丝绸纺织教育的帷幕，培养了杰出的民主战士、新闻事业家史量才，蚕丝教育家和革命家郑辟疆等一批优秀人才，被誉为“开全国蚕丝改良之先声”。１９０８年，蚕学馆办学１０年，成绩卓着，被清廷御批改名为浙江高等蚕桑学堂。１９１４年学校的科技成果在巴拿马国际博览会上获得金奖。后学校数度更名移址。１９６４年国务院定名为浙江丝绸工学院，１９９９年更名为浙江工程学院，２００４年５月更名为浙江理工大学。历经１００多年，学校形成了“求知求实、创新创业”的优良传统。蚕学馆旧址位于杭州西湖金沙港（现曲院风荷公园内）。
【浙江第一师范学校】成立于１９０８年，初名“浙江官立两级师范学堂”。１９１３年更名“浙江省立第一师范学校”。“五四”运动时期，当时“一师”校长经亨颐持“以人为本，与时共进”的办学方针，倡导学生自治，在教学上又有所改革，一时思想活跃，并创办《浙江新潮》杂志，宣传新思想，传播新文化。在１９２０年“一师风潮”后，学校成为浙江新文化运动的中心，名列当时江浙“四大名中”。１９５１年更名为“浙江省杭州第一中学”，为省重点中学。１９８８年恢复了１９４９年校名“浙江省杭州高级中学”。１９９５年成为浙江省首批一级重点中学。学校创立以来，吸引了诸多名家如陈叔通、沈钧儒、鲁迅、李叔同、夏硏尊、陈望道、马叙伦、朱自清、叶圣陶、蒋梦麟、崔东伯等任教于此，培养了俞秀松、施存统、徐志摩、郁达夫、丰子恺、潘天寿、曹聚仁、柔石、冯雪峰、金庸、刘吉、姜立夫、陈建功、徐匡迪、蒋筑英等大量优秀人才，在国内外享有盛誉。“一师”旧址在旧贡院（现为杭州高级中学校址）。原占地８万平方米，共７进，砖木结构。后又增建筑，近年经改建，第一进仍保持“一”字形原样，唯原为歇山顶的两层楼房于１９３７年前后几经修建，保存下来的是红平瓦、钢混结构的建筑，墙面的粉层为水泥细石。明间为拱形大门，南北相通，呈通道，石板墁地。整座教学楼，北面为内廊，东西一字排列，计１０间，每间北向辟门，出入廊间，对称整洁。学校至今保存有“浙江省立第一师范学堂”石刻横额，立于大门西侧以资纪念。
【五峰书院】位于永康方岩寿山之麓。因方岩寿山有固厚、瀑布、桃花、覆釜、鸡鸣五峰而得名。南宋淳熙年间，朱熹、吕祖谦、陈亮、吕子阳等曾在固厚峰下石洞中读书讲学。南宋庆元四年（１１９８年）朱熹在此完成《大学章句集注》。洞中筑有讲台，台后洞壁有“兜率台”三字，系朱熹手笔。明正德年间应典、程文德、李东溪、程梓、卢可久等曾在此共倡王守仁“良知之学”，应典在天然石洞中构筑丽泽祠，祀朱熹、吕祖谦、陈亮等，俗称“三贤堂”。后知府陈受泉又命吕瑗创建正楼，定名“五峰书院”，奉祀王守仁，以应典、程梓、卢可久配祀。明末，邑人周佑德于丽泽祠西侧筑学易斋，祀郡贤何基、王柏、许谦、章懋、金履祥，并以后学李祺、杜子光、周荣配祀。每年秋季，四方学者聚集，读书讲学其中。五峰书院因洞造屋，久经沧桑，建筑十分牢固。现在人们习惯把方岩五峰景区内的重楼、丽泽祠、学易斋、五峰书院等岩洞建筑统称为“五峰书院”，为浙江省重点文物保护单位。
【蕺山书院】蕺山位于绍兴老城区东北方。据《嘉泰会稽志》记载：
“《旧经》云：越王嗜蕺，采于此山，故名。”又因晋代大书法家王羲之曾居于此山南麓，即现在的戒珠寺，故又称“王家山”。早在南宋孝宗乾道年间，理学大师韩度曾在此结庐讲学。到了明代，韩度讲学处办起了蕺里书院。明崇祯四年（１６３１年），明末大儒刘宗周罢官归里，又在蕺里书院原址办“证人书院”，亲自讲学，被尊为“蕺山先生”，从学者２００余人，成为“蕺山学派”的发端之地。清康熙五十五年（１７１６年）知府俞卿从优人处赎回书院房屋，重建书院，名为“蕺山书院”，内设“刘念台（刘宗周）先生讲堂”和“刘宗周祠”。此后书院持２００余年不衰。其间，着名学者蒋士铨、全祖望、李慈铭等曾在书院任山长或主讲。清末，书院改为山阴县学堂，徐锡麟曾执教于此，范文澜、陈建功、许钦文等先后在此就读。书院旧址现在蕺山公园内，园内有卧佛殿、北天竺、蕺山书院、唐五代摩崖石刻、董其昌生祠题记等遗迹。
【西泠印社】位于西湖孤山西南侧，总面积５７５８平方米。清光绪三十年（１９０４年）由浙派金石篆刻家叶舟、丁友仁、王福庵、吴石潜等人发起建立，并共推一代宗师吴昌硕为首任社长，以“保存金石、研究印学”为宗旨，是我国研究金石篆刻艺术历史最悠久、影响最大的着名学术团体，现已发展为一个国际性的研究印学、书画的民间艺术团体。印社建筑多建于晚清及民国时期，虽无传统的纵横格局，但亭台楼阁皆依山势而建，层层叠连，井然有序，３３处园林建筑星罗棋布于孤山西南坡，可谓处处有文章，遍地皆学问，堪称江南园林之佳作。主要建筑有柏堂、竹阁、仰闲亭、还朴精庐等，均挂匾披联，室外摩崖凿石林立，名人墨迹触目可见。
【文澜阁】位于杭州市西湖区孤山路２５号浙江省博物馆内。占地１７００平方米，建筑面积５５２平方米。文澜阁所在地原为清康熙行宫，雍正五年（１７２７年）改为圣因寺，乾隆十六年（１７５１年）分为二，复建行宫，乾隆四十九年为收藏《四库全书》建成文澜阁。清咸丰十年、十一年（１８６０、１８６１年）因太平军起义，部分建筑遭到损坏。光绪七年（１８８１年）重建，增建二宫门等。民国年间，在文澜阁西侧建图书馆馆舍，书与阁分离，民国二十二年（１９３３年）由当时浙江省省立博物馆负责对文澜阁进行测量和维修。书阁室内三层，外观两层。阁前假山园池，池中植巨石，名“仙人峰”。阁东有御碑亭，阁西为游廊，四周围墙环绕，有垂花门可供出入。文澜阁是中国历史上最着名的藏书建筑之一，也是十分典型的南方园林建筑。
【天一阁】位于宁波市区月湖之西天一街。由明代兵部右侍郎范钦创建于明嘉靖四十年（１５６１年），为我国现存最早的私家藏书楼。范钦（１５０５-１５８５），字尧卿，号东明，鄞县人，明着名藏书家。嘉靖十一年进士。知随州，升工部员外郎，出知袁州，累官兵部右侍郎。在任期间，留心典籍，兼收并蓄，告归后建天一阁藏书楼。广购海内异本，搜罗金石，刊布奇书，抄己所未有之书，多收经说、方志、典章及前辈诗文集之未经传世者，为浙东藏书家第一。书阁为硬山重楼，面阔进深各６间，前后有廊。楼前是“天一池”，引水入池，蓄以防火。清康熙四年（１６６５年），范钦的曾孙范文光又绕池砌叠假山，筑亭架桥，栽花植竹，使之颇具江南私家园林风貌。乾隆三十七年（１７７２年），诏修《四库全书》，范钦八世孙范懋柱进呈藏书６３８种，乾隆命测绘天一阁房屋、书橱款式，兴造南北七阁，收藏《四库全书》。天一阁自此闻名全国。１９９３年重修时把宁波孔庙的尊经阁迁来后院，并集中安置了宁波宋至清的碑刻，称“明州碑林”。天一阁现藏珍版善本达８万卷，以明代地方志和登科录最为稀珍。现所建天一阁博物馆是以藏书文化为特色，融社会历史、艺术于一体的综合性博物馆，占地２６万平方米。总体布局由藏书文化区、园林休闲区、陈列展览区三大功能区组成。近年来先后新增中国地方志珍藏馆、银台第官宅博物馆、麻将起源地陈列馆等。中国地方志珍藏馆收藏全国各级各类当代地方志６７３０多册，占总数的８０％以上；银台第官宅博物馆展示了清代官宦人家的家居艺术和建筑艺术，获“２０００年度全国博物馆十大精品陈列最佳创意奖”；麻将起源地陈列馆以三维空间展示麻将的起源及与宁波的历史渊源。
２００８年，被列入首批全国古籍重点保护单位。
【玉海楼】位于瑞安城关道院前街，晚清着名学者孙衣言、孙诒让父子的私家藏书楼，创建于清光绪十四年（１８８８年）。坐北朝南，三面环河，前后两进，重檐硬山顶，左右回廊。初建时藏书八九万卷，现藏书３万多册，以多名家批校本、多瓯郡乡邦文献和孙氏父子手批手校本闻名于世。
西侧为百晋斋和孙诒让故居。故居前有三进，后有花园，建于１８８９年。建筑群总占地面积８０００平方米，各单体间设有高大风火墙，集藏书楼功能、浙南优秀民居特点和私家园林风范于一体。
【嘉业堂藏书楼及小莲庄】位于湖州市南浔区南浔镇栅万古桥西。为我国近代最着名的私家藏书楼之一。嘉业堂藏书楼建于１９２０年，因清帝溥仪御匾“钦若嘉业”而名。创办者刘承干，字贞一，号翰怡、求恕居士，晚年自称嘉业老人，吴兴（今湖州市）南浔镇人，近代着名的藏书家和刻书家。嘉业堂占地１５万平方米，其中藏书楼占地１３５０平方米，建筑面积１９５５平方米。是一栋平面呈“回”字形的两层楼房，由两进厅和厢房组成，中央是天井，外设四周廊。藏书以明版为多，方志为珍，不乏海内外孤、珍本。小莲庄占地１７万平方米，建筑面积１２５０平方米。始建于清光绪十一年（１８８５年），建成于民国十三年（１９２４年）。光绪十四年在园内增建刘氏家庙。光绪二十五年在家庙西侧创立刘氏义庄。小莲庄西部为建筑，东部为园林。园林以池为中心，形成以山为主的内园和以水为主的外园。小莲庄的建筑是同时代、同类型中的上乘之作，从装修到陈设无不充满了人文气息和艺术魅力。
【灵隐寺】亦名“云林禅寺”。我国佛教禅宗十刹之一，全国汉族地区重点寺院之一。在杭州市西湖区西北灵隐山麓，前临冷泉，面对飞来峰。
东晋咸和元年（３２６年）印度僧人慧理见飞来峰叹道：“此天竺灵鹫山之小岭，不知何年飞来，佛在世日，多为仙灵所隐。”遂面山建寺，取名“灵隐”。清康熙帝南巡时赐名“云林禅寺”。五代吴越国时，曾两次扩建，当时有９楼、１８阁、７２殿，僧徒３０００人，房屋１２００余间，盛极一时。以后迭经兴衰，毁建多次，现存寺院系１９世纪重建。１９５６年和１９７０年，曾两次大修。寺有东、西两山门，与天王殿并列，天王殿居中，两山门旁列。
殿内正中有弥勒佛坐像，弥勒背后有木雕韦驮立像，两像均置于精工雕镂的佛龛中。韦驮像传为宋代遗物。两旁分列四大天王坐像。殿后过园林登石砌月台，有大雄宝殿，与天王殿在同一中轴线上。殿高３３６米，高甍飞宇，琉璃瓦顶。正中有金装释迦牟尼像，高９１米，庄严肃穆，结跏趺坐莲座上。像后有影壁，上齐殿顶。壁背面塑有观音立鳌鱼背上，前有善财童子，向观音做膜拜状，四周山岩云水之间，满缀鸟兽神怪。殿周沿壁环列“二十诸天”、“十三元觉”的金装像。殿左有联灯阁、大悲阁。大雄宝殿前有两座八角九层石塔，天王殿前有两座石经幢，均为五代吴越国末期遗物。寺前古木苍郁，荫天蔽日。冷泉流经处筑有春淙、壑雷、冷泉诸亭，清幽静谧。