在下达圣旨之前，李世民已经广泛征求过群臣的意见。总的来说，朝堂上分为针锋相对的两派。房玄龄、褚遂良持反对意见。
然而，军方的声音却大不相同。特别是李世绩甚至还翻起了旧账：“当初薛延陀进犯大唐，魏徵就站出来阻拦陛下讨伐他们。结果呢？直到今天他们还为祸甚深，我们不能再犯当年的错误了！”
这个时候，李世民正生着魏徵的闷气呢，当即连声说：“对，正是如此！只是朕当时怕堵塞言路，才勉强听了他的话！”
褚遂良见状，当即哑口无言。谁都知道，他那时是魏徵的人。现在追究起了老上司的责任，自己还敢多说什么呢？此外，房玄龄也被堵了回去，因为当年劝谏的人中，也有房玄龄一个。李世绩倒是很聪明，没有直接点房玄龄的名，却敲山震虎，闹得房玄龄十分没趣。
于是，事情就这样定了下来，接下来便是紧锣密鼓的出征准备工作。为此，少不得又要进行一番人事调整。八月二十六日，李世民任命刘洎为侍中，原代理中书侍郎岑文本为中书令，太子左庶子、中书侍郎马周暂时代理中书令。九月，又任命谏议大夫褚遂良为黄门侍郎，参与朝政。这样，刘洎、岑文本、马周三人先后进入了宰相班子。
不久之后，李世民甚至准备将刚因为李泰的事受到贬斥的韦挺再度提拔起来，负责门下省事务。说起来，这也算是对武德末年李世民重组东宫系统之策略的再次模仿。只不过，这一想法在马周的强烈反对下不得不搁浅了。原来，马周以前做监察御史的时候，曾受到过韦挺的鄙薄和轻慢，如今已经贵为宰相的马周有了机会，自然要卡韦挺一把。可见，官场实在是一个瞬息万变的地方，凡是以意气或才干骄人的人，迟早都会遭遇到荆棘，甚至是死亡的威胁。相比起来，马周还算得上是厚道人了。房玄龄正是由于深谙这个道理才十数年如一日地低调做人。只是，此番被火速提拔上来的刘洎却没闹明白，很快，他便为此付出了代价。
与刘洎相比，刚刚做了中书令的岑文本要冷静得多，他升职后毫无喜悦之色，反而成日里忧心忡忡。其母问起缘由，岑文本担心地说：“我以前没有立过大功，又不是勋臣贵戚。突然被提拔到如此高位，不一定是好事呀！”
岑文本还有一点没有提及，那就是，他曾经属于魏王一系。如今虽然能得到皇帝信任，转为晋王效力，然而别的臣子真的容得下自己么？自己是否又能像魏徵那样有不可缺少的才干和好运气，在此起彼伏的攻讧中屹立不倒？
贞观十九年（645年）年初，准备工作一切就绪，征讨高句丽的大军正式开拔。临行前，李世民安排房玄龄全面代替自己处理朝中事务，一应政务有自行决断之权。之所以放心将整个大后方交给他，不但因为他这么多年的忠心不二，更因为此前李世民多次故意贬斥和罢免他的宰相职务，他都能够做到不动声色。可见他是真正能信得过的宰相之才，能够托付重任。正因为如此，后来有人密告房玄龄将会谋反作乱时，李世民竟然问也不问便下令将密告者腰斩示众，以安其心。这种信任，不是一两天所能得来的，而是长期培养磨砺出来的。反观侯君集，不禁让人为之叹惜！
此外，为了防止萧瑀继续给房玄龄添乱，李世民又以洛阳地处天下之中，位置重要为名，调萧瑀前去镇守。本来将萧瑀放在辅佐班子里是为了能够在将来起到互相制衡的效果，不过如今应对外敌，内部须得团结一致，不可再生波澜。
贞观十九年三月，大军开到定州（今河北省境内），李世民命太子留在这里监国，以高士廉代行太子太傅职责，以刘洎、马周、太子少詹事张行成、太子右庶子高季辅等协助辅佐，参掌机要，而长孙无忌、岑文本和杨师道等会同李世民出征。老实说，李世民这样安排是煞费了一番苦心的。首先，从长安到洛阳，再到定州、前线，是一字长蛇阵。环环相扣，互相照应，可以有力地保证李世民不在国中之时，不至于出什么乱子，重蹈隋炀帝覆辙。其次，不把太子留在京城，而是放在离李世民最近的定州，一方面是想锻炼他，另一方面，也是怕若太子留守京城，一旦有不逞之徒乘机胁迫太子作乱，那便会造成极其严重的后果。
不过，这也说明李世民对于后方其实存在某种程度的忧虑。平素里大大咧咧惯了的刘洎却体察不到李世民的心情。临行前，李世民特意嘱咐刘洎说：“你辅佐太子，责任重大，国家安危都寄托在你身上了啊！”说起来，这不过是李世民勉励臣下的常见言词而已。刘洎受宠若惊，拍起了胸膛：“请陛下放心，要是有大臣胡作非为，我一定立刻诛杀他！”这番话不由得让李世民心里咯噔一下——要知道，在你上面还有高士廉，在高士廉上面还有我孩儿李治呢！你又有什么权力来随意行使生杀大权？这个刘洎看来不是能成大器的人啊！
然而军情紧迫，实在是没有时间来重做安排，以免造成不必要的猜疑和误会，李世民也只好带着满心的不高兴上路了。
此番出征，有一个人自始至终都伴随在李世民身边。这个人，就是长孙无忌。他除了已有的司徒和太子太师的头衔，如今又多了一重身份，那就是摄门下省侍中。
所谓摄，就是暂时代理的意思。先后担任过该职务的有高士廉、王珪、魏徵，还有那个不让李世民省心的刘洎。而如今，他们都不在身边，但制度还是要保证的，因此这个专司检查封驳皇帝诏命的差事，就落到了长孙无忌的肩上。当然李世民心里很清楚，不是特别要紧的大事，长孙无忌是绝对不会跟他唱反调的。这个安排，也能在非常时期尽量减少政令下达时的君臣摩擦。
当然，让他陪在李世民身边可不是用来做花瓶的。那么，李世民此时留长孙无忌在身边的用意何在？这可是让所有人都意想不到的“重用”！
在此番出征中，长孙无忌扮演了一个“总参谋长”的角色。其他的将领都是严格按照李世民的指示和命令行事，而长孙无忌呢，他大多数时间都在和李世民讨论战略谋划，颇有点运筹帷幄的风范。
然而，光是这样还不够。此前，在大唐统一天下的时候长孙无忌没打过什么仗，也没听说他曾为取胜出过什么像样主意，此番他却要领兵出征，独立作战了！
此前，李世民并不大看得起长孙无忌的军事才能，半年前，还曾说他“总兵攻战，非其所长”。然而这一回，却赶鸭子上架。李世民这样做有何用意呢？
无他，作为日后朝廷辅政的首席大臣，长孙无忌若是没有那么一星半点军功的话，就很难镇得住李世绩、薛万彻这一帮大小军头，那他也就成了一个跛脚首辅，不利于日后政局的平衡过渡。因此，在这场战役中，长孙无忌是来镀金的。
不过，光凭躲在帐篷里出几个主意可不够，这班军头有那么容易被糊弄吗？皇帝陛下久经战阵，一个没提刀上过战场的文人给他指手画脚出主意，能让人信服吗？要知道，贞观初年评点论功时，尉迟敬德那一干武将对排在功劳簿上的房玄龄等人就够不服气的了，不过，那时靠李世民的威望还压得住他们的不满。李世民以后不在了，谁来给这班文臣撑腰？武人的势力一大，局势便危险了。
看来光出出主意还不行，是骡子是马还得拉出来遛遛才知道。那么，拨给长孙无忌一队兵，让他到可有可无的地方晃上一圈，打几个无关紧要的敌人，再抓几个俘虏，看来是最稳妥的办法了吧。
不行！还是那句话，大家都是聪明人，别指望玩小聪明能糊弄过去。
所以，长孙无忌这回不战则已，一亮相，就要打一场漂亮仗给大家看。
有人会问：陛下，您给长孙无忌的压力是不是太大了？让一个几乎没怎么上过战场的人一来就要打大仗、打漂亮仗，岂非强人所难？若他败了，如何是好？
李世民相信，人在压力面前会拿出自己的全部实力，才会成长得更快。李世民一直是这样要求自己，同时也是这样要求臣下的。只有顶得住朕给你的压力，才配接过朕给你的权力。
于是，这一次，长孙无忌和李世民都站在了巨大的压力面前——攻克高句丽重镇辽东之后，大军围困了安市城，高句丽集结十五万大军前来增援，而此时围城的唐军有多少？
只有三万！
此番出征的十万大军，除去四万水师，再去掉沿途留守分派的人马，就只剩这么点了。
面对五倍之众的敌军，李世民是这样安排的：先以小股部队扰袭，然后故意示弱。待找到敌人破绽之后，再出击。
李世绩领一万五千人为“正兵”，吸引敌人前来攻打。
李世民领四千精锐为预备队，驻跸于山上，等待最后的时机发动总攻。
而长孙无忌呢，他则要率领万余人为“奇兵”，绕过崎岖漫长的山地，自敌军后方突然出现，给敌人造成毁灭性的打击。
这是一次前所未有的巨大挑战：长孙无忌必须克服黑夜行军、地形崎岖等不利因素，顺利地把这一万人及时带领到部署之地。同时，他还必须自行判断，在最适合的时机下令发起攻击，晚了不行，早了也不行！
长孙无忌没有辜负李世民的期望，他顺利地完成了任务。当长孙无忌的军队在高句丽战阵后出现的那一刹那，敌军阵脚顿时陷入一片混乱之中。李世绩见状，不失时机地下达了总攻击的命令，敌军立刻土崩瓦解，溃不成军。
这一仗最后的结局是，高句丽十五万大军全军覆没，大唐大获全胜。
长孙无忌用实绩向众位将军证明：我长孙无忌，在你们军人面前，完全是有实力说得上话的！你们以后还敢小看我吗？
比起另一位也担任领军大将之职，见到敌军竟然被吓得动弹不得的家伙——张亮，长孙无忌赢得了大部分将领的敬佩。