在与国际商机公司正式签订合同之前，盖茨、艾伦曾对能否完成这么巨大的工作而忧心忡忡，但最终还是决定冒险以求一逞，盖茨无时无刻不感到来自国际商机公司的压力。
微软公司创立之后，它一面开发自己的软件，另一方面也积极收购其他公司的软件，其中收买DOS操作系统是它最成功的一次举动，为其以后的发展奠定了基础。但在收购保密工作方面却存在一定的问题。盖茨认为，首先是基尔代尔的公司违反了没有公开宣布的协议。这个协议规定，微软公司要固定为搞语言，而数据研究公司固定为搞操作系统，是基尔代尔自己，早就违反了这个协议。
但事实早已证明这个协议的使命已经结束，比尔·盖茨在搞DOS，如果基尔代尔也插手BASIC，那就等于插手到比尔·盖茨的要害处。尽管CP/M-86没有按时完成，但基尔代尔还是不打算承认失败。他知道微软公司的DOS交易，也见过86-DOS，他和律师格里·戴维斯对IBM指出，微软公司有侵权行为，因为微软的DOS和CWM有许多相似的方面，可能超越了合法的界限。在这种情况下，数据研究公司这种略带法律行为的暗示，引起了不爱打官司的IBM的注意。
然而，基尔代尔并没有起诉这个庞大公司的意思。他只想将CP/M-86提供给IBM的个人电脑。而且IBM的负责人埃斯特里奇也答应了这笔交易，比尔·盖茨也很快就发现，自己是在和一个他认为已经将要消失的竞争者分享IBM机器。
微软公司的态度变得强硬起来，他指责IBM损害了他们公司的利益。6 月25 日，保罗·艾伦采取了第一步行动，彻底获得西雅图电脑公司的86-DOS。在给罗德·布洛克的信中，艾伦提出以3万元美元购买86-DOS所有的版权，加上负责许可微软的8086大汇编程序和连接器。
布洛克建议把所有版权卖给微软公司，版权费共为15 万美元，加上许可微软语言的权力作为折扣，微软公司将得到对所有硬件制造商的独家许可86-DOS 的权利。经商议，比尔·盖茨和鲍默尔、艾伦基本同意花15万美元，但具体意见有些不一样。盖茨认为，救生艇伙伴公司在整个事情上办不了那么漂亮，并且他还夸张地说15万美元会使公司破产。
保罗认为有5万美元左右就可成交，但比尔·盖茨坚持这个交易的原则是彻底购买，不仅仅是个许可。他提醒保罗记住罗伯茨的例子，因为一个不完整的协议，会发生许多冲突。盖茨强调说，更好更利索的方式就是彻底拥有整个产品。
盖茨知道必须很快结束这一交易，否则让布洛克明白一切，就不知道将会达到一个什么样的价钱。
鲍默尔亲自将文件送交西雅图电脑公司的办公室，匆匆完成了交易。比尔·盖茨一直催促他快些。他们知道，IBM个人电脑和MS-DOS，而不是86-DOS，将在7 月底的一个什么时间突然宣布。比尔·盖茨想让协议在被IBMPC宣布之前签署完毕。
7月20日终于签署了最后的协议，以5万美元的补充付款，将86-DOS完全卖给了微软公司，这比原定的价钱便宜了不少。同时，西雅图电脑公司保证它的系统是自己独有的，如果日后微软公司因为这个DOS侵犯了谁的版权，西雅图电脑公司将以这笔交易额作为赔款。
当然，作为交换，西雅图电脑公司也得到了免费版权许可，即允许它对硬件生产商许可软件使用，而且它还可以得到一个微软公司提供的多用途DOS改进与加强版的制作，费用只是开发费用的一半，另一半由微软公司负责，还能以大约当时一半的价格得到微软语言许可。布洛克感到这个办法很合理，他做硬件贸易，现在可以让出自己的操作系统了，他还看到自己将拥有很大的胜过任何其他硬件制造商的优势，因为不必为许可付钱。他对微软语言的交易，意味着他可以给那些语言定价。
这是微软公司的最廉价的购买，也是世界上最便宜的交易。花了总共7.5万美元，第一个协议2.5万美元，第二个协议5万美元，微软公司就拥有了全部的DOS。盖茨以如此的低价拥有全部的DOS系统，不仅为其与IBM 公司的合作奠定了基础，也为其以后的发展奠定了基础。
微软公司能够壮大到如此规模程度是同比尔·盖茨善于抓住机会的胆略与勇气分不开的。在其每一次遇到机遇时，总能死死抓住，直到把机会变成壮大自己的现实才罢手。在同国际商机公司的合作中更能体现这一点。
为了及时联系，还设立了一套电子通信装备，通过它了解在帕卡拉顿和西雅图的电脑交换情况，通讯内容来来往往瞬息可达。盖茨本人也常到帕卡拉顿去。设计工作的时间安排得很紧。软件必须在1981年3月底之前设计完毕。国际商机公司设计小组的领导不断地将时间安排表给比尔·盖茨看。
“所有的安排表实际上表明，我们还没有动手就晚了三个月了。”盖茨 说。
合同的第一项订货是操作系统。由于所有的语言都要能适用于这一操作系统，所以程序编制人员就得了解工作中的技术细节。盖茨雇用了蒂姆·帕特森来协助设计操作系统。盖茨负责将原为老型阿尔塔机设计的微型软件公司的BASIC软件改进为能用于国际商机个人电脑上的软件。盖茨和保罗·艾伦及另一名微型软件公司的人员一起从事这项工作。微型软件公司的其他程序编制人员也为各种语言转换的工作忙得不亦乐乎。
在与国际商机公司正式签订合同之前，盖茨、艾伦曾对能否完成这么巨大的工作而忧心忡忡，但最终还是决定冒险以求一逞，盖茨无时无刻不感到来自国际商机公司的压力。在这以前，盖茨通常是回家与父母一道共进晚餐，但有一天，他对母亲说：“妈妈，你有可能将近半年见不到我的面了。”盖茨整天呆在房间里忙于工作，几乎达到足不出户的地步，除了飞往佛罗里达外。
盖茨同国际商机同事（通常情况下是同埃斯特里奇）经常商讨电脑的设计工作。盖茨指出，苹果电脑的开放型设计为其取得成功起了不可估量的作用，由于微型软件公司的唯一硬件产品软件卡是该公司的王牌产品，因而盖茨对设计公开的好处深有体会。由于埃斯特里奇本人有一台苹果E型电脑，所以从一开始就倾向于公开性设计。在盖茨的促进下，国际商机公司一反以往的设计规格保密的做法，对首次生产的个人电脑采用了开放型系统的设计。
商机公司正在精心换掉自制的礼服而穿上业余电脑迷与平庸辈们批量生产的“服装”。这具有革命性的举动是盖茨的杰作。这一点从根本上让国际商机公司改变了自尊自大的形象，而且令它在个人电脑领域独霸一时。
盖茨放弃了微型软件公司与数据研究公司一度存在的相互依存的关系，便潜心研究，设法使MS-DOS 成为整个电脑行业所使用的操作系统。他极力主张在操作系统的设计上也采用开放型。他列举的理由是很有说服力的：如果人们知道了操作系统的技术细节，便能很容易为其设计软件，艾伦也同意了这种看法。
尽管完成软件设计压力十分大，但盖茨对自己和自己公司的能力却信心十足，因为公司并不缺乏程序编制方面的天才。但，不知国际商机公司何时宣布制成这种电脑。还有就是商机公司会不会放弃这项计划？盖茨知道，国际商机公司进行着的众多技术项目的研究中，只有极少项目最终能搞到底。
盖茨感到压力很大，为此而感到心神不定。自取得了帕特森的SCP-DOS之后，盖茨的首要问题便是让它能够在IBM提供的样机上运行。这个任务将由奥尼尔完成，这意味着假如帕特森的东西与IBM的样机不能合作，其他人的改进工作将成为无米之炊。奥尼尔倒是不错的棒小伙，立下军令状之后，整个年度都泡在机房里，甚至圣诞节也没有回家，终于不辱使命。但是，此时的比尔·盖茨并不忧心于技术，而是法律。
自从艾伦对西雅图电脑制造公司说过有一家大公司将通过他们购买操作系统后，微软取得了SCP-DOS的使用权，这对西雅图公司并非是一件坏生意，因为西雅图公司还可以将这种操作系统转让给其他客户。因为这是一种不排他的转让。帕特森与卡洛克对此协议没有异议，而且觉得值得签。这下，一块石头落地了，轮到盖茨欣喜若狂了。他并没有走出他的办公室来见卡洛克，而是等着艾伦将协议送过来，隔着窗帘他可以看见被他玩弄于股掌之间的可怜人，他们还自以为捡了个大便宜！从此微软有自己的操作系统，决定性的一步就此迈开。