中国企业要成功运行EAP，除了在不同企业采用不同的服务模式之外，还必须建立起一套符合中国国情的EAP服务运行机制。借鉴国外企业应用EAP服务的先进经验，结合我国企业的实际情况，应建立适合中国企业实施EAP服务的四级运行机制：对企业员工进行心理健康状况调查，加强对企业心理健康知识的宣传教育，对企业管理者和员工进行有针对性的培训，对员工进行心理咨询与治疗。
对企业员工进行心理健康状况调查
据中华英才网对6000多人的网络调查统计显示，有58.6%的受调查者出现了轻微的工作厌倦，对工作失去热情；有26.5%的人出现了中度工作厌倦，需要借助休假或跳槽进行调整；还有9.1%的人表示极度厌倦工作。三者相加高达90%以上的受调查者厌倦工作。员工心理疾病呈逐年上升趋势，是员工所受到的职场压力、社会压力与个体压力综合作用的结果。正是这些压力的持续交互作用，导致了当前中国企业员工心理健康状况的极度下降。
目前，企业员工的心理问题是由破坏性的恶性心理压力造成的，这种恶性心理压力分为两种，一种是超出个体适应能力极限的过度压力，多数与竞争因素相关；另一种是长期静止、单调乏味或感觉剥夺等引起的缺乏自我实现的匮乏压力，多数与静止和公平因素相关。无论是过度压力还是匮乏压力，都会造成员工心理焦虑、情绪不良、恐惧担忧等心理病毒。
因此，要急需解决企业员工心理健康问题，企业对员工开展及时、专业、有效的EAP服务有重要的现实意义。然而，不管是在什么样的企业中，不管该企业实行的是哪一种EAP服务模式，如果不先对员工的心理健康状况进行调查分析，不查找员工心理问题的成因，是不能制订出专业的EAP实施方案的。
企业对员工心理状况的调查是EAP有效开展的前提，旨在发现和诊断员工心理健康问题及其导致的因素，并提出相关建议，减少或消除不良的组织管理因素。对员工进行心理调查的方式有很多种，其中最为常用的有问卷调查法、访谈法、网络调查法等。对于采用整合模式的国有大中型企业和采用联合模式的中小型企业而言，不宜采用访谈法。因为整合模式和联合模式里的EAP服务机构都包括企业内部的人员，用访谈法去调查员工时会降低员工的安全感，影响调查结果的真实性，不利于EAP服务的进行。问卷调查法和网络调查法对员工而言相对更加安全，员工可以在卷面和网络上吐露自己的真实想法，为EAP工作人员提供详细、真实的信息。
EAP服务机构通过对员工的心理健康状况进行调查，对企业及员工存在的问题形成一个初步诊断，并设法判断这些问题产生的原因，同时提出相关的建议，减少和消除容易影响员工心理健康的不良因素，优化人力资源管理机制和组织环境。这有助于尽早、及时地发现可能出现的员工问题，实现人力资源管理从事后的处理转向事前的预防。
加强对企业心理健康知识的宣传教育
目前，尽管心理问题已经产生了许多不良影响，但是人们对心理问题的关注以及人们的心理健康意识仍然十分缺乏。因此，我国的EAP服务不应当也不可能仅仅只是解决具体的、现实的个人问题，还应当帮助员工提高心理健康意识，帮助企业消除或减少导致心理问题的原因，预防心理问题的产生，这就需要我们加强对企业心理健康知识的宣传教育。
宣传心理健康知识的方法是多种多样的，如发放心理健康知识手册和卡片；张贴心理健康知识海报；建立心理健康知识网站；开设心理健康知识讲座，讲授保持心理健康的方法，等等。通过印制一些宣传海报、宣传卡片、宣传手册、笔记本、杯子、笔等小巧实用的宣传品，让员工在日常生活中很方便地获得相关的知识。知识讲座也是一种很生动的形式，容易使听众受到触动。在讲座的过程中，还可穿插一些小活动，比如放松、团队游戏等，不但能够增强听课效果，还会让员工一开始就对EAP有一个轻松愉快的印象，更有利于人们对EAP的积极关注。
通过多种形式的宣传，树立员工对心理健康的正确认识，提高员工心理健康和自我保健意识，鼓励遇到心理困扰时积极寻求帮助，而不是消极自闭。由于各种宣传手段的成本不同，对于采用联合模式的中小型企业而言，更适合用手册、卡片和海报等成本较低的方式进行；对其他大型企业而言，可以采用其他一些更先进的手段，让更多的员工了解心理健康的重要性。
对企业管理者和员工进行有针对性的培训
为了保证EAP服务的实施，不仅要加强企业心理健康知识的宣传和教育，还要对企业管理者和员工进行有针对性的培训，提高企业管理者和员工缓解自身压力、协调工作与生活等方面的技能。
培训的内容主要有：对企业管理者进行心理咨询技能、方式和方法的培训，让管理者学会心理咨询的理论和技巧，在工作中预防和解决员工心理问题；对员工开展压力应对、积极情绪、工作与生活协调、自我成长等专题的培训或部门咨询。通过压力管理、挫折应对、保持积极情绪等一系列培训，帮助员工掌握提高心理素质的基本方法，增强其对心理问题的抵抗力。管理者掌握员工心理管理的技术，能在员工出现心理困扰时，很快找到适当的解决方法。
这种培训适合于在采用外设模式的大型民营企业和采用整合模式的国有大中型企业中进行，因为给大型企业员工培训的费用要远远低于给员工提供EAP服务的费用。因此，采用培训的方式来提升员工的心理调节技能，有利于节省开支。对中小型企业而言，这样的培训费用过高，应该指派EAP服务联合机构里的成员参加培训，然后再由他们将培训的内容分别以讲座或报告会的形式传达给企业员工。这样既可以使心理健康知识在员工中得到了普及，又节省了培训费用。
通过对企业管理者和员工进行有针对性的培训，企业管理者对员工的心理健康更重视了，员工也懂得了调整自己的情绪状态，企业的心理健康氛围更浓了，这为企业实施EAP服务创造了条件。
对员工进行心理咨询与治疗
企业通过调查研究，了解了员工存在的心理问题，并根据企业的实际情况制订了EAP服务的实施方案。而对员工进行心理咨询与治疗，就是实施EAP服务方案的具体过程和核心内容。
员工心理咨询是指由专业心理咨询人员向员工提供个别、隐私的心理辅导服务，以解决他们的各种心理和行为问题，使他们在工作和生活中能够保持较好的心理状态。由于员工的许多职业心理健康问题与家庭生活方面的因素有关，因此这种心理咨询服务通常也面向员工的直系家庭成员。
对员工进行心理咨询与治疗的方式是多种多样的，可以根据员工个人的喜好或是企业的实际情况进行调整，但是无论企业采用的是哪种服务模式，在对员工进行心理咨询与治疗时，都离不开开通热线电话、建立网上沟通渠道、开辟咨询室等三种形式。前两种方式是员工与EAP工作人员通过电话或网络来沟通信息，它的优点是保密性很强，咨询费用低；缺点是咨询的成效慢，咨询的时间长。这两种方式比较适用于采用联合模式的中小型企业。第三种方式是员工与EAP工作人员面对面的交谈、咨询。其优点是咨询效果明显，收效快；缺点是咨询费用高。这种方式比较适用于采用外设模式的大型民营企业和采用联合模式的国有企业。在多数情况下，以上三种咨询方式是交叉使用的。对员工而言，哪种方式效果好就接受哪种方式的服务。
通过对员工进行心理咨询与治疗，员工在EAP工作人员的帮助下找到了自己产生困惑、压力过大、情绪不稳的原因，并接受了EAP工作人员提供的保持健康心态的建议，使员工通过心理咨询改变不合理的信念、行为模式和生活方式，重新恢复健康、正常的精神状态，避免员工的心理问题向心理疾病转化，提高企业人力资源的实际质量。