1.心系交大
邓旭初离休了，但他的心仍在牵挂着交大，想着交大，关心着交大。
1986年是上海交大90周年校庆，这年5月，邓旭初与新任党委书记何友声再次进京，邀请国务院副总理万里同志出席交大校庆活动。1986年6月8日，上海交通大学举行建校90周年庆祝大会，学校上下一片欢腾，喜气洋洋。邓旭初在大会上致词，他回顾了交大的历史，尤其是交大7年改革所取得的辉煌成就。他说：“历史是现实的殷鉴。上海交大重新崛起的史实告诉我们，一所基础和实力受到削弱的学校，仍然可以一跃而起，加入先进行列。如果说这里有什么秘诀的话，那就是走改革之路，靠改革取胜。当前改革潮流犹如长江奔流，浩浩荡荡。我们要坚定不移地执行党的十一届三中全会以来的路线、方针、政策，擦去障眼的尘翳，认清目前改革正处于新旧体制相互对峙的特定局面，抓住时机，继续深入地进行改革，努力创造条件去缩短新旧体制转换的过程，为推动高等教育体制改革，为把上海交大办成世界一流大学的高等学府贡献力量！”
1995年，在上海交大百年校庆前夕，邓旭初把自己对“文革”后上海交大通过改革重振雄风的切身感受和经验汇集成册，写成《忆上海交大重振雄风》一书，由东方出版社出版，作为他献给交大百年校庆的一份厚礼。为了表达对交大改革和发展的关心，书中对什么是世界一流大学、办世界一流大学要开拓财源、办一流大学要有高水平的教师、管理改革的关键、人事制度等问题提出了自己的真知灼见。
离休后，邓旭初经常到美国、欧洲小住一段时间，探望女儿。每次出去，他总是走访参观所在地的大学，看到大学他就想起了交大。他对交大的感情实在是太深了。
2.为沈锐同志树碑
为了革命和教育事业，邓旭初操劳一生，步入老年，经常忆起往日的岁月。他感到最为歉疚的，是没有给妻子沈锐立块石碑。
沈锐这位忠贞的共产党员，为了革命出生入死十几年，受尽了集中营内敌人百般摧残和折磨。1957年却被划成右派，“文革”中又遭受迫害，致癌而逝。“文革”后，在全国平反冤假错案过程中，沈锐也得到平反。但邓旭初仍感有愧于这位英雄的妻子，心中一直不能平静。
2000年，在沈锐逝世33年之后，3位女儿与他们的丈夫携带自己的子女，回到上海。邓旭初一家特地将这位令人敬佩的好妻子、好妈妈，迁葬于上海福寿园。新墓落成，邓旭初回忆往事，不禁老泪纵横：“沈锐啊，沈锐！你现在可以安息了！”老人还写词一首，刻于墓碑上，其辞曰：
腥风血雨迷雾，豺狼蹂躏生灵苦。十六少女，山河誓复，毅驱鞑虏。鏖战方酣，箕豆又煎。五载练圄，犹等闲生死，从容笑骂。烈火间，闲如素！
霜剑风刀凛冽，零落损，馥香弥烈。不求富贵，惟愿党晓，肝胆亦赤。遭际是非，坚心似铁。伤心死别。看红旗猎猎，改革开放，英雄无觅。
邓旭初并非诗人词家，也非骚人墨客，而是一位新四军的老兵，高校改革战线上冲锋陷阵的带头人；同时，他又是沈锐最知心的丈夫，最了解自己妻子是一位刚烈、忠贞、坦直的共产党人，对她的含冤而死，痛入骨髓。35年过去，弹指一挥，岁月如流水，可以洗去人心头的创痛。但是，邓旭初时年已82岁，这35年岁月，却未能洗尽他心底这一悲愤与痛苦。所以，这篇《水龙吟》词，不论工拙；这份挚爱真情却非任何骚人墨客的感情所能代替。
三个女儿，大毛、二毛、三毛，与她们的家人一起，在沈锐墓前，奉上花篮，深情祭奠这位善良的母亲。
沈锐同志安息吧！
……
2001年，邓旭初迎来了他的80大寿，全家团圆，亲朋祝贺。邓旭初抱着外孙女，露出了甜蜜的笑容。他感慨万千，欣然作诗《沁园春》——八旬抒怀，来表达他此时的心情。
沁园春八旬抒怀八旬老翁，
志效虬松，
突兀节棱。
随中华志士，
献身革命；
斗顽驱日，
抗美援邻。
伟业宏丰，
吾诚渺小，
沧海一粟何足称！
且休论，
有几多贡献，
已尽力心！
离战场转育人，
勉风骨应如铁铮铮。
遵小平教导，
改革开放。
抑扬贬褒，
等闲声名。
夹缝求伸，
乌纱何惜？
突破重关补缺莹。
今放眼，
看春临大地，
漫山芳芬。