有贺也为自己安排好了结局，他怕万一自沉不成被抓去当战俘，就让一个士兵找来一根绳子把自己绑在罗盘仪上，几个士兵也想学有贺的样子，他的副官则拔出指挥刀，准备切腹。有贺一脚把他踢翻，狂暴地大叫：“八格！年轻人要活下去效忠天皇，快跳海！”成群的士兵，有的穿着救生衣，有的抱着一块木块，匆忙奔向大海。
“矢矧”号已经沉没、护卫的8艘驱逐舰4艘沉没、其余也均受创。下午2时25分，“大和”号终于横倒在海面上，主桅杆上的太阳旗也落入水中。弹药舱中特制的1170发巨型炮弹只打出了3发，随着舱体的旋转，这些炮弹开始猛烈撞击，只要有一发爆炸，就会引起全舰爆炸，“大和”号将粉身碎骨。
战舰在急速下沉，就在没入水面的那一刹那，海面形成一个深50米的巨大水窝，许多附近的落水者也被吸了进去。紧接着，弹药舱在水下爆炸，溅起的水柱直冲云霄，几乎要吞噬低空掠过的美机。
“大和”魂归海底，带着伊藤、有贺以及2496名舰员。作为日本海军联合舰队的象征，排水量6.8万吨的巨型战列舰“大和”号的沉没标志着联合舰队的彻底覆没，同时也宣告了巨舰大炮主义的彻底破产。
由于美军反潜兵力雄厚，警戒严密，日本海军在冲绳海域活动的11艘潜艇未获任何战果，反被击沉8艘。至此，日本海军对冲绳岛守军的支援均告失利。
4.日本军疯狂虐杀国民
日本第32军往喜武半岛撤退的时候，野战医院处理伤员的暴行令人毛骨悚然。
位于丰见城的日军野战医院在6月初接到撤退的命令。命令要求还能够走动的伤员一律随军撤退，剩下的一律自杀或杀掉，不能投降当俘虏。军令如山，必须无条件服从，有的伤兵强忍疼痛坚持自己走出去。最后剩下七八十人，实在不能动弹，只好就地毙命。
卫生员对他们说，自杀的办法有3种：手榴弹自爆、氰化钾注射、枪杀，希望每个人提出自己的意见。有50多人希望注射药针；有16人希望用手榴弹自爆；还有身体严重伤残完全不能动弹的人，要求把他们抬到外边，吸一口新鲜空气以后再枪杀。
希望注射氰化钾的人，头部向北，并排躺在一起。大型注射器中抽满了氰化钾毒液，当室外杀死伤兵的枪声响起来的时候，便依次把毒液注射到伤兵的静脉中去。这些人相继寂静地停止了呼吸。然后是手榴弹的爆炸声。
据“冲绳战役回忆会”编辑的《冲绳战和和平教育》一书所载，这样处置的重伤兵共计约有1万人。
冲绳岛战役不仅日军官兵伤亡惨重，那些被强迫入伍的学生兵更是苦不堪言，无谓地做了炮灰。
据战后统计，冲绳县县立一中强制征兵600名，死266名；县立二中征兵248人，死165名；县立工业学校征兵130名，死106名；县立农村学校征兵170名，死66名；县立水产学校征兵45名，死28名；那霸市立商业学校征兵115名，死92名；私立开南中学征兵81名，死70名。才十几年的生命就白白断送了。
当时被征集的学生兵大田昌秀侥幸未死，战后在他所著的《铁血勤皇队》一书中，把学生遭受到的苦难如实地记述了下来。这些十几岁的学生，既被征兵，却又享受不到正规兵的待遇，饱受欺凌。从他写的文章中可以看到日本兵残暴的程度：
美机在天空盘旋着，我立刻跳到道路左下方去，看见一条横向地壕。入口处有一个简单的土墙，是防暴风用的，一看就知道是老百姓挖的防空壕。我绕过土墙正要躲避空袭时，一支枪口对准我的胸膛：“这不行！这个混蛋，谁让你进去的？你没有看见这个吗？出来！这个讨厌的学生！”一边申斥，一边又接着骂：“什么东西！这算皇军士兵吗？算神兵吗”他正骂着的时候，“嗒、嗒、嗒……”像割竹子那样脆响的飞机扫射声连成一片。旁边没有一点可藏身的东西，我不由自主地又朝地壕入口处移动了一步。那位士兵又吼道：“你这小子什么也不懂吗？再乱跑我就不饶你了！你没有看见那边滚的东西吗？”我向枪口指的方向一看，前方四五米远的山芋地里，一位老人仰身躺着，焦黑的衣服剥落，裸着胸膛，屁股、大腿旁边浸满浑浊紫黑的血。一看到这情景，我胸中满腔的愤怒消散开来。“还有这样的事？不不，不会的。”我努力想排去脑中的疑惑，摇晃着脑袋。可是，事实确实是那样，现实是无情的，我的头发昏、发胀起来。“你这小子，没有看见那里滚动的东西吗？学生，你这个东西！”那个士兵警告、训斥的语调我走到哪里也无法忘掉，脑子里充满不安和疑惑……
冲绳的女学生们都在接受了护士速成训练后被派到野战医院去服务。其中冲绳师范学校有187名女生加入到姬百合部队，死去117名名；县立第一女中的98名学生中有86名死在姬百合部队；县立第二女高中（护兰部队）10名学生中死1名；县立首里女高中（水仙部队）83名学生中死50名；私立积德女高中（积德部队）57名学生中死50名；私立昭和女高中（梯梧部队）67名学生中死54名。这些青年女学生被军国主义恶魔无情地剥夺了青春和生命。
冲绳战役中，日军对当地老百姓的虐待和暴行更是令人发指。
大田冒秀的《铁血皇队》中记叙，当时，青壮男丁被强迫当兵，她去当“挺身队”队员（慰安妇）。其余只要有一点劳动能力，无论年龄大小，一律征集去当防卫队员。留在家中的只有老人和小孩。战事恶化以后，从老百姓挖的防空壕中赶出老人和小孩，把他们的存粮夺去归部队所有，居民连逃跑的地方也没有，稍微移动一下，立即遭到辱骂，被军队认为是障碍物，动不动就威胁说：“让敌人抓住枪毙你！”还有的认为是敌人的间谍，惨死在守备军的刺刀下。如果有谁稍微说一点牢骚话，就被视为是投敌分子而杀掉，仅美军还没有登陆的3月中旬，就有3个人当了日军的枪靶子。
真壁地方的防空壕，据说离美军最近。有一天，一对夫妻慌忙收拾东西时，三四岁的小孩哭叫起来，让3名日本士兵听到了，马上把刺刀对准孩子的父母，说：“孩子不许哭，让敌人听见了怎么办？”逼着他们把孩子扔进水池里淹死。抛入水池中的孩子从水里冒出来，想往岸上爬，日军士兵过去按住小孩的脑袋直至断气。喜武的山城防空也曾出现过小孩哭闹的情况，日军硬逼着孩子的父母给孩子注射毒药致死。
日本历史研究会编的《太平洋战争史》中还记载了这一悲惨情况，在庆良间列岛，军队为了保证军需用粮，勒令非战斗员交出食粮，以死报国。渡嘉敷村的325名村民接受海上特攻队赤松嘉次队长的命令，互相残杀死亡。座间味村358名村民接到驻军长官梅津少佐停命令后，集体自杀。
佐木隆三著《虐杀冲绳居民证词记录》中有这样一段话：
“有一位叫着首里的人，从南方回来讲了他看到的日军战败的情况。部队知道他向周围居民谈论战局后，便诬指他是美军间谍，让搞杂活的妇女们拿刺刀把他刺死。这些穿防空服的妇女们一面流着眼泪一面扭过脸，十五六个人围着他乱刺，把他杀了。”
南风原村有一座“日兵虐杀墓”，原来是当地居民挖的避难壕，被日军部队强行霸占，日军说居民妨碍了他们作战，一律起了出去。新垣太郎忍不住发脾气，军队马上拿枪对准他。他说：“要开枪就开吧！”日军士兵立即开枪打死了他，还枪杀了他的妻子及其他人。
日军还诬陷当地某些有声望的人是间谍，拟定了一份死亡名单，有计划的加以杀害。本部国民学校校长照尾忠英（当年54岁）首当其冲，被诬为间谍后，用刺刀挑开肚子，内脏流到外面，痛苦一天一夜后死去。
日军对当地居民的虐杀事件有据可查的有60件。
5.没有庆祝的胜利
美国陆军第24军在冲绳南部地区的进攻非常艰难。因为日军在冲绳岛的主力就部署在南部，而且他们充分利用悬崖峭壁、深沟高谷等险峻地形构筑起坚固隐蔽的防御工事。牛岛满中将把全部兵力用于依托工事进行坚守防御，给24军造成了很大困难。所以，美军进展极其缓慢。
4月13日，美国总统罗斯福在佐治亚州温泉逝世。美军上至上将司令，下至普通士兵，无不感到震惊和悲痛。尼米兹以太平洋战区全体官兵的名义向罗斯福夫人发去了唁电。日军则乘机大做文章，大肆散播题为“美国的悲剧”的传单，以鼓舞日军的士气。
在大本营的一再命令下，牛岛终于发动了反击。日军先以敢死队员怀抱炸药采取自杀攻击方法炸毁美军坦克，再对失去坦克掩护的美军步兵发起冲锋。美军在日军的冲击下，节节败退，死伤将近5000人。此后，凭借后续部队的重炮和海空优势火力才将日军的攻势遏制。
4月19日，美24军3个师从那霸以北约6.5公里处发动大规模进攻。5时40分，海军的6艘战列舰、6艘巡洋舰和8艘驱逐舰先对日军阵地进行猛烈炮击。6时，陆军27个炮兵营对日军阵地进行了长达40分钟的炮击，共发射了1.9万发炮弹，接着海军和陆战队的650架飞机也对日军阵地实施了航空火力准备，投下大量的炸弹和凝固汽油弹，在这一系列猛烈持续的火力打击后，24军发起了进攻。但日军利用坑道有效躲避美军的轰击，当美军地面部队展开攻击时，他们才出来迎战，因此美军的攻势一次次被瓦解。
日军充分显示了其顽强的战斗意志。每一个山头，每一个碉堡，每一个坑道，甚至每一块岩石，美军都必须经过多次血战，才能夺取下来。激烈的战斗整整进行了5天，美军的进展总共也不过数米！为了改变这种局面，美军将陆战1师和陆战6师调到南线加强正面进攻。当美军推进至日军主要防线前的4500米处，双方陷入僵持。
4月24日，美军投入了新型的喷火坦壳和重型坦克，终于克服了日军的顽强抵抗。这些坦克冒着日军的枪林弹雨，碾入日军的战壕，冲入日军的阵地。喷火坦克将凝固汽油射入日军隐藏的山洞和坑道，日军终于支撑不住，其防线逐渐被突破。
牛岛随即在夜色有烟雾掩护下，悄然组织部队有序地撤往下一个防线。因此，战斗发展成这样一种模式：日军光是凭险死守，接着美军在猛烈火力动摇下取得突破，日军后撤到下一道防线内死守，如此周而复始，日军的防区逐渐缩小。美军终于5月27日攻占了那霸，并继续向冲绳岛的首府首里城前进。
5月31日，美军突破了日军核心防御地带首里防线，终于取得了重大进展。海军陆战队攻入了已是一片废墟的首里城，第10军司令巴克纳满心喜悦，以为冲绳首府被占领就意味着战斗即将结束。但他的想法大错特错了，日军困兽之斗反而更加疯狂！
牛岛率余部后退了约10公里，退到岛南端精心准备的最后防线。这是由两座山峰构成的天然屏障，地势崎岖险峻，日军充分利用地形，筑有25处隐蔽的炮位和坑道工事。牛岛决心以此为依托，战至最后一兵一卒。因此，日军抵抗丝毫没有减弱。
美军主要依靠喷火坦克开路，不少浑身着火的日军冲出阵地，抱住美军士兵同归于尽。美军每前进1米依然非常艰难。而对日军更加疯狂的抵抗，美军还以更猛烈的炮火。美军的海陆空密集炮火对日军据守的岛南部几平方公里地区进行了最猛烈的轰击，日军虽然只剩下3万余人，大炮也损失过半，弹药更是所剩无几，但仍是死战不退。
6月17日，美军又投入预备队——陆战2师。该师一个团在冲绳岛南端的喜屋武岬附近登陆，协同正面和侧翼友军围歼日军。此时，日军的局热已十分被动，遭到全歼只是时间问题。为了避免不必要的伤亡，巴克纳用明码电报和广播向日军劝降。牛岛根本不为所动，以枪炮射击作为答复。
6月23日凌晨4时，牛岛知道美军即将占领他所在的摩文仁坑道。他脱下军装，换上和服，与身边的参谋一一干杯。喝完了最后的诀别酒，他剖腹自杀。他的参谋长也追随他剖腹自杀，还有一些军官也随之集体自杀。至此，日军有组织的抵抗才告平息。而零星日军的抵抗仍在继续，清剿残余日军的工作一直持续到6月底。
与这些死心塌地的军国主义分子不同，日本普通士兵在战役进入尾声后，有相当多的人放下了武器，这在以前是非常罕见的。6月15日前，2个半月的战斗中美军总共才俘虏日军322人，而从6月15日到6月30日，日军不仅有个人或小组投降，甚至还有成建制的部队在军官带领下投降，仅海军陆战队第3军就收容日军投降人员4029人。
冲绳战役从3月18日美军航母编队袭击九州开始，至6月22日冲绳岛战斗基本结束，共历时96天，其中在冲绳岛上的激烈战斗就有82天之久。日军包括“大和”号战列舰在内的16艘水面舰艇和8艘潜艇被击沉，约4200架飞机被击落击毁，日军在冲绳岛上的约10万守军，除9000余人被俘外，其余全部被歼，冲绳岛的平民有7.5万人死伤。美军有32艘舰船被击沉，368艘被击伤，其中有13艘航母、10艘战列舰、5艘巡洋舰和67艘驱逐舰遭到重创，损失舰载机763架，阵亡l.3万（陆军4600人，海军4900人，海军陆战队344人），受伤3.6万人（陆军1.81万人，海军4900人，海军陆战队1.36万人），另有2.6万人的非战斗伤亡。
冲绳岛战役是美军在太平洋战争中伤亡最大的战役，因此，英国首相丘吉尔认为冲绳战役将以史诗般的战斗列入世界上最激烈、最著名的战斗，而流传后世。
鉴于在战役中所付出的惨重伤亡，美军没有举行大规模的庆祝活动。
冲绳战役和前不久进行的硫磺岛战役，使美军深深明白，如果要在日本本土实施登陆，美军将面对无法估计的疯狂抵抗。美军参谋长联席会议认为，在日本本土登陆，美军将会付出100万人的伤亡。因此，促使美国最终决定对日本使用刚刚研制成功的原子弹，以尽快结束战争。