联合国安理会有关伊拉克问题目前已明显形成“战”与“和”的两大阵营。美、英积极鼓动对伊动武，并得到西班牙和保加利亚的紧密追随；而法、德、俄、中、叙利亚五国则主张“继续核查”。为了确保能在安理会可能进行的第二轮表决中得到九票支持、使其对伊战争合法化，美英煞费苦心地争取另外六个尚未正式表态的非常任理事国，它们是安哥拉、喀麦隆、智利、墨西哥、几内亚和巴基斯坦。
为了能随时了解“中立六国”对伊问题的态度波动，美国不惜使用“卑鄙的手段”，对它们驻联合国的代表进行秘密窃听和监控。正是国家安全事务助理赖斯最早提出这一计划，而其他一些官员持反对立场，因为他们认为此举一旦被曝光将对美国的形象造成严重的影响。然而，急于得到联合国授权进行武力“倒萨”的布什政府最终还是决定不择手段，通过加强对“中立六国”等国家驻联合国代表的监视，以期“知己知彼”、掌握别国的动向并及时做出应对措施。
2003年3月20日：美军对巴格达发动“有选择性”的突袭，目标锁定萨达姆政权的“极高层首脑”。布什宣布开战的时候，背景是两张照片，一张是他的两个女儿，一张是他的夫人和爱犬。布什希望借此表达他重视家庭、尊重人性的一面，从而和美国宣称的解放伊拉克人民的目标相呼应。
美国投入的兵力不到上次海湾战争的1／3，一开始就开展地面进攻，长驱直入，21天就拿下了巴格达。但是军事上的胜利并不意味着真正意义上的胜利，国际社会对美英发动伊拉克战争的理由不断提出质疑。
美国发动对伊拉克战争的理由就是它拥有大规模杀伤性武器。但美军进入伊拉克后，未搜寻到任何违禁武器。美国官员仍确信这些武器将会出现。但如果找不到它们，布什总统发动战争的理由将被严重削弱。尽管美英部队发现了化学战防御装备，以及被用做解毒剂的阿托品储备，但目前尚无有关发现非常规武器的大型仓库或制造设施的公开报道。美国武器专家戴维·凯伊曾随同上百位专家一道前往伊拉克进行搜索，他向美国国会汇报说：“萨达姆政府并没有制造大规模杀伤性武器的迹象，我们也未能发现大量生化武器。”2003年6月，拉姆斯菲尔德讲了一句非常像中国的绕口令的话：“没有证据并不等于证明没有。”
5月1日，小布什乘战斗机飞到从海湾返航的“林肯”号航母上宣布主要战斗已经结束。伊拉克战局没有平静下来，美国在伊拉克问题上仍然面临不少问题。反美示威不断，针对美军的袭击不断。美军在伊拉克遭袭击死亡的人数已经超过了战争中死亡的人数，整个伤亡人数也已经超过了1991年海湾战争中的伤亡人数。军事打击征服人心难，改造一个社会就更难了。
在对伊拉克的军事行动取得胜利之后，伊拉克重建开始。依照德国、法国和俄罗斯要求，联合国应该对伊拉克的战后重建工作负主要责任。美国副国防部长保罗·沃尔福威茨声称，出于国家安全因素，法国、德国等反对美国攻打伊拉克的国家将被排除在伊拉克重建合同之外。赖斯对此也是口径一致：“为解放伊拉克而流血献身的美国及其盟友接过重建‘主角’的任务是理所应当的。”美国国防部将接手战后重建以及慈善资助的监督工作。
毫无疑问，美国军队陷入了伊拉克的战争泥塘中。拉姆斯菲尔德无法控制眼前的混乱局势。2003年10月，小布什任命国家安全事务助理赖斯为新成立的“伊拉克稳定小组”的负责人，主导伊拉克问题时，白宫称，赖斯负责组建“伊拉克稳定小组”是为了加快伊拉克重建步伐。
拉姆斯菲尔德抱怨白宫在组建“伊拉克稳定小组”问题上没有和他商量。赖斯则向新闻界强调说：“国防部和国防部长拉姆斯菲尔德仍然是伊拉克重建的领导者。”尽管赖斯是美国总统布什最亲密的顾问之一，但她却低调处理自己在决策方面发挥的作用。她说：“我的任务是协调政策。我既不会控制政策，也不会执行政策。”不过在这一点上赖斯也是受到了争议的。此外，强硬的“鹰派”和温和的“鸽派”之间也出现了摩擦，一边是来自拉姆斯菲尔德手下的中央情报局，一边是为美国外交政治负责的鲍威尔的国务院。
12月14日，美国宣布萨达姆被逮捕。就在萨达姆被捕后数小时，外国记者下榻的坐落于巴格达市中心的巴勒斯坦饭店附近便发生了爆炸事件。战胜恐怖主义似乎还是件很遥远的事：一个接一个的自杀爆炸，一桩接一桩的自杀袭击，伊拉克陷入了越来越令人绝望的恐怖袭击狂潮之中。
拉赫曼·道斯利在巴格达美国一处设施附近引爆了卡车炸弹。他给他的家人留下了一份最后的声明，他相信自己是听从真主的召唤，为了圣战而献身：“给我的母亲、父亲、妻子和兄弟……我不会丢下你们，使你们受到惩罚，我只是听从真主对圣战的召唤。这个国家遭到攻击、侵占和掠夺，异教徒们充斥在我们的家园和圣殿之内，亵渎我们的宗教，当我目睹这一切，我怎么还能愉快地生活呢如果我们在地球上不能再见面，我们将在天堂重逢。”
没有人是天生的凶手，他们大多被压迫，信仰和人格受到了侮辱，背井离乡，生活无依无靠。在弱势的情况下，他们绑上人体炸弹，到美军驻扎的地方引爆自己。人们用这样极端的方式来反抗的时候，一定是什么地方的政治出了问题。
2003年6月26日，在伦敦国际安全战略研讨会上，作为美国外交政策发言人的赖斯在向全世界宣布美国的胜利：“在盟友的帮助下，我们已经铲除了两个有史以来最残忍的政权。恐怖主义的主要避难所已被剥夺。一半的领导力量已经被抓捕或是处决，其余的也将永远逃亡。许多国家已经携起手来，拿出更强有力的措施遏止恐怖势力的增长。他们已做出决定，对朝鲜和伊朗的挑衅做出反应。”
一边是血与火的战争，无数家庭的破碎，而在白宫的安全事务助理康多莉扎·赖斯，依旧身着得体的职业装、戴着庄重的首饰和涂抹着精致的深红唇彩，在向全世界宣布美国的正义和军队的必要性。在她的身上看不到失态，看不到内心的斗争，好像没有什么事情可以让她惊慌失措。2004年4月8日，美国国家安全事务助理赖斯不得不接受关于“9·11”前后反恐政策的听证。自从莱温斯基接受公开质询的那场轰动全美国的听证会以来，还没有哪一场有关华盛顿的电视听证会被如此多的美国人迫切地期待着。现在，另一位女人将站在听证席上面对众多记者的照相机和摄像机举起手宣誓，在那一刻这个女人也许在某种程度上与当年同样站在听证席上的莱温斯基没什么不同，因为她的证词同样具有左右美国总统命运的威力。
一直以来，美国媒体描述国家安全事务助理赖斯的报道中充斥着大量“卓越”、“极富才华”、“无与伦比的智慧”等等这些赞美之词，她被很多人看作是美国最受人崇拜的女性。然而如今，这个一度被媒体称为“神圣不可侵犯”的女人，现在却要出席一场也许将决定她自己和现任总统小布什命运的听证会。
2004年4月8日，美国西部时间早上8点，赖斯身穿典雅的职业套装、佩戴昂贵首饰，平静地端坐在国会作证者的座位上，接受美国“911”调查委员会的非友好的、刨根问底式的质询。“911”事件发生后，美国民众特别是受难者家属强烈要求政府彻底调查事件真相。于是国会在2003年决定成立一个专门的独立调查委员会。该委员会由10人组成，共和党和民主党各5人，主席由总统任命，副主席由国会的民主党领袖任命，其他成员包括前政府官员和专业人士，他们均与现政府无直接联系。调查委员会成员享有查阅所有相关文件、质询当事人以及向任何级别官员发送传票的权力。委员会成员虽均为在野人士，但与美国政府都有渊源，党派属性分明。双方各占半壁江山，体现出党派政治的现实对比。
为揭开“911”事件真相，调查委员会展开了深入广泛的取证工作，共查阅了250万页文件资料，问询了来自10个国家的一千二百多人，举行了12次公开和两次非公开听证会，众多美国现任和前任政府官员接受了该委员会的质询。2月11日，曾为美国联邦调查局工作的翻译西贝尔·埃德蒙接受“911”调查委员会长达三个小时的秘密质询。她在华盛顿向委员会证明，在2001年春夏期间，美国联邦调查局内部就有一种言论，称恐怖分子将在几个月后使用飞机发动袭击。
3月22日，美国国家安全事务顾问赖斯在《华盛顿邮报》撰文指出，布什政府一直致力于打击基地组织，但赖斯表示：“我们事前没有获得有关恐怖分子准备使用飞机袭击美国本土的情报。”埃德蒙指责赖斯可耻地撒谎。3月24日，美国白宫前反恐高级顾问理查德·克拉克在“9·11”事件独立调查委员会作证时，主动向人民一口咬定布什政府上台后一直忽视反恐，一心只想打伊拉克，未能有效防范“911”事件的发生。克拉克所有指控的焦点都集中在了担任国家安全事务助理的赖斯身上。而在他最近出版的畅销书《针对所有的敌人》中，克拉克更是不惜笔墨对赖斯进行了大量尖锐的批评，他认为身居要职的赖斯根本没有意识到基地组织对美国国家安全威胁的严重性。在书中克拉克甚至提到，当他第一次向赖斯汇报有关基地组织的情况之时，赖斯看上去似乎对基地组织一无所知。“911”恐怖袭击事件对美国人造成巨大心理冲击至今难平，因此克拉克的上述言论在白宫简直掀起一场地震。
赖斯、布什政府其他官员和国会的共和党议员迅速发起了一场“消毒”行动，对克拉克的动机提出了种种质疑，共和党阵营甚至提出要解密克拉克以往在国会秘密作证时的证词，以证实他在“说谎”。然而，地震已然发生，由共和与民主两党议员和司法人员组成的国会特别调查委员会不可能对克拉克的指责视而不见。3月29日，委员会主席、共和党议员托马斯·基恩正式要求赖斯出席公开的国会听证会，并在作证之前发誓她所说的每一句话都是真的。基恩提出这一要求很正常：一是既然克拉克说反恐在“911”事件之前不是布什政府安全政策的突出重点，而布什政府又竭力否认，那么，赖斯作为负责国家安全的主管就有责任配合委员会继续调查；二是连国务卿鲍威尔都上了公开的国会听证会，赖斯也没有理由拒绝。基恩强调，当前最重要的是“让能公开的都公开”。
白宫和赖斯本人都不想直接参加国会的公开听证会，因为公开作证中说的所有话都将记录在案，并由国家公共政策电视频道实况直播。而听证会拥有半数民主党成员，当然不会放过这次机会来狠狠地利用克拉克的证词“修理”布什政府，甚至提出让布什政府更加难堪的问题。在这种情况下出席国会公开听证会，等于是让个性极强、能言善辩但又在事实迷雾中的赖斯“百口莫辩”。更重要的是，公开听证会要宣誓答问的每一句话都是真实的，否则，一旦发现有任何不实之词，根据美国法律是要追究“伪证”罪的。
在经历了一段时间的僵持后，赖斯于3月30日不得不同意前往美国国会参加“911”独立调查委员会的公开听证会，接受“911”事件独立调查委员会的公开质询。赖斯曾于2月7日就布什政府的反恐政策问题接受了调查委员会部分成员的非公开质询。此后，赖斯以国会无权要求她作证为由，一直拒绝委员会要她接受公开质询的要求，招致调查委员会和国会两党议员的不满与批评。因此，与其说赖斯顶不住舆论的压力而同意，倒不如说是白宫顶不住压力，把赖斯推上了“火线”。
站在布什国家安全事务助理这个重要职位上，赖斯也许是所有美国人中唯一能够阻止“911”恐怖事件爆发的人。作为美国国家安全事务助理，赖斯可以获得来自情报、外交政策、国防以及法律事务机构等等这一切共同承担反恐任务机构的信息。在国家安全问题上，小布什对赖斯相当倚重，无论是处理“911”危机、打击“基地”组织，还是美国先后对阿富汗和伊拉克用兵，都有她的身影。
赖斯对于自己在国际事务问题某些领域里背景的缺乏非常清楚。2000年6月，当时作为小布什竞选顾问的赖斯在接受采访时曾经承认自己“一下子掉入了不熟悉的领域，不得不去理解以前并不在自己研究和擅长领域之内的世界问题”。而在那些她所不熟悉的领域中就包括中东和南亚正在日益猖獗的恐怖组织问题。在赖斯刚刚上任国家安全事务助理的时候，一位长期与赖斯共事的白宫前高级官员曾经这样评价：“赖斯私下里一直在为自己在国际事务上没有积累一个非常广的背景而感到苦恼，尤其是在她所不熟悉的领域。自从赖斯上任后，在反恐问题上，她一直相当倚重自己的副手斯蒂芬·哈德利。
尽管在“911”恐怖袭击事件前几个月，已经有越来越多的情报显示基地组织有可能攻击美国，但是赖斯似乎仍然没有把反恐“放在心上”。赖斯在“911”恐怖袭击事件前所有的公开讲话都集中在了她所熟悉的正统外交事务政策领域，比如中美、美俄关系以及伊朗和伊拉克对美国造成的威胁等等这些问题上。