咸丰一收到张亮基的奏称，当即下旨，：著湖北巡抚衙门以下所有官署，限期迁至离长沙城八十里以外的地方建署，以利剿匪。
青麟当时是一无银子二无军饷，官员的俸禄都发不出。接到圣旨，又不敢不办。思虑再三，只好着人到长沙四处勘察地形，寻找现成的房屋。一班湖北官员，在长沙城外东游西逛了十几日，才在长沙城南八十里处发现了一个关帝庙。此庙何年所建已不可考，有房子几十间，虽破败却也能遮风挡雨。
青麟闻报大喜，慌忙厚起脸皮来找张亮基求援。
张亮基倒也爽快，当即著徐有壬从藩库里，拿出三万两的银子让青麟应急。
有这三万两银子打底，湖北巡抚衙门、藩司、臬司、提督府等大小官署，很快便迁到关帝庙。长沙这才有些安静。哪知湖北各级官署安顿下来不足十天，太平军却突然从武昌抽走重兵改攻他省，城里只留不足千人把守。青麟、琦善见有机可趁，当即率领各路人马疾驰武昌，竟毫不费力地将守城的太平军赶走。青麟、琦善连夜进城，给朝廷的捷报也于夜半时分派快马送走。
第二天，当青麟与琦善正督饬军兵、民夫修复衙门的时候，太平军却突然将城池包围。
一见中计，青麟、琦善二人不及多想，忙命城内所有军兵分三路突围。
所幸太平军刚刚合围，尚未安顿下来。经过好一阵厮杀，总算突出了一半人马。另一半清军，自然成了太平军的炮灰。
青麟头顶被一块弹片削掉一层皮，流了满脸血；琦善的胯骨被一颗流弹打穿，险些伤及命根子。
二人带着残兵败将，马不停蹄地跑出了湖北。
徐广缙原本也想跟进的，因为动作不速，未及拔营便接到了兵败的军报。
徐广缙在心里一连暗叫了十几声“侥幸“。
青麟督军刚走进湖南界，一道圣谕却迎面飞了过来：有御史奏参，青麟自到任以来，战局毫无起色。等因。青麟著即革职留任，著会同徐广缙限期规复武昌。钦此。
青麟惨遭大败，又被御史奏参，心头的那股无名火，腾腾腾便燃烧起来。不多几日，便病倒在床上了。
咸丰今天这样，明天那样，疑心病开始全面发作。
太平军二打武昌城，其实是杨秀清用的一个计谋。不过是想把清军的眼球吸引在这里。他的最终目标，是攻取虎踞龙盘的金陵城。
住进武昌城内的湖广总督衙门里，洪秀全心花怒放，已是相当满足。
但杨秀清却在这时提出了“舍要害，专意金陵，据为根本，然后遣将四出，分扰南北，即不成事，黄河以南，我可有已”的主张。
太平军在武昌停留了不足一月，即开始踏上了新的征程。
咸丰三年一月初二（公元1853年2月9日），太平军分两路撤出武昌。
石达开统帅第一路人马约十万余众，水陆并进，直扑号称鄂东咽喉的武穴镇；洪秀全、杨秀清、韦昌辉三人督带大队，约四十余万众，其中有美妇、俊女近万，船只一万五千余艘，押着大量金银、粮草、布匹等物，水陆并进，浩浩荡荡跟进。
太平军此次东下，战船如波，几乎覆盖了大半个江面；旌旗如云，赛似在半天空里开了个布匹行。造出的声势极其浩大。
清廷闻报，文武百官顿时慌作一团。
一连几日，主事王大臣、各部院侍郎、尚书等，被召进宫里议事。
很快，第一道圣旨先期飞速递向湖广总督徐广缙、湖北革职留任巡抚青麟、湖北提督琦善之手：命徐广缙督饬各营并原湖北提标残部、原抚标残部，会同青麟所部、琦善所部，速抵武昌规复城池，不得有误。
翌日，咸丰又给两江总督陆建瀛发加急圣谕一道：赏加陆建瀛钦差大臣衔，速率督标、两省抚标、提标，并安徽全省兵力，驰赴九江堵截“洪逆窜匪”，务期殄灭。
与此同时，咸丰又给广西提督向荣、提督衔总兵和春发去圣谕，命二人各率所部从后路追剿“洪逆股匪”。
太平军此时是前有堵截，后有追兵，咸丰自认为可以垫高枕头睡一个安稳觉了。哪料到，祁寯藻偏在这时上了一篇参折。
这篇参折一摆到咸丰的案头，刚刚安静下来的京师，又开始热闹起来了。
祁寯藻原本就是个很有文采的官员。折子的开篇先从长毛谈起，由长毛又谈到剿匪，由“剿匪”才切入主题：“粤匪狓猖”，朝纲不能偏废。奴才近得湖南万民折一份，控前礼部右侍郎曾国藩，在丁忧期间，横行乡里，以当朝重臣自居。有事传唤地方，稍有怠慢，轻则恶语相向，重则声称严参。地方惧于该员势力，只能喏喏连声，夜里经常咽泣，百姓常闻哭声。最近，该员更是插手地方政事，尤以一次擅杀无辜五十四人最著。激起民愤，湖广震动，物议喧腾。剿匪事急，朝纲尤不能不振。奴才窃以为，按祖宗家法和我大清律例，丁忧官员胆敢插手地方政事者，杀无赦。奴才查前礼部右侍郎曾国藩，种种劣行属实，决非妄传。我皇上宵旰焦劳，臣子却胆玩国法，实属丧尽天良。
折子用三句话作为结束语：不杀曾国藩不足以振朝纲；不杀曾国藩不足以得民心；不杀曾国藩不足以荡平“粤匪”！
祁寯藻在折中用了排比句式，藉以体现文章的整齐。
塞尚阿被革职拿问后，祁寯藻在军机处的排名由第二位跃居到第一位，大学士的排名也很靠前。此时祁寯藻上的折子咸丰还是很看重的。
咸丰把祁寯藻的折子看完，这才猛然想起来，他三个月前，恍惚收到过一篇万民折，好像说的就是这件事。但因太平军攻势甚猛，他本想等局面好转再批办，哪知就忘了。
他放下祁寯藻的折子，开始在案头翻检三个月前见过的那篇万民折，竟然在一个角落里找到。
他一时大喜过望，忙将案上的折子全部推到一边，专看这篇万民折。
看着看着，咸丰又有些疑惑了：万民折上说的是，县衙门一次斩杀五十四人，系曾国藩怂恿所致；祁寯藻的折子却说，是曾国藩擅杀无辜五十四人，以此激起民愤，致使湖广震动，物议喧腾。
祁寯藻到底是根据什么上的折？
思虑再三，咸丰提笔便在祁的折子边上批了“著湖南巡抚衙门作速查明此事，据实复奏。张亮基秉心公正，谅不肯稍涉偏徇，代人受过。”
放下笔，他喝了一口茶水，忽然又觉着批得有些过轻，太便宜曾国藩了。便再次拿起笔，先把前面批的一行字涂掉，又在下面写上了“著湖南巡抚衙门作速查明此事，如所参各节属实，派员速将曾国藩革职，押往京师问罪！”写完后读了一遍，这才觉着笔误了：曾国藩已经丁忧，没了官职。便马上将“革职”二字涂掉，下面标上“丁忧”二字，这句话就变成了：“著湖南巡抚衙门作速查明此事，如所参各节属实，派员速将曾国藩丁忧，押往京师问罪。”
咸丰认为大功告成，把笔再次放下，一读，反倒不通了。他一生气，再次用重墨涂掉。
“这个曾国藩！”咸丰嘟囔了一句：“凡涉及到他的事情，没有一回顺利！”
他当即宣六弟恭亲王奕、大学士文庆、军机大臣祁寯藻、周祖培等进宫。
几位重臣依次跟进，叩头、请安。咸丰不耐烦地挥了挥手。
咸丰把祁寯藻的折子递给恭亲王道：“这个曾国藩，气死朕了！”
恭亲王双手接过来只看一眼便道：“启禀皇上，递折子的人当斩哪。”
咸丰一愣，急问：“你如何这般讲话？”
恭亲王用手点着折子道：“回皇上话，按我祖宗立下的规律，递折奏事，页面务须干净、整洁。有私涂乱抹者，杀无赦！”话毕，把折子双手举过头顶道：“请皇上明察！”
祁寯藻偷偷看了一眼折子，猛丁发现页面已被涂抹得不成样子，用的还是朱笔；他印象中的折子，不仅页面干净，而且特别整齐。祁寯藻的脸上登时淌下汗来。
咸丰狐疑地接过折子一看，竟然也跟着大吼一声：“祁寯藻！”
祁寯藻浑身一抖，扑嗵一声便跪到地上，边磕头边道：“奴才有天胆也不敢如此！这定是有人成心要陷害奴才！——请皇上明察！”
咸丰这才想起上面的污迹是自已涂抹的，便道：“祁寯藻，这件事朕就不怪你了——朕想问你，曾国藩丁忧期间，插手政事这件事，你是怎么知道的？是他杀了人，还是指使家人干的？”
祁寯藻道：“谢皇上恩典，回皇上话，曾国藩这件事，奴才是从湖南查到的。”
咸丰点了点头，随口问文庆：“文庆啊，你说说看，是把曾国藩就地处斩好呢，还是押解进京好啊？”
文庆答道：“回皇上话，奴才以为，皇上怎么做都有道理。——不过奴才斗胆问一句，湖南巡抚衙门的折子怎么说？张亮基总该有个主意吧？”
咸丰一听这话，马上问祁寯藻：“对呀，不是文庆提醒，朕还忘了问你。张亮基的折子呢？”
祁寯藻一愣：“回皇上话，张亮基没有上折子呀？张亮基为什么上折子呢？——皇上明察，是曾国藩丁忧期间插手政事，不是张亮基呀！奴才以前给皇上递过一个来自湖南的万民折呀，皇上莫非没有看到？”
咸丰皇帝愣了愣：“湖南的万民折朕看到了。朕是在问你，你是怎么知道的？万民折只是说他干预地方，并没有说他杀人。”
一句话，把个祁寯藻问呆了。
恭亲王这时近前一步道：“禀皇上，皇上明察——。”
咸丰忽然摆了摆手道：“祁寯藻，你今年多大了？”
祁寯藻老老实实地回答：“回皇上话，奴才今年还差三天就六十岁了。”
咸丰一听这话，不由自言自语道：“怪不得！六十岁的人了！祁寯藻啊，朕想问你一句：张亮基没上折子，你是怎么知道曾国藩丁忧期间，不经请旨，便一次斩杀五十四人？这还了得吗？——是湖南进京的人对你说的？究竟是——我大清立国至今，哪个丁忧期间敢这般胆大？你是先皇的老臣，你可不能闻风而奏啊！你是军机大臣，不是御史啊！”
文庆道：“御史也不能闻风而奏啊！”
祁寯藻早已吓得面如士色，边磕头边道：“奴才下去就着人去湖南详查，奴才下去就着人去湖南详查！”
恭亲王这时道：“在皇上面前，原没有我说话的份儿。可祁寯藻啊，你这事做得也太离谱了！还没着人去查．就先给皇上上了这么一个折子——真是！”
众大臣下去后，咸丰又传肃顺进宫。
肃顺进宫后急忙跪倒请圣安，咸丰也不让他起来，劈头就问：“肃顺，你保举曾国藩帮办湖南团练，你知不知道，他丁忧期间都干了什么？不仅插手政事，还杀了人啊。这还了得吗？要不是祁寯藻给朕上了折子，朕至今还被蒙在鼓里！”
肃顺全身一震，想了想道：“皇上，奴才想知道，张亮基怎么说？”
咸丰道：“张亮基要有折子，这事不就好办了吗？”
肃顺问：“奴才斗胆问一问，祁寯藻是怎么知道这事的？”
咸丰一笑道：“肃顺啊，都说你脑袋瓜子好使唤，朕看是把你夸儍了——祁寯藻是怎么知道的这事，朕要是知道，还用问你吗？狗奴才，讲！”
肃顺跪着，一声不吭，屋里只有那口夷人进贡的西洋钟嘀咕嘀咕地响。
好半天，咸丰才道：“肃顺哪，你怎么不说话呀？你哑巴了？”
肃顺道：“回皇上话，依奴才看，祁寯藻这事做的，可是太荒唐了！曾国藩的秉性，皇上比所有人都清楚——奴才大胆认为，这里面另有隐情。请皇上明察。”
咸丰反问：“照你所说，是有人污陷曾国藩？”
肃顺答：“回皇上话，奴才也不知道。皇上不妨给张亮基发一询旨，看张亮基怎么说。”
咸丰想了想道：“肃顺啊，今天青麟给朕上了个折子，说武昌目前因兵力不足，怕粤匪回窜，请求再从别省增调五千人。向荣与和春，现在也在连称兵力不足。朕今天问了问柏葰。柏葰奏称，能调过去的兵力都调过去了。你给朕说说，这兵力不足，就没有办法可想了？洪逆的人马是哪来的？我大清的兵呢？”
肃顺想了想道：“回皇上话，奴才以为，还有一个力法，不知行不行得通。就是从蒙古调铁骑。”
咸丰愣了一下，道：“肃顺哪，除了这么办，就，没有别的法子了？”
肃顺答：“回皇上话，恳请皇上宽限两天，奴才好好想一想。”
肃顺退出去后，咸丰当即传旨给军机处，命军机处往湖南巡抚衙门发询旨一道，就曾国藩丁忧期间干预地方以及乱杀无辜一事，著张亮基派员访查，据实复奏。圣旨又说：“张亮基秉心公正，谅不肯稍涉偏徇，代人受过”。
第二天一早，咸丰又突发奇想，让军机处往湘乡县衙发了一个火票，里面只写了短短的几句话：据武英殿大学士、军机处大臣祁寯藻奏称：前礼部右侍郎曾国藩，丁忧期间干预地方并乱杀无辜，云云。圣意知会该前侍郎。火票著县衙速转递曾国藩，不得有误。
咸丰推断，曾国藩接到此谕，无论怎样都不会无动于衷。
不久，湖南巡抚张亮基的复奏摆在了咸丰的案头。
张亮基先叩问圣安，又连连向皇上请罪。并言明：一接到谕旨，便连夜派员访查曾国藩丁忧期间干预地方、乱杀无辜这件事，半刻钟都未敢耽搁。张亮基接着奏称：巡抚衙门委员飞赴湘乡后，明察暗访，尚无确报；尽管按院衙门早在二十天前，就已收到湖南乡绅苟德存等联衔具名的万民折子，但因查无实据，不敢妄奏，容臣续奏。折子的后面，莫名其妙地附了苟德存等乡绅联名的万民折。
张亮基说了老大一篇，其实等于什么都没说。
咸丰把张亮基的折子摔到一边，开始耐心地等待曾国藩的折子。
“违离桑梓，十有四年，一旦归来，大父、大母之新阡已有宿草，慈容永隔，仅见一棺！功缌之戚，强半失旧，风鹤警报，讹言四兴。每痛哭慈帏，不知家之何以为家，生之何以为生也。幸严亲康健，命于九月中旬急谋葬事。尚思别营佳城，更竭诚信，以妥先慈之体魄。腊月十三，忽奉帮办团防之命，兼闻武昌失守之信，即于十七日驰赴省门。自知百无一能，聊贡此不敢畏死之身，以于城中父老共此患难！”
——摘自《曾文正公全集．书札．复邓小耘》