其时湖南永州镇一个叫做樊燮的总兵，此人贪婪残忍，多有不仁，声名狼藉，同城员弁兵丁对他多有不满。咸丰八年（1858年），骆秉章进京面圣时曾经参劾樊燮“私役兵弁，违例乘舆”，同时说樊燮还有多种恶迹，待查清楚后再行奏报。
不久，永州知府黄文琛因公往岳州，正好骆秉章也在岳州巡视。一是为礼节，二是汇报地方上的情况，黄文琛就去拜见了骆秉章。恰好樊燮知道了这件事，以为黄文琛定会告他的状，担心自己恶迹败露，就去找文师爷魏龙怀商义，魏建议他去找骆巡抚幕府一个叫左宗棠的，尽管他只是一个举人，但同曾国藩、胡林翼、郭嵩焘关系不一般，交往甚深，几届湖南巡抚对他都非常信任。骆秉章对他更是言听计从，外面都称左宗棠是二巡抚，你当去见见他。如果他肯帮忙，一个黄知府根本不算老几。樊燮听了魏的意见之后，连忙往长沙拜见左宗棠。此时的左宗棠在湖南官场名声大振。樊燮来求左宗棠办事，本来应谦卑有礼，可是在见面时很随意地拱手作揖，未按礼节屈体请安。左宗棠心中不快，便说道：“来见我的武官，官职不论大小，都要先行请安，你既然不肯请安，休来见我。”
樊燮一时性起顶撞左宗棠说：“朝拜体制，没有武官见师爷要请安的，我是四品大员，戴了红顶子，而，戴只是一个小小的举人，有什么了不起？”
此时盛怒的左宗棠忍无可忍，一个耳光，把他打了出去。
这年八月，樊燮由永州北上，到达武昌，通过关系找到了湖广总督官文的门卫李锦棠，由李锦棠介绍，结识了官文。
官文即把樊燮置理湖南提督，即以云南临元镇兵部栗襄置理永州镇总兵。可左宗棠历来痛恨贪官污吏，马上为骆秉章拟以参劾“永州镇樊燮违例乘舆私役弁兵折”，上奏朝廷。折中说：“永州一征探制两广交界地方，……樊燮北上之时，乃广东连州、广西贺县贼势披猖之际……亦存城标兵不敷派拨之时，犹取擅役弁兵随同出境，似此玩视军务，希便私图，实为军政之蠹。应请旨将永州镇总兵樊燮先行交部严加议处，昭定例而肃戒行。”
咸丰帝阅毕此折，立刻于十二月一日发出上谕：“说总兵以痼大员玩视军务，希便私图，实属胆玩，樊交部严加议处，即行开缺。”
樊燮革职以后，骆秉章又派人前往永州调查，查清樊燮擅自动用九百六十余两军费，三千三百九十余串公项钱，又动用米折银两。咸丰九年二月，左宗棠又为骆秉章撰写《已革樊总兵劣迹有据请提省究办折》上奏。三月十三日，咸丰帝收到奏折，立刻批阅：“已革湖南永州镇总兵樊燮……劣迹均有确据，且擅提廉俸数至盈千，悬款无著，署中一切使用复提营中银钱至数千元之多，樊燮著即行拿问，交骆秉章提问人证，严审究办。并着湖北督抗饬查履革员现行抵何处，即日复员押解湖南听候查办。”
樊燮为了逃脱罪责，在湖广总督官文、湖南布政使文格的支持下，开始反击左宗棠，即在湖广督署将骆秉章告发，又诬告左宗棠把持湘政并受贿，又控告永州知府黄文琛。官文也很快启奏朝廷，严历弹劾骆秉章、左宗棠。这糊涂的咸丰皇帝竟依了官文所奏下旨，命官文与湖北正考官钱宝青将左宗棠逮捕到武昌审判，要是左宗棠不认罪，官文可就地正法。官文亦准备将左宗棠押往武昌，对簿公堂。
左宗棠落了个如此下场，胡林翼有些心慌了，他清楚，“项庄舞剑意在沛公”，官文的如此作为，其意又岂只在左宗棠，他是在杀鸡给猴子看，他要吓猴子，这鸡是定杀不可的了。樊燮一案，实乃钦案，一般的保奏会有效么？虽然他曾同曾国藩、郭嵩焘力陈保举过，但结果怎样？不照样发归官文处理。胡林翼苦思了数日，他清楚，此刻惟一能够放左宗棠一马的，实只有官文一人，也就是说，只要将官文混过关，左宗棠才有一条生路，然而怎样去说服官文？于是他登了总督衙门，拜见了官文，以私人的关系去替左宗棠说了情，又屈尊俯首，拜见了马氏。
且说这马氏，自从胡林翼带头为她祝寿，给足了她面子，又让其母认她做了义女，为其正身正名，十分感恩戴德，心内郁结着一股报恩情结。如今见胡林翼相求，哪有不允诺之理，于是哭哭啼啼诉于官文，大讲胡氏之恩、胡氏之德。见宠妾如此，官文也就心软，于是一边劝慰，一边许诺。这官文本来是要置左宗棠于死地的，因为他清楚要整垮赶走骆秉章，有左宗棠在，他官文的计划就是一纸苍白无力的纸上谈兵，是没有任何力量的。但他又确实得罪不起胡林翼，胡林翼每月特拨给他的三千两盐利，他已经收了数月，名为署公费，其实，大家都清楚这是什么署公费呢？堂堂总督的署公费尚需一个巡抚来拨付么？这是一条财路。得罪了胡林翼也就断了这条财路。
再则他清楚，经过胡林翼的经略打点，湖北的吏治已是初露精干了。湖北没有了胡林翼，他官文却真的能混下去么？如此一想，加上马氏的枕头风一吹，官文没了辙，而想改主意，却又怕过不了咸丰皇帝那一关。恰在这时，咸丰皇帝最为宠信的重臣户部尚书肃顺获悉此事。肃顺是满族人，但少满汉之见，是最早主张启用汉人的满族大臣。湘军的兴起，胡林翼、曾国藩的重用都得力于他的极力支持。他的幕府中，也大都是汉人中有名的文化学者。肃顺看到朝廷密旨后，告诉其门客高心夔，高又告诉湖南湘潭人王闿运。王也是肃顺的门客，又转告翰林院编修郭嵩涛。郭闻22大惊，囚自己与左宗棠是同乡、好友，不便率先讲话，乃请肃顺向王闿运求救。肃顺说：“必俟内外臣工有疏保荐，余方能启齿。”
郭领其意，恰好与侍读学士潘祖荫同值南书房，便请潘出面讲话。
潘祖荫受郭嵩涛之托连12三疏“力辨其诬”，他说：“湖南一军立功本省，授应江两、湖北、广西、贵州，所向克捷，由骆秉章调度有方，实由左宗棠运筹决胜，此乃天下所共见，而久在我圣明洞鉴中也……是国家不可一日无湖南，而湖南不可一日无左宗棠也……宗棠为人率性刚直，嫉恶如仇。湖南不肖之员不遂其私，思有以中伤之久矣，湖广总督官文惑于谣言，未免有引绳批根之处。宗棠一在籍举人，去无足轻重，而楚南事势关系重大，不得不为国家惜此才。”
潘祖荫披沥上书，胡林翼紧密迎合，上奏《敬举贤才力图补救》一疏称：“左宗棠精熟方舆，畅晓兵略，名满天下，但谤亦随之。”进一步为左宗棠剖白。
咸丰帝见到这些奏折，果然问肃顺：“方天下多事，左宗棠果长军旅，自当弃瑕录用。”
肃顺回答：“闻左宗棠在湖南巡抚骆秉章幕中，赞划军谋，成效显著，骆秉章之功，皆其功也。人才难得，自当爱惜。请再密寄官文，录中外保荐各疏，令其察酌情形办理。”
官文等人见风转舵，与僚属商议，见奏结案，一场轩然大波才得以平息。
左宗棠被官文弹劾，几若丧命，却终因胡林翼周旋而化险为夷。他没有名正言顺地做过大官，“左都御史”只是朝野之士因嫉妒而挖苦讽刺他所称呼的。但他周旋于巨僚之间，官场的尔虞我诈、争权夺利、相互倾轧，却让他感到寒心。从骆秉章的幕府出来，回到湘阴，细细地想了这十几年来的人生经历，一幕一幕回忆起来，却是心有余悸。其时左宗棠已年届不惑，竟是产生出许多的厌倦官场的情绪来。
胡林翼见左宗棠如此淡泊官场，才干未及施展半分，很是惋惜。樊燮一案，官文草草收了场，朝廷不再追究。于是胡林翼又联合了曾国藩、郭嵩焘等上了保荐奏章，力荐左宗棠出山。左宗棠因祸得福，朝廷依奏授他做了太常寺卿而襄办曾国藩军务，终于结束了十多年的幕僚生涯。左宗棠以后的发迹，拜相封侯，位极人臣，知情人士都清楚，“没有胡林翼就没有左宗棠，就没有湘军驰骋天下的神话，就没有同治的中兴了”。
正是：
自恃才高不饶人，结冤终究成灾星。
不得贶生苦相荐，哪有左公他El荣。