联军入都，各国划界，分屯军队。美、日两国兵均严守纪律，不扰居民。德军愤使臣之被害，其出师时，德皇誓于军，谓破都城时，当以入野蛮国之法待之，故德兵淫掠殊甚。其他国军队亦略同焉。联军既占北京，分兵追驾，至保定而还。联军举德大将瓦德西为统帅，入居仪鸾殿，整队入宫，见穆宗瑜妃犹致敬礼，殿宇器物，戒勿毁掠，逮回銮时尚无恙也。城内外民居则恣意搜括，庙、观曾设拳匪坛者则焚之。拳匪乱时，积尸于道，联军则驱华人负尸出城；有达官贵族被驱遣负尸，不顺则鞭之。其掠人筐箧，则夺大车载之行；牲口不足，则执华人于道，以代骡马。陈璧方官御史，亦被执使负纤焉。侍郎李昭炜所居，有小童掷石伤洋兵，则入执昭炜至营痛挞之，复驱出，晕堕于玉河桥下；于式枚方居贤良寺，趋救始获甦。
联军以非李鸿章来不能言和，乃命鸿章与奕劻同为议和全权大臣；至于京师，奕劻一以让鸿章，不敢置一词。联军索罪魁载漪、载勋、载澜、刚毅、赵舒翘等数十人，鸿章屡与辩护。瓦德西曰：“吾等所列罪魁，皆其从者；为全中国体面，其首罪名尚未提出也。此而不允，则吾将索其为首者。”其意盖指太后也。鸿章亟以电告，乃允以载勋等赐死，而特原载漪配新疆，并黜溥儁大阿哥使出宫焉。鸿章与各国磋议已历数月，心力交瘁。行在政府屡传电谕，授意驳辩；鸿章谓枢臣不明敌情，徒乱意，阅竟旋毁之，幕僚不及见也。鄂督张之洞亦迭电干议，鸿章笑曰：“张某作官数十年，犹书生也。”之洞深恨之。各国持之紧，久未定议，而鸿章积劳病深，卒不起。濒危，犹口授计画，秩然不紊。各国闻鸿章逝，皆感怆，乃悉如鸿章议，卒签约，而鸿章不及见矣。先逝一日，口授于式枚草遗疏，保项城袁公继直督任，谓环顾宇内人才，无出袁世凯右者；并力请回銮，保外人无他。电达行在，太后及帝哭失声，辍朝，立授袁公直督。