他设帐授徒，门人常有千人之多，大儒卢植、郑玄都是其门徒。他一生注书甚多，其作注的书有《孝经》、《论语》、《诗》、《周易》、《三礼》、《尚书》、《列女传》、《老子》、《淮南子》、《离骚》等。另有赋颂等作品，有集已佚，辑有《马季长集》。
郑玄
郑玄（127年～200年），字康成，山东高密人。东汉儒家学者，我国著名经学家之一，在我国儒学发展史上享有崇高的地位。
郑玄先学今文经学，后习古文经学，网罗众家，通融为一，成了汉代最大的通儒，是两汉经学之集大成者。其经学成就及由其学术而形成的学派，后世称之为郑学、通学，或综合学派。
郑玄年轻时，赴京城洛阳太学受业。约37岁时，师事著名的古文经学家马融。学毕返回山东，家境依旧贫寒，客耕东莱，学徒相随达数百人。
由于党锢事件的牵连，便隐修经业，闭门不出，长达14年。汉灵帝末，党锢解禁，大将军何进执政，想重新起用郑玄。
郑玄年已60岁，婉言谢绝，宁愿从事教学与著述，往后的十多年，郑玄勤奋著述。汉献帝建安五年故，享年74岁。
史载，他注有《易》、《尚书》、《毛诗》、《周礼》、《仪礼》、《礼记》、《论语》、《孝经》、《尚书大传》以及《中候》、《乾象历》，又著《天文七政论》、《鲁礼袷义》、《六艺论》、《毛诗谱》、《驳许慎五经异义》、《答临孝存周礼难》等百余万言。
著书立说的成绩如此巨大，远在其师马融和两汉任何一位经学家之上。郑玄还注《易经》、《尚书》和汉代律令。
总之，郑玄以其丰富的著述创立了“郑学”，破除了过去今古文经学的家法，初步统一了今古文经学，使经学进入了一统时代，对经学的发展作出了重大贡献。
他对儒家经典的注释，使经学进入了一个“小统一时代”。他的作品长期被封建统治者作为官方教材，收入九经、十三经注疏中，对于儒家文化乃至整个我国文化的流传作出了相当重要的贡献。
荀爽
荀爽（128年～190年），字慈明，河南许昌人。荀氏为颍阴望族。爽父荀淑为战国荀卿第十一世孙，品行高洁，博学多识，有“神君”之称。荀爽兄弟八人俱有才名，当时被人称为“荀氏八龙”。
荀爽是“荀氏八龙”中的第六位，若论才学，则数第一。当时有“荀氏八龙，慈明无双”的评赞。他自幼聪敏好学，潜心经籍，刻苦勤奋。
汉桓帝延熹九年，太常赵典举荀爽至孝，拜郎中，对策上奏见解后，弃官离去。为了躲避党锢之祸，他隐遁汉水滨达十余年，专以著述为事，先后著《礼》、《易传》、《诗传》、《尚书正经》、《春秋条例》、《汉语》、《新书》等。
蔡邕
蔡邕（133年～192年），字伯喈，河南杞县人。东汉大儒、文学家、书法家。
他博学多才，通晓经史、天文、音律，擅长辞赋。灵帝时召拜郎中，校书于东观，迁议郎。曾因弹劾宦官流放朔方。
献帝时董卓强迫他出仕为侍御史，官左中郎将。董卓被诛后，为王允所捕，死于狱中。
蔡邕著诗、赋、碑、诔、铭等共104篇。他的辞赋以《述行赋》最知名。
赵晔
赵晔，字长君，绍兴人。东汉学者。早年拜经学大师杜抚为师，学习“韩诗”。一去20年，音讯全无，家人误认为他已亡，为之发丧制服。
杜抚去世后，赵晔经营葬之后才回乡。回乡后放弃做官，闭门著述，直至老死，写就《诗细》、《历神渊》和《吴越春秋》。
当时的大儒蔡邕到会稽，读其《诗细》、《历神渊》，拍案叫绝，以为优于《论衡》，既还京师，广传《诗细》。
赵岐
赵岐，字邠卿，初名嘉，字台卿，后避难故自改名字。陕西咸阳人。
桓帝延熹元年因得罪宦官党羽，曾变姓名逃匿北海卖饼。安丘人孙嵩看出赵岐不是普通人，把他带回家中，藏于复壁之内3年。
赵岐隐忍困厄，以坚强的毅力在复壁中作《孟子章句》，所注精审翔实，多有发明，为后世人所称道。
卫宏
卫宏（公元25年～公元57年），字敬仲，山东郯城人。东汉儒学学者。卫宏少时与河南郑兴俱好古学，爱好经籍。
先随九江谢曼卿学《毛诗》，作《毛诗序》；后随大司空杜林学《古文尚书》，作《训旨》。
光武帝时，任议郎，又集西汉杂事，编有作《汉书旧仪》4篇。据史料记载卫宏曾给毛诗作小序。
何休
何休（129年～182年），字邵公，山东滋阳人。东汉时期今文经学家。
何休为人质朴多智，精研六经。但他口讷，不善讲说，门徒有问者，则用书面作答。诏拜郎中，因不合于自己的志愿，以病辞去。
太傅陈蕃召请他参与政事。党锢事起，陈蕃被杀害，何休也遭禁锢。他闭门不出，用功十余年，作《春秋公羊传解诂》12卷。又注《孝经》、《论语》等。
另作《春秋汉议》13卷，以春秋大义，驳正汉朝政事600多条。
许慎
许慎（公元58年～147年），字叔重，是东汉著名经学家、文字学家、语言学家，我国文字学的开拓者。
许慎师事贾逵，曾任太尉南阁祭酒等职。性情淳笃，博学经籍，马融常推敬之，有“五经无双许叔重”之誉。
许慎精文字训诂，历经21年著成《说文解字》15卷，收文9353个，重文1163个，均按540个部首排列，是我国第一部说解文字原始形体结构及考究字源的文字学专著。推究六经之义，分部类从，至为精密。
另著有《五经异义》、《淮南鸿烈解诂》等书。
三、儒学著作
和先秦相比，两汉时期的儒学著作大都不能再称之为典籍，这一时期的著作多是给儒学典籍进行注解。
尽管如此，这一时期仍然有许多儒学著作对后世影响很大，有的著作甚至开创了一个儒学派别。
《京氏易传》
西汉京房撰，3卷。三国吴陆绩曾注此书。
以乾、坤为根本，坎、离为性命，统摄六十四卦，用世、应、飞、伏、游魂、归魄等解说爻、卦之间的关系，是术数之学。
《焦氏易林》
《焦氏易林》作者汉朝焦延寿。《焦氏易林》源于《易经》，然与之有迥异独特之处。《易经》共有卦爻辞450条，《易林》有4096占卦变之辞，较之《易经》卦爻辞有10倍之多，从而极大地丰富了信息内容。
《焦氏易林》在64卦基础上复变64，也即一卦变64，64卦变4096卦。这样，六十四卦中的一卦变为另一卦称之为“之卦”，然后在之卦后配以相应的文辞，即所称的四言诗卜辞。
《易林》占辞与《易经》卦爻辞同是占辞，但《易林》皆为统一的四言诗格式，而《易经》则无此统一格式。
《韩诗外传》
《韩诗外传》，一般认本书是西汉儒生韩婴所写的。这是一部由360条轶事、道德说教、伦理规范以及实际忠告等不同内容的杂编。
一般每条都以一句恰当的《诗经》引文作结论，以支持政事或论辩中的观点，就其书与《诗经》联系的程度而论，它对《诗经》既不是注释，也不是阐发。
《韩诗外传》尽管名义上依附于《诗经》，但它使用的材料却来自几个哲学学派的著述并加以折衷。
《荀子》是最常用的来源，不过《庄子》、《韩非子》、《吕氏春秋》以及《晏子春秋》、《老子》、《孟子》也都被使用过。
道德说教为其主要基调，但也有一些趣闻轶事，缺乏明显的道德意义。
《毛诗序》
汉代传《诗经》有鲁、齐、韩、毛四家。前三家为今文经学派，早立于官学，却先后亡佚。
赵人毛亨、毛苌所传的《诗》，称为为“毛诗”，属古文学派。《毛诗》对应《诗经》300篇均有小序，而首篇《关雎》题下的小序后，另有一段较长文字，世称《诗大序》，又称《毛诗序》。
看来很像是一篇《毛诗》讲《诗经》的总序。成书于西汉，经过东汉经学家卫宏修改。
《毛诗郑笺》
《毛诗郑笺》，毛诗郑笺西汉时期的毛苌，毛亨父子所收集的《诗经》叫作《毛诗》。
后来著名经学家郑玄对《毛诗》所作的解释叫《笺》。
《大戴礼记》
《大戴礼记》，也名《大戴礼》、《大戴记》，一般认为该书出自西汉礼学家戴德之手。该书成书时间应在东汉中期，是当时戴德的传人为传习《士礼》而编定的参考资料汇集。
该书原有85篇，但今仅存39篇。其余的46篇，至迟在唐代已亡佚。尽管如此，它的史料价值和学术意义仍不可低估。其中多数篇章记述从战国到汉代儒家学派的言论，是研究中国早期儒学的基本资料。
《诸侯迁庙》、《诸侯衅庙》、《朝事》、《公符》等篇，记录诸侯礼制，可补《仪礼》之缺。《五帝德》、《帝系》两篇记载上古帝王世系，司马迁据以撰成《五帝本纪》，是探索史前史奥秘的珍贵文献。
更有《夏小正》一篇，是我国现存最古老的一部月令，篇中被学者称作“经”的文字，据说传自夏代，生动具体地反映了上古先民对一年12个月天文星宿、气象物候的认识，在天文史、气象史、农业史上占有重要地位。
《小戴礼记》
《小戴礼记》，也称《小戴记》，即《礼记》，相传西汉礼学家戴圣编撰。小戴指戴圣，大戴指其叔父戴德。
该书原为解说《仪礼》的资料汇编，后经郑玄作注，使它摆脱从属于《仪礼》的地位而独立成书，成为今本《礼记》。