这一晚，外省的许多地方也发生了同样的大屠杀，被屠杀的胡格诺教徒达数万人。海军大将科利尼也在家中被杀。只有刚刚做了新郎的亨利幸免于难。但亨利从此失去了自由，被软禁在卢浮宫达3年之久。大屠杀触发了法国一度平息的宗教战争，两派的仇恨更加深了。
第三阶段：1585—1598年。从1585年开始，法国国内开始了“三亨利之战”。各方首领分别是国王亨利三世、吉斯公爵亨利、波旁家族的亨利。1585年，吉斯公爵亨利取得西班牙的支持，在南特重组天主教同盟，巴黎、里昂、波尔多、马赛、第戎等城市纷纷归附。同时，法王亨利三世又撤销了两次和解的敕令。胡格诺教徒只得在波旁家族的纳瓦尔国王亨利的旗帜下应战，并得到英国和德意志新教诸侯的支持。1587年10月20日，新教军队在库特拉击败天主教同盟军。吉斯兄弟不久也重创胡格诺派军队。1588年5月，天主教同盟控制下的巴黎迎接吉斯公爵人城，包围卢浮宫，国王亨利逃出巴黎，并在鲁昂签署联盟敕令，满足了天主教派的一切要求。同年12月，国王的近卫军暗杀了吉斯公爵和天主教同盟所有首领。巴黎闻讯后发生暴乱，并成立以吉斯家族为首的新政权。受到新旧教派夹攻的亨利三世同纳瓦尔国王结盟。1589年8月1
日，亨利三世被刺身亡，纳瓦尔国王亨利成为法王亨利四世。但天主教派拒不承认，内战战火继续燃烧。亨利四世连续在军事上取得胜利，但无法攻人巴黎。鉴于法国90％以上的人口都信仰天主教，亨利四世于1593年7月25日在圣德尼大教堂改信天主教。6天之后，新旧教两派势力达成为期3个月的休战协定。1594年3月22日，亨利四世凯旋进入巴黎，受到隆重欢迎。此后的4年中，各地纷纷归附，亨利四世还赶走了混战之中攻人法国的西班牙军队。
1598年4月，亨利四世颁布“永久性”的“南特敕令”，宣布天主教为国教，胡格诺教徒在法国全境有信仰新教的自由，在担任公职方面享有同天主教徒同等的权利。5月，西班牙同法国议和。
30多年的胡格诺战争结束。
胡格诺战争的结束，使法国王权得到振兴。内战的结束和亨利四世的胜利，有助于重振王权，为民族国家的统一和经济的复兴创造了条件。亨利四世在首术哧利的协助下进行了全面整顿和改革，使工商业和农业迅速繁荣起来，国库由空虚变为充盈。亨利死后，路易十三的首相红衣主教黎塞雷彻底铲除了贵族的独立势力，建立了以王权为核心的地方管理体系，实现了中央对地方较为严格的控制。
“南特敕令”虽然保留了胡格诺教派的一些特权，但仍具有划时代的意义。胡格诺战争最终确立了君主专制政体，各派封建势力相互妥协，支持王权。法国绝对君主制从亨利四世开始，经路易十三的首相黎塞留和路易十四的努力，逐步发展、巩固、强大起来，到路易十四时代达到顶峰。封建贵族的割据势力在政治上彻底被打垮，在一定时期内，为法国资本主义的发展创造了有了条件。
法国著名历史小说家大仲马根据这一时期的史实改编成了《玛戈王后》、《蒙梭罗夫人》和《四十五卫士》三部曲。在这部系列小说中，阴谋与爱情，战争与恐怖并存，在人们的眼前重现了当年的波澜壮阔。
以圣巴托罗缪之夜为背景的法国影片《玛戈王后》
冰冷的月光笼罩着海面，而此时双方已混作一团，火炮疾矢如雨，中板上血肉横飞，到处都是刀光勃影……
十字架战胜新月旗
——勒班陀海战
1453年5月29日，土耳其人攻下君士坦丁堡，并改名为伊斯坦布尔，著名的索菲亚大教堂被改为清真寺。君士坦丁堡的丧失，标志着拜占廷帝国千年统治的结束和奥斯曼帝国的崛起。此后100多年里，土耳其人不断向欧洲扩张，使欧洲各国感到了巨大的压力。
1570年，奥斯曼帝国又出兵攻打威尼斯领地塞浦路斯。欧洲人感到遏制土耳其入侵已迫在眉睫，不然他们就会吞掉整个世界。威尼斯人同罗马教皇庇护五世和西班牙国王腓力二世结成同盟，由教皇庇护五世出面，号召欧洲各国的基督徒团结起来，为抵抗异教徒的入侵而战。因此，当威尼斯与土耳其人发生战争时，欧洲各国有船出船，有人出人，支援威尼斯人与奥斯曼帝国作战。经过一番协商，他们组建了一支欧洲各国的联合舰队，共308艘战舰，上有30000名士兵、50000名水手及大量的划桨的奴隶。西班牙国王腓力二世同父异母的兄弟，年仅26岁的多恩·约翰被任命为联军总司令。
6月6日，多恩·约翰由马德里动身，开始集结舰队。由于各国对指挥权的分配争论不休，致使战争计划和兵力部署一再改变，以致拖延了3个月的时间，而塞浦路斯已于1571年7月陷落。然而当将士们得知塞浦路斯指挥官布拉格迪诺与土耳其人签订和约之后，又被诱捕，并在受到酷刑后被杀害的消息，都表示出极大的义愤。土耳其人这种背信弃义的残暴做法激怒了所有的将领。人们都满怀复仇的怒火，渴望一战。
9月15日，舰队浩浩荡荡地开进罗尼海，寻找土耳其海军的踪迹。10月7日凌晨，舰上值勤的哨兵发现两艘敌船像箭一般地驶向勒班陀湾的东方。几分钟以后，由300艘战舰组成的强大的土耳其舰队出现在他们面前。多恩·约翰急忙命令联合舰队迅速排成半月形的战斗队形，并下令开炮。联合舰队的火炮开始第一波齐射，随后土耳其舰队也开始还击。双方的炮弹像雨点一样密集地相互射击，一场地中海上规模最大的海战爆发了。
双方的舰队在互相射击中距离越打越近，战舰逐渐挤在一起，双方船上炮火都已发挥不了任何作用，这时，土耳其舰队的司令官下令用步兵冲上联合舰队的战舰进行接舷战。虽然土耳其人在海战上经验不如欧洲舰队，但他们的步兵却具有人数上的优势。在过去的多次战斗中，他们都是靠这一招取得了胜利。
但是他们的肉搏战术这一次却失灵了。在激烈的接舷战中，联合舰队竟渐渐地占了上风。原来出发时联合舰队就向船上的划桨奴隶宣布了一条命令：“所有的奴隶在战争胜利之后都可获得自由，而且还能得到一份土地。”在两军决战的关头，这项命令发挥出了强大的威力。在自由的感召之下，联合舰队船上的奴隶们主动投入了战斗。当土耳其的士兵冲上联合舰队的战舰时，个个都被奴隶们扑腾扑腾地扔到海里。而土耳其军舰上的划桨奴隶都是从各地抓来的，他们既不信仰伊斯兰教，战后也得不到任何好处，于是有的开始起来造反，有的想法逃亡，造成舰船上的极度混乱。经过4个多小时的激战，多恩·约翰亲自指挥联合舰队的中路军突破了土耳其舰队的防御，击沉了土耳其旗舰。在混乱的战斗
中，一粒子弹突然击中了土军司令阿里的前额，他立刻倒下。一名联军士兵迅速割下了他的首级，高喊起来。于是土军全部瓦解，联合舰队大获全胜。
在这次海战中，联合舰队只有17艘战舰沉没，而土耳其共有62艘船被击沉，3万人阵亡，还有117艘战舰被俘。
奥斯曼土耳其从一个鲜为人知的突厥部族迅速崛起成为一个横跨欧亚非的强大帝国，主要原因之一就是他们在以往的战斗中所向披靡，节节胜利。然而进人16世纪以来，随着欧洲科学文化的进步、人文主义的兴起与民族精神的凝聚，以宗教狂热与盲目蛮勇为特点的奥斯曼帝国，相比之下已显出落后与衰败。1571年对塞浦路斯的围攻，已是它攻击力的最后表现。这一战之后，土耳其对西欧的威胁就此结束。从此，奥斯曼帝国再也没有恢复元气，没有能力去侵略别的国家了。
勒班陀海战是世界海战史上最后一次划桨舰海战，在此后的海战中，机械动力取代了奴隶的划桨，加农炮取代了接舷战。它宣告了风帆时代的到来。勒班陀海战打破了土耳其人不可战胜的神话，使基督教世界振作起来。
在这次著名的海战中，西班牙伟大的文学家塞万提斯在战斗中失去了左手，但这并没有摧毁他进行文学创作的勇气，他在艰苦的条件下创作了文学史上不朽的杰作《堂·吉诃德》，成功塑造了沉湎于骑士小说中不能自拔的堂·吉诃德形象，以至于“堂·吉诃德”一词成为办事欠考虑、耽于幻想、迂腐顽固、落后于历史进程的同义语。
英国军舰善于把握风向．进退灵活，随时给敌人以打击。他们常常非常接近西班牙军舰。时而左眩时而右舷．不断地将大大小小的炮弹向西班牙舰队发射……