胃肠溃疡的形成，大多与精神因素有关，如思虑犯脾或肝郁犯胃，导致胃肠功能紊乱，胃肠道内激素分泌失常，损伤黏膜而为病。基本的病理变化为胃酸严重超标，胃肠黏膜的机能下降，实际是肝木犯土的具体反映，从五味的角度讲，肝木失常则产酸，胃酸伤及了胃肠黏膜，损伤了黏膜至肌肉层形成溃疡，脾主肌肉，所以，溃疡形成的实质从中医角度理解属于木克土的病理反映。如《素问·六元正纪大论》云：“木郁之发，民病胃脘当心而痛。”《素问·至真要大论》曰：“厥阴司天，风淫所生，病胃脘当心而痛。”可见《内经》认为，肝木功能失常是胃脘痛发病的关键，这也被现代医家所认可，如孔伯华论胃溃疡病时说：“肝阳过强，则胃气被遏，胃气愈遏，则肝阳愈强，肝阳强则酸生甚，胃气遏则韧自韦，其所以破者，职是故耳。彼殊不知破虽在胃，而其原在肝也，倘徒治胃而不治肝，乃舍本逐末，安望其痊？治医者不可不察也。”
因此，在溃疡病的治疗过程中必须考虑精神因素，如思虑伤脾，或肝郁犯胃导致胃肠功能紊乱，导致溃疡的发生，可用四君子汤合逍遥散而治之，益气生肌并舒肝和胃，并加用焦乌梅、生牡蛎、白及、地榆炭制酸、止痛、敛疮，整体与局部同治。
另外，溃疡病还应考虑肝郁何以犯胃，是由于脾胃虚寒，土虚木乘，临床多以肝胃虚寒证为主，主证为胃痛放射到两胁及后背部，泛酸嗳气，恶心呕吐，大便干少不爽，视物不清，脉弦细数等，治以吴茱萸汤舒肝和胃，降逆止呕。
临床治疗胃溃疡病，在治本的同时还应注意治标，由于病变易导致胃气郁滞，出现胃中胀满不适，多食胀甚，泛酸嘈杂等证，治疗应注意行气止痛，如加用苏木、甘松等品，提高疗效。