李时珍不仅留心药物，还随时搜集治病的单方。庞宪见师父有个笔记本，上面密密麻麻的记的全是单方，什么箭头草烧出烟来可以熏疮啊，胭脂菜捣烂了涂在伤口上可以治虫伤啊，刀豆子烧成渣子吃下去可以治呢逆啊，一条一条，都记得很详细。
有一天，庞宪问起这事，李时珍对他说，这些单方都是人们一代一代地传下来的，有许多很灵验，用的药又简便。山村野洼的地方，人得了病，一时请不到医生，用这种土方子治，往往很见效。
庞宪说：“那师父编的书，这些东西也要编进去了。”
李时珍点点头说：“不错。可是，我们现在找到的还太少，还得多跑一些地方才行呢。”
他们走了一个村又一个村，有时候一连几天在山里走。夜晚没有找到店住宿，就随便找个破庙什么的小屋住下，遇到山路陡的地方，平地里没有房子，他们就住在隐居的道士沿山壁搭的小木屋里。这种小木屋，很象吊在半山腰的一只木笼，大风一吹。
摇摇欲坠，还不时听到远处的猿啼狼学。
李时珍每天找定住处，就忙着把白天找到的药草仔细地研究，一面在笔记本上作记录，还让儿子建元画下图样。
到了偏僻的地方，人家看见李时珍他们那般举动，起初都有些疑心，交谈之后，才知道他们是出来采访药草的。他们在困难时，常常得到意外的帮助。
一次，路上遇到了暴风雨，前不挨村，后不挨店，狼狈不堪。就在这时，有几个山农迎上来，问明他们的来历，便留他们住下。
山农们告诉他们，前面有一段路要从山谷底下走过，一下大雨，山水就往下冲，走那段路非常危险，劝他们多住几天，天晴了再走。
原来这几个山农，都是趁着闲空的时候，出来打猎的。白天出去打猎，晚上带着些猎获的獐兔什么的，一起烧着吃。
李时珍多住了几天，和他们谈得很投机，顺便也了解到一些山禽野兽的知识。有个山农在讲起虎骨治病的效力时，还告诉了李时珍一条经验，说用虎骨作药，应该用前腔骨，因为老虎一身的筋节气力都用在前腿上。
李时珍听了，不禁感叹地对庞宪和儿子建元说：“这些话，古人的书上也不是没有讲过，可是总没有他们讲得透彻。我们这次出门，差不多走到哪儿都能听到一些新鲜的事情。”由此可知，群众才是智慧的源泉。
李时珍他们在北道走了很长时间，回到湖广。李时珍原来有个打算，想拐个弯回家看看，再到别的地方。
可是到襄河附近时，李时珍改变了主意。他说：“此去不远就是太和山，我看我们还是先到那里走一走，再回蕲州去吧。”庞宪和建元也都表示赞成。
太和山即今武当山，位于湖广均州西南，方圆四百多公里，山中有72峰和24涧，层峦叠峰，林木丛生，满山是珍禽异兽，遍地是奇花异草，是一座天然的动植物药库。
李时珍三人在太和山一晃就是数月，采得无数药物标本。一天黄昏，他们来到紫霄宫附近，在大树参天、荒草没顶的小径行走。
忽然，建元发现一棵榔树上结着一种奇怪的果子。
李时珍驻足一看，见榔树上果实累累，果实形状既像桃，又似杏。他从低垂的树枝上摘下一个，咬了一口品尝，那果子极为香甜，略带酸味，有点像熟透的梅子。
吃着吃着，李时珍突然明白了这是什么东西，他脸色都变了，对庞宪和建元说：“糟了，我们吃了皇上下令百姓不准偷吃的禁果，这是榔梅啊！”
庞宪听师傅这么说，觉得奇怪，就问：“榔梅有什么稀奇，百姓尝一下都不可以？”
李时珍叹了一口气，说：“其实，榔梅没有什么奇特，不过是将梅树枝嫁接到榔树上，从而结出的果实。只不过果实的形状奇特一些，味道也不错罢了。”
原来问题出自当今皇帝，因为他信奉道教，特别钟爱这种叫榔梅的水果。
关于榔梅有一个传说，真武大帝当年在太和山修道时，折了一枝梅枝插在榔树上，对天祈祷说：“吾道若成，开花结果！”
后来，那株榔树果然开了花，结了果子。
道士们每年秋天将果子摘下来，用蜜炮制，向皇帝和王爷进贡，说吃了能成仙得道，长生不老。
以后，皇上便下令将榔梅定为禁果，只准进贡朝廷，百姓不得偷吃，偷吃便视为犯法！
李时珍话还未说完，一群道士提着木棍走来。李时珍连忙迎上前去，给这些道士解释。他说：“我们是郎中，进山采药，误食禁果，万乞原谅！”
众道士中，走出一个德高望重的人，看来是道长。
这位道长询问李时珍：“你是什么地方来的，为何到此？”
李时珍说：“我是蕲州郎中李时珍，为了重修《本草》，所以来这里查访药物。”
道长得知李时珍是蕲州来的，便向他打听李言闻的情况。
李时珍一听道士提起自己父亲的名字，心想这说不定是熟人，就赶紧回答说：“仙长所问，正是家父。”
当这位道人得知李时珍便是李言闻的儿子时，便异常高兴地告诉李时珍，他和言闻是刎颈之交。于是，干戈立即化为玉帛，道士视李时珍为侄辈，邀他到道观一叙。
李时珍三人随道长进入紫霄宫。只见紫霄宫内香烟缭绕，大殿正中，有一个巨大的炼丹炉，炉火正旺。
李时珍告诉道长：“我想在重修《本草》时，将炼丹家炼制各种丹药的方法和药效记载上去，请道长指教。”
道长非常爽快，愿意满足李时珍的要求，将他所知的炼丹术和盘托出，供李时珍参考，并亲自领李时珍观看炼丹过程。
李时珍干脆就在紫霄宫住了下来，详细记录各种丹药的制作过程和疗效，同道长讨论各种丹药和矿物药的功效和弊病。
道长思想很开明，并不保守，两人谈得很投机，不只谈丹药，还谈诸子百家，常常交谈至深夜。道长是个学识渊博的人，他把李时珍视为难得的知己，竟将紫霄宫秘传的“武当行步功”授给了李时珍，使李时珍获益不浅。
这天到了九月初九重阳节，晚上，李时珍望着皎洁的月光，向建元、庞宪讲起重阳节登高、饮菊花酒等习俗的来历。
东汉时期的桓景随费长房学道。有一天，费长房告诉他，九月初九这一天，你家有灾。全家人必须用绢袋装上茱萸，爬到高山上饮菊花酒，天黑之后回家，才能躲过此难。
到了九月初九，桓景根据费长房的吩咐做了。晚上回家后，只见家中的鸡、牛、羊等动物死光了。他逢人便讲费长穷料事如神。
这件事一传十、十传百。家家都在九月初九佩茱萸登高、饮菊花酒消灾。
李时珍望着庞宪、建元惊异的眼睛，笑着解释说，这件事其实并不神秘。
九月正是晚秋，寒湿之气会合，往往形成寒湿毒邪，造成人畜生病甚至暴死。茱萸能驱除寒湿之气，菊花酒温暖助阳，加上高山上湿气较淡，所以能躲灾疫。
李时珍用他渊博的知识，给万里路的行程中增添了乐趣。
通过几年野外采集工作，李时珍发现了前人没有记载、经过考察证明可作药用的植物、动物、矿物药数百种，记述了上千种药物的性状、治疗效果。
像后来广泛运用的动物药材如牛黄、狗宝、牡蛎、珍珠等，都是李时珍第一个编进《本草》的。
通过野外考察，李时珍记述了许多矿物学知识，他说：“金有山金、沙金两种，其色七青、八黄、九紫、十赤，以赤为足色，和银者性柔，试石则色青；和铜者性硬，试石则有声。”
李时珍关于金银的这些记载，就是冶金中的“比色法”。这种方法一直在冶金行业中被长期使用。
李时珍还记述了试验金子成色的方法，即用试金石在金子上划一条线，凭线的颜色和标准样品的颜色比较，就能够估量出金子的含金量。他还同时注明，这种方法只可用于金银合金，不能用于金铜合金，还补充了区别这两种合金的办法。
另外，李时珍还记述了铝粉制法的原理和步骤，这是世界上最早的关于铝粉的制作方法的记录。他还发现了许多新的矿物药，如石炭等。
通过实地考察，记录民间药方，李时珍为《本草纲目》的完成作好扎实的准备工作。