徽宁池太广道，简称皖南道，治所在芜湖。此地北望江淮平原，南临浩浩长江，青弋江自东南向西北穿城而过，为长江中下游的商埠重镇，尤以冶金和纺造业最发达，晚清时期辟为对外通商口岸。冯志沂查阅了皖南的风土人情以及历任道员的治政实绩，对前任邓瀛这个人非常佩服。
邓瀛，字登三，号介槎，中进士入翰院，外放知府、监察御史、道员、等职务。该人官皖南道时，清廉刚直，体恤民情，敢于革除陋习，热衷倡学兴教，对冯志沂触动很大，誓以邓介槎为榜样，抱定“生死一官贫”的信念赴任皖南道。
省府的官员吴竹庄、杨楚田、朱久香等人为他设宴饯行。席间，他们各自将珍藏的文玩字画拿出来请冯志沂观赏。竹庄性爱园趣，因绘《半亩园图》，楚田有石癖，绘《觅石图》，久香收藏古砚，绘《忠孝遗砚图》，观后，应友人之嘱，分别题诗画上，墨香笔妙，画意诗情，堪称合璧，令大家赞不绝口。僚友们都心里清楚，芜湖系“皖之中坚，长江巨埠”，冯鲁川莅官兹土，用不了三年，皖臬署职必会正授，因此，对他的墨宝倍加珍爱。
三月中旬，先有练潭之行，想和族侄冯焯全家团聚数日，再去芜湖。此时的冯焯，因防堵捻匪立功，升了县丞。族叔的到来，族侄全家喜出望外，载酒、杀鸡、烩鱼，把他尊为上宾，唯恐招待不周，这使得冯志沂真正感受到亲人团聚的无比欢快。
族侄家住了两天，第三天，他就急着要返归安庆，族侄挽留不住，依依惜别。冯志沂何尝不是个重感情之人？离开练潭的路上，脑际不断浮现出和族侄全家亲密团聚的情景，吟诗纪云：
南风吹我来，北风吹我去。
屈指四年中，离情夺欢趣。
官守皆属新，颜状各非故。
宁知宦海萍，复此连宵聚。
更深谈已倦，开箧拂缣素。
颇似两童，明灯共章句。
此乐未可常，前期漫无据。
勉旃课佳儿，蜚声慰迟暮。
——《过子明练潭官廨信宿而返归途寄之》
回到安庆，处理了几件紧要的公事后，便择吉日，乘船顺长江水路东下芜湖。行前，下发通知，禁止沿途州、县官员迎送，违者责罚。
起航之日，天气尚好，行进间起了风，雨随风来，江上迷蒙一片。将至芜湖，风雨渐退，坐在悠悠航行的船头，目击远近帆影，洲渚烟岚，不禁心潮起伏，叩舷而歌：
画舸乘风去，青山背客行。
帆樯争出没，洲渚各阴晴。
野色饶归思，江神不世情。
扣舷聊快意，津吏莫相迎。
——《将至芜湖风利》
到达芜湖，满以为旧友张饴山还在署所，不料早就调任，去了湖北的恩施，多少有些失望。还好，月底张饴山自恩施寄来问候的诗，他次韵奉答：
一
君棹扁舟去，经年发上都。
诗书驱瘴疠，忠信涉江湖。
忽枉新诗版，来寻旧酒徒。
自惭空老马，随处得迷途。
二
吾道将何适，他州似此都。
乡心雁门塞，帆影洞庭湖。
鸾翮驯中散，娥眉嫉左徒。
新硎君自试，吾已畏长途。
——《张饴山出守施南枉过赠诗次韵奉答》
上任皖南道刚两阅月，出事了。一次，与当地士人宴饮，因贪杯过量，醉得不省人事。酒醒后，高烧不退，全身疲软，医师诊断为酒毒过盛，引起肝肾衰竭，叮嘱赶快用药来解，耽搁不得。
过了几天，开始咯血，健康状况急转直下。冯志沂自感无法坚持坐堂办公，不得已于五月上旬，上疏要求开缺现职，留在官寓调养治疗。
此次病情的加剧，除了工作过于劳累而外，还与长期纵酒有关。无论和上司，还是朋友，酒席筵前总要陪奉到底。平日里嗜好饮酒，“口能容拳，酒酣辄引以为笑，每饭必饮，每饮必健谈”。有人不理解他郁结已久的内心痛苦，对他酒后失态，颇有微词。
他并不避忌自己的隐情，多次和属下说：“吾幼年失怙，不逮事亲，君门万里，不敢仰望，终鲜兄弟，夫妇失欢。平生所乐，惟友朋之聚耳。”
家兄非常惦念千里之外的弟弟，六月初来信询问身体近况，他写下了最后的绝笔——《寄家兄》：
千里何由问起居，万金相抵较何如？
不图鹤发高年日，犹作蝇头细字书。
老去欢情宜自觅，向来豪气可全除。
阿连岁岁池塘梦，只在茶铛药鼎余。
病中的冯志沂日夜思念着长兄和家人，不忍实告自己病重，只轻描淡写地说了说煎服药物调治的情况。也想着京中朝夕相处过的戚友，特将平时把玩的鼻烟壶、玉坠子、歙砚、徽墨等心爱之物全都寄给了董麟弟兄们。
六月的皖南，气候闷热潮湿，病沉疾笃的冯志沂，预感到自己即将走向生命的尽头，和探望他的僚友们说：此生有两大遗憾：一是多年来夫妇失欢，恨无亲生的子女；二是“吾平生无他长，惟司文柄掌刑条或可称职。乃终身不得衡文，诚恨恨！”
每日服过药，他强支病体，用颤抖的手字斟句酌地修改出都后写下的诗，而后抄录，实在坚持不住了，躺一会儿，继续进行。终于，赶在去世前整理抄录完毕。
族侄冯焯得知他病情危重，急急从练潭赶过来，陪护伺药，这是他身边仅有的亲近者。
六月二十四日，病榻上的冯志沂，再也无力坐起。上午，族侄问他想吃点什么？摇头却止；复问后事？他喘息着说：天下最爱我者，唯有慈母。如有可能，想办法把卿叔的骸骨送回家乡，葬在母亲脚下。族侄点头应允。
六月二十五日，夜半时分，雨珠不停地击打着衙宅院里的树叶，发出淅沥的声响，如诉如泣。病人再次吐出浓血后，心脏慢慢停止了跳动。一代才子，杳然而去，终年五十四虚岁。
呜呼！江山有恨风霜冷，
天地无情草木哀。
族侄含悲经纪丧事，收拾遗物，竟然没有任何值钱的东西，仅有少许俸金，书籍十箱，公牍若干卷而已。
远在山东剿捻的曾国藩闻其讣至，得悉他清苦异常的境况，甚为感念，专门派人送来理丧的经费。
因立有军功，皖省政府奏报朝廷从优抚恤。降谕：赠光禄寺卿，荫子入国子监读书。
他为官清廉，勤政爱民，惠及皖江，后被《安徽通志》载列为名宦。
山西的士人给他立了个牌位，奉祀于太原的“三立阁”。
七月上旬，冯焯护丧北上，回归雁门安葬。
居京的董麟，自七月以来，总感到心烦意乱。某日晚，似睡非睡之中，看见冯志沂站立在床榻前，面色异常，想与董麟说话，急起询问，忽然不见了。次日董麟找二弟董文焕谈夜里做梦的事，文焕说：莫非鲁川有意外？不然，阴魂怎么会游移出来呢。
八月初二日，京师的董文焕看到邸抄上登载出“徽宁池太广道简人，冯鲁川开缺”的讯息，当时“心甚异之，午间询问枢廷友人，知鲁川果病故也。书生命薄，一至此哉！吁嘻，悲叹久之。”（《清季洪洞董氏日记六种》）
董文焕确知冯志沂病故后，茶饭无味，竞夕不寐，上了火，牙疼病发作，几天里强忍疼痛，挥泪写下《挽鲁川》九首诗志哀：
一
早达知名久，忘年独有君。
那堪别离后，遽作死生分。
二
短札曾无到，箴言不可闻
萧条游宦迹，谁为护遗文。
三
南国传贤守，西曹属老郎，
世方资魏尚，才岂弃冯唐。
四
幕府三年客，军书百战场。
淮南遗爱地，大树自苍苍。
五
岂卜他生晤，空思入梦亲
拜床犹昨日，推谷更何人。
六
邱原无起日，风义更何人。
翠羽终成谶，豸衣知有因。
七
平生万卷书，无子继清贫。
并世文章伯，于今几辈存。
八
刘伶客哭寝，宋玉漫招魂。
安仁应作诔，屈子未招魂。
九
夜雨伤燕市，秋风怆雁门。
凄凉萧寺典，樽酒忍重论。
九月初五日，天色阴沉。
董麟弟兄三人招集冯志沂的生前好友樊彬、许宗衡、黄云鹄、王轩、贾瑚、刘铨福、玉双、杨宝臣等多人齐集于慈仁寺，设奠祭祀。庄严肃穆的气氛中，董麟首先向冯志沂灵位致哀辞，接着杨宝臣宣读祭文。读毕，与祭者无不动容，纷纷行香、敬纸含哀悼挽。
山西洪洞董家也很快接到冯志沂去世的讣告，堂侄女冯婉琳“闻二家叔已归道山”，设灵案，敬了香纸，以白绸蒙头，失声啼哭。夜深了，仍无睡意，灯下捧读二家叔的遗集，不由得悲从中来，拈笔写了两首诗，寄托哀思：
一
少年文采冠词场，薄宦沉浮滞省郎。
未必才高难致福，何堪名重反嫌狂。
恤刑云司清风在，减赋皖江惠泽长。
太息生平励孤介，不将琴鹤伴归装。
二
风雅宗工一世豪，坫坛旗鼓每亲操。
酒缘好客樽常满，诗为分题格愈高。
经术济时难避谤，驰驱许国敢辞劳。
宦深早定千秋论，不愧清勤两字褒。