1650年，绛云楼突遭失火，藏于楼中的数万卷藏书、名瓷奇石全部毁于大火。钱家财产损失巨大。1664年，钱谦益重病去世，终年83岁。他死后，钱家的族人钱朝鼎指使钱曾等人向柳如是逼索钱财三千两，但经过绛云楼失火后，钱家的财力大减，甚至钱谦益重病时服药都向药铺赊账，柳如是根本无力交付。想到这些人与钱谦益生前都有善交，如今竟如此欺诈她，柳如是悔恨当日乙酉之变时，不曾殉节，令今日自取其辱。
钱谦益死后五十三天，柳如是走向家中荣木楼，一条白练系上了她的脖子。死前她留给女儿一封遗书，有言：“我来汝家二十五年，从不曾受人之气，今日竟当面凌辱。我不得不死，但我死之后，汝事兄嫂，如事父母。我之冤仇，汝当同哥哥出头露面，拜求汝父相知。”
柳如是去世时年仅四十七岁，一代才女如此寂寂而终。纵观其一生，生活历经坎坷，情感几经波折，但她在文艺上的成就有目共睹，而其晚年推动钱谦益投身抗清斗争的事迹，也让后人扼腕默叹。柳如是不愧被后世史学家称为“女侠名姝”。