市场细分的目的在于以个性化的产品和服务满足客户需求。虽然这表明以客户为中心的营销思想已经得到了大家的认可，但是在具体实施过程中，有必要注意实施市场细分策略需要付出的成本。无论是厂商还是渠道，在推行市场细分的营销策略时，一般会遇到以下几个方面的成本增加。
一、产品修改成本
企业为了满足不同细分市场消费者的需求，而对原有产品进行外观、功能上的一些修改，通常需要额外的研究开发费用，这必然会导致一定的产品修改成本。
二、产品生产成本
对企业来说，生产10类不同产品，每类各生产10件，通常要比生产100件同类产品所花费的成本昂贵。进行市场细分之后，企业必将针对不同的细分市场推出不同类型的产品，于是生产成本会比原先有所提高。另外，每种产品的生产准备时间越长，销售量越小，那么其生产成本也就越昂贵。
三、产品存货成本
差异产品的存货管理成本一般要比单一产品的存货成本高一些，因为企业必须为之做更多的记录和审核工作。为了避免缺货的风险，数种产品的安全存量之和也将大于单一产品所需的安全存量。因此进行市场细分之后，企业的产品存货成本也有所提升。
四、产品分销成本
由于销售渠道的多样化，企业和大分销商面对着越来越多的下游经销商，这必然导致渠道费用的提升。
五、产品促销成本
企业实施细分策略后，针对不同的细分市场会采用不同的促销策略，于是会降低个别媒体的使用频率，从而丧失媒体的数量折扣优惠。此外，对原有产品进行修改或推出新产品等行为都必将引起促销费用的相应提高。正是这些因素的影响，产品促销成本在细分之后也将会提升。
六、行政管理费用
公司必须针对不同的细分市场增设管理人员和销售人员，这样会额外地增加人工成本。公司在制定不同的营销计划时，也需要额外的市场调研、预测、销售分析、促销、计划工作和销售渠道管理。此外，还必须依据各细分市场的具体情况制定出相应的财务、定价决策等，这些决策的多样化和复杂性也会增加行政管理费用。