景山东街（马神庙）北京大学的大门，前后有十二根木柱，两边的厢房各有一扇窗户，字型的窗棂上贴着薄薄的窗纸。过厅正中两根木柱之间，挂着一块横匾，上面是“国立北京大学”六个隶书大字。
1917年1月4日，蔡元培到北大任校长，接替胡仁源。1月11日，蔡元培正式致函北京政府教育部：
敬启者，
顷奉函开，据前署北京大学校长胡仁源呈称，顷据本校文科学长夏锡祺函称，锡祺拟于日内归省加有他事相累，一时不克来校，恳请代为转呈准予辞去文科学长职务等语，理合据情呈请钧部鉴核施行……。查文科学长夏锡祺既系因事不克来校，应即准予辞职，所遗文科学长一职，即希贵校遴选相当人员，开具履历送部，以凭核派等因到校，本校亟应遴选相当人员，呈请派充以重职务，查有前安徽高等学校校长陈独秀品学兼优，堪胜斯任，兹特开县该员履历函送钧部。恳祈詧核施行为荷。此致教育部
附履历一份
中华民国六年一月
陈独秀，安徽怀宁县人，日本东京日本大学毕业，曾任芜湖安徽公学教务长、安徽高等学校校长。
陈独秀到日本五次，来去匆匆，或读书，或避难，虽曾在日本大学读书，但没有拿到大学毕业证书。他在安徽公学代课，但没有任教务长，他在安徽高等学校任教务长，不是校长。蔡元培担心教育部不批，对陈独秀的履历表作了必要的润饰。这对于加强北大的新的力量，是必要的。
隔日，范源廉签发了“教育部令”第十三号函：“贵校函开安徽高等学校校长陈独秀品学兼优堪胜文科学长之任……当经本部核准在案，除令行外，相就函复。”
当日，北大校园贴出蔡校长任职后的第三张告示：“本校文科学长夏锡祺已辞职，兹奉部令派陈独秀为本校文科学长。”这张告示，引起了一场风波。
陈独秀鼓吹打倒孔家店，主张白话文运动，桐城派的古文家视之为同乡中的叛逆。黄侃等人主张晋宋文风，但其音韵考据之学，同样因袭古人，同属《新青年》扫荡范围。他们认为陈独秀只会写一些笔记性文章，不配在高等学府任教授，不能胜任文科学长一职。黄侃反对陈独秀，除了对前任夏锡祺有好感，还有一个陈年老账。黄侃即当年陈独秀在日本《民报》馆无意中得罪的湖北人黄季刚，二人当年造成的隔阂，不期在北大加深了。
支持陈独秀的教授主要是沈尹默及安徽籍的部分同乡，他们提出安徽自戴震（戴东原）之后，安徽人士研究文字学（汉学）已成传统，在这些人士中，陈独秀对训诂研究造诣甚高，写过《字义类列》。蔡元培依靠这部分人提供的依据，说仲甫也有著作，坚持聘任了陈独秀。
这场风波平息下去后，陈独秀携高君曼及子美、喜子住北京市箭杆胡同九号（今二十号），《新青年》编辑部同时搬到北京。孟公府胡同（现名叫“智德北巷”）东西走向，在沙滩附近北大红楼的南面约五百米，里面有一条向南去的窄巷，叫箭杆胡同（现巷口墙壁上仍有红色标牌）。小院子坐南朝北，位于箭杆胡同通向骑河楼南巷的拐角。院子面积约四百六十平方米，房屋十八间半。院落分东西两片，这是一家孙姓的产业，置于1911年。陈独秀租住在东院九间房，从朝北的街门（箭杆胡同九号）出入；孙家人住西院九间房，从朝西的街门妞妞房九号（现名“骑河楼南巷”）出入。平常，陈独秀一家单门独户，和房东孙家互不干扰。
陈独秀租住的东院九间，北房南房各三间，东房二间，北边还有一小房间。陈独秀一家人住北边三间，南房三间做《新青年》编辑部。钱玄同、刘半农等人来了，即坐在南房聊天。两间东房，住了佣人和厨子。靠北边街门的耳房是门房，挂了《新青年》编辑部的牌子。箭杆胡同九号门楼外框的红漆剥落，中间是宽约一米多的两扇小木门，门嵋两端是突出的六棱木柱，上雕“吉祥”二字。
小院门前，有两只约高六十厘米的小石狮，虽不威猛，却也龇牙咧嘴，比起蔡先生门前的石犬，精神多了。