环境激素影响男婴出生率。自20世纪70年代以来，加拿大男婴的出生率下降了0.22%，美国下降了0.1%。美国科学家断言这可能是杀虫剂等污染物干扰了人类生殖激素的结果。1976年意大利Seveso城二恶英泄漏事件中受害的男性人群，其后代中女孩的比例升高。
环境激素影响男性精液质量及生殖系统疾病的发生。男性精子数目锐减、精子运动能力低下、精子畸形率上升、男性不育症患者增加，以及导致睾丸癌、前列腺癌、精巢癌、附睾囊肿等。在雄性生殖系统中，由于生精细胞的快速分裂繁殖使得睾丸对环境毒物非常敏感，金属铅、铜和许多农药都对睾丸有较强的毒性作用；2002年英国一项调查显示，在英国一部分污染严重的河流里，雄性鱼全部出现雌性化的特征。这类污染还会增加人类乳腺癌和睾丸癌的危险性。
辛基酚可导致雄性动物血清性激素水平下降和精子数量减少，以及雌性动物的动情间期延长，同时由于亲代的暴露，还可对子代产生不可逆的损害。铅会明显的造成精子数及精子活动力的降低，并会引发反应性氧化物质的升高，造成精卵穿透效率的明显降低。
己烯雌酚（DES）可引起雄性小鼠不育，睾丸发育不全、纤维化、钙化、生殖腺癌变，并可影响垂体-下丘脑的功能。由于农药的大量使用，许多益虫（如食虫瓢虫、草蛉等）、青蛙、鱼类及稻田里黄鳝、泥鳅几乎绝迹。一些学者认为，环境激素是造成动物生殖功能障碍以致野生动物濒临灭绝的重要原因。