性发育阶段的卫生很重要，它不仅关系着孩子的性发育，而且还影响到孩子将来的结婚生育。青春期是儿童身体和心理上的“多事时节”，容易患病，这对于12—13岁的孩子来说是难以防范的，家长要给予关心和指导，提前让孩子了解有关的卫生知识，确保孩子的身心健康。以女孩的经期卫生为例，家长要指导她们做到“六要六不要”：①要心情舒畅、情绪稳定，不要精神紧张、焦躁不安；②要防寒保暖，不要涉水、淋雨、用冷水洗澡；③要经常用温水冲洗阴部，保持清洁，不要坐浴，防止细菌侵入；④要勤洗、勤换月经带，不要与他人合用脸盆、毛巾、脚布；⑤要适当运动和劳动，促进月经流畅，不要做剧烈运动，重体力劳动；③要合理营养、充分休息，不要吃生冷和辛辣食物，不要过分兴奋。
女孩子在每次月经前后或行经期间，常有一些局部和全身的反应，如腹部剧痛、腰酸、乳胀、腹泻、便秘和疲倦嗜睡，情绪烦躁，头痛失眠等，这叫做痛经，一般不会影响孩子的学习和生活，只要解除精神顾虑，很快会过去的。也可用红糖生姜熬水（红糖50克，生姜15克），让女孩趁热服下，能够减轻症状。女孩如有下列情况，家长就应带她去医院检查，并根据医生的建议做相应的治疗：①8岁前有阴道出血，15岁后仍未来月经；②初潮后闭经半年或月经有规律后又闭经两个月以上；③月经过少或月经过多；④严重痛经，白带过多，外阴瘙痒；⑤急性下腹部疼痛，腹部有包块；⑥乳房发育过大或过小，两侧乳房有明显差异，多毛。
男孩子性发育初期的变化没有女孩那么明显，那么集中，常为家长们忽视，这是不应该的。家长要告诉孩子每月有几次遗精是自然的生理现象，不必惊慌失措，每次遗精后要及时洗换内裤，清洗阴茎。家长要教育孩子平时不要过多注意自己和异性的性器官。把注意力放在学习和健康的活动中，避免性刺激的干扰。家长要指导男孩穿宽大的衬裤，免得阴部受挤压，还要让孩子养成早睡早起的习惯，每天早起到户外锻炼。初入青春期的男孩子可能会出现包皮过长、外生殖器炎、睾丸下降不全、精索静脉曲张、遗精频繁或滑精（清醒时发生的遗精）次数过多等病症，对此家长要请医生检查、治疗。