施术者应严肃认真，精心操作。施灸前应向患者说明施术要求，消除恐惧心理，取得患者的合作。若须选用瘢痕灸时，必须先征得患者同意。在施灸前，要将所选穴位用温水或酒精棉球擦洗干净，灸后注意保持局部皮肤适当温度，防止受凉，影响疗效。瘢痕灸后，局部要保持清洁，必要时要贴敷料，每天换药1次，直至结痂为止。除瘢痕灸外，在灸治过程中，要注意防止艾火灼伤皮肤。如有起泡时，可用酒精消毒后，用针将水泡挑破，再涂上龙胆紫即可。偶有灸后身体不适者，如有身热感、头昏、烦躁等，可令患者适当活动身体，饮少量温开水，可使症状迅速缓解。
临床施灸应选择正确的体位，要求患者的体位平正舒适，既有利于准确选定穴位，又有利于艾炷的安放和施灸的顺利完成。灸治应用广泛，虽可益阳亦能伤阴，临床上凡属阴虚阳亢、邪实内闭及热毒炽盛等病证，应慎用灸法。
在施灸时，要注意防止艾火脱落，以免造成皮肤及衣物的烧损。灸疗过程中，要随时了解患者的反应，及时调整灸火与皮肤间的距离，掌握灸疗的量，以免施灸太过，而引起灸伤。对于化脓灸者，在灸疮化脓期间，不宜从事体力劳动，要注意休息，严防感染。若有继发感染，应及时对症处理。施术的诊室，应注意通风，保持空气清新，避免烟尘过浓，污染空气，伤害人体。