专科建设应以提高临床疗效为核心，以中西医结合临床实践为依托，围绕重点病种，通过总结、对比中西医治疗方法在不同的疾病和疾病发展不同阶段的治疗优势，进行最优化组合运用，达到提高疗效、缩短疗程、减少毒副反应、改善卫生经济学指标的目标。
医院应巩固各级专科建设项目成果，保持中西医结合重点专科在区域内或全国专业覆盖面广、运行机制良好、规模效益明显的优势，发挥其在技术指导、人员培训和成果推广等方面的作用，使其成为区域内或全国的中西医结合医疗中心。
四、临床工作
专科项目应根据既往工作基础确定2~3个重点病种。重点病种研究应具有鲜明的中西医结合特色并保持相对稳定，专科的主要学术研究方向与重点病种相一致。
重点病种的中西医结合诊疗方案，以提高中西医结合临床疗效为目的，体现本专科的历史积累与创新；体现中西医治疗方法对不同的疾病和疾病发展不同阶段的治疗优势，并利于临床运用；体现药物与非药物疗法的综合运用。
重点病种的临床研究要通过梳理重点病种的中西医结合诊疗现状、疗效水平、治疗难点和解决思路等问题，在总结老一辈名中医与中西医结合专家学术思想和临床经验的基础上，不断提高临床疗效；引进先进技术和设备，为中西医结合研究工作提供新的借鉴和条件；同时针对治疗难点，积极开展中西医特色诊疗方法与医疗机构中药制剂的多中心协作研究，逐步优化、完善诊疗方案。
针对专科发展的现状和需要，建立中西医结合医疗质量控制体系，在组织机构、人员设置、病种管理、临床药事、医院感染、医疗安全等方面设定标准，保证专科医疗质量的持续改进。其中，应重点评价中、西医方法针对疾病发展主要矛盾相互配合的有效干预能力、实际诊疗过程与中西医结合诊疗方案的符合率、辨证论治的优良率、中西医结合诊疗技术、中药饮片和医疗机构中药制剂的使用率、中西医结合诊疗质量控制标准的应用率等指标。
专科项目建设应明确将开展中西医结合切入点的寻找与求证作为临床研究的重点方向。学术研究应集中在对本专业疑难、复杂临床问题的破解上，进而推进中西医结合临床诊疗规律的系统研究，并逐步促进中西医结合方法学的创新，从而对本专业的中西医结合工作起到积极的示范作用。
鼓励专科项目建设的成果积极申报政府或专业学术团体的奖励。
五、人才建设
专科中中医、中西医结合人员占60%以上。
专科学术带头人应具备高级中医药、中西医结合医学专业技术职务任职资格，在区域内该专业领域中享有一定知名度，受聘区域内二级（含）以上学术团体的委员/理事（含）以上职务，熟悉本专业国内外进展和学术前沿动态，获得同行认可。二级医院可适当降低要求。
专科应充分发挥老一辈名中医或中西医结合专家的业务指导作用，继承、发扬老一辈名中医及中西医结合专家的学术经验，可聘请老中医药专家和中西医结合专家担任专科的业务顾问。
专科的人才梯队建设合理，专科学术继承人有扎实的中、西医专业基础知识和丰富的临床经验，对本专业的学术建设有创新思路，具有解决本专业临床工作中复杂和疑难问题的能力。专科其他人员应全面熟练掌握专科中西医结合临床诊疗方案和诊疗技术规范。
专科应建立人才培养规划，积极参与各级人才培养项目，合理安排专科人员继续教育、进修，定期开展中西医结合学术讲座与技能交流，提高全科人员掌握、运用中西医结合诊疗方法的能力。
六、信息及宣传
逐步建立专科信息库、专科诊疗模块及专科数据统计分析模块，运用数字信息手段，保存及应用数据信息，为中西医结合临床疗效的评价提供支持。建立信息网络，开展远程会诊。通过多种媒体形式开展宣传，展现中西医结合的技术创新与临床成果。
七、协作交流
各级专科应积极参加各级各类的协作交流，以协作组等形式开展临床研究工作。国家级重点专科应开展重点专科协作组制定的中医诊疗方案应用和验证工作。
协作开展研究的范围包括：重点病种中西医结合诊疗方案的整理、验证、完善、优化、提高与推广工作；中西医结合临床科室名称、病种名称的规范问题；中西医结合临床科室中医诊疗设备、现代设备配备标准等有关问题；中西医结合临床药物、技术、诊断方法的范围和内涵等有关问题。协作工作还应包括构建学术、技术交流平台，开展学术交流、技术协作、技术指导、技术推广和科学研究，促进专科临床技术创新和学术进步。
专科充分发挥人才优势、学术优势、技术优势，通过举办学习班、培养研究生、接收进修人员等多种途径，面向区域或全国培养高水平、高层次的专科人才，促进相关中西医结合专业人员技术水平的提高。
八、保障措施
各级专科应制定并实施建设发展规划、工作计划和发挥中西医结合特色的具体措施，并在建设过程中逐步满足各级项目在业务规模、设施设备、人才结构、诊疗方案、学术研究、经验继承等方面所设定的条件。
医院应通过医务等职能部门对专科工作进行业务指导，制定相应的管理条例与考核制度，并对照计划定期对专科业务发展、经费使用、人才培养、中西医结合诊疗方案应用、学术研究、对外协作与信息网络建设等完成情况进行考核。
医院应优先满足重点专科的病房和门诊设置、人员配备、经费投入、设施设备配置等要求，符合建设项目的规划与实际需求，逐步使其成为医院发挥中西医结合特色的示范科室。
（第五部分）临床研究
中西医结合临床研究是促进中西医结合医院可持续发展的基本动力。中西医结合临床研究以提高疗效为核心，提升中西医结合临床服务能力为宗旨。
一、目标和定位
中西医结合临床研究的总体目标是以继承传统中医药特色，发挥中医、西医两种医学的优势，探索中西医诊疗的最佳结合点，完善中西医结合诊疗方案，逐步形成中西医结合临床诊疗体系，在疾病诊疗和研究方面处于国际或国内领先水平。
三级中西医结合医院是中西医结合临床研究的重要力量，不但要承担中西医结合临床应用研究，还应围绕临床关键问题加强中西医结合基础和理论研究，逐步成为中西医结合临床研究的主体。
二、原则和方法
中西医结合临床研究应围绕临床需求，紧密结合临床工作，重视临床诊疗数据积累，探索和提炼中医、西医方法在疾病发展不同阶段的应用指征、联合应用的时机及合并症应用的选择，寻求中西医结合的最佳形式与时机，研究中西医结合最佳诊疗方案。
采用辨病与辨证相结合、宏观与微观相结合的研究思路，强化中医药理论指导、以多学科协作及方法应用为手段，以提高临床疗效为核心，探索中西医结合临床研究模式，促进中西医结合学术创新。
三、方向和重点
围绕临床常见病、多发病以及严重危害人类健康的重大、疑难疾病，结合医院确有疗效的诊疗方法和技术，开展临床研究。
研究中西医结合临床诊疗方案和临床路径，提炼总结中西医结合优势突出的病种的诊疗规律和模式，研究建立科学合理的疾病疗效评价方法和体系。
继承传统中医药精华，重视名家学术经验传承研究，开展临床疗效明显的经验方和特色制剂的研制及开发应用研究。
针对临床关键问题开展中西医结合基础研究，揭示中西医结合防治疾病的作用规律和疗效机理，为疾病的防治提供新的思路与方法，推动中西医结合在理论上的创新与突破。
促进临床研究成果转化，形成具有中西医结合特色的诊疗方法、技术和药物，积极应用和推广。
四、科研管理
围绕本院中西医结合临床研究目标，制定体现中西医结合优势的研究工作规划和年度计划，保证规划和计划的组织实施和落实。
建立符合中西医结合科学研究规律和发展的各项管理制度，包括课题申报、评审立项、过程管理、实验记录、经费使用、资料归档、考核奖惩、成果鉴定及验收等，通过制度和机制保障促进中西医结合临床研究高效运行。
创造良好的科技创新环境，鼓励和吸引多学科高端人才参与中西医结合临床及应用基础研究，保持、培养和造就结构合理、高素质、高水平的中西医结合专兼职临床研究人才队伍。
加强中西医结合临床研究平台建设，提供能满足临床需求的科研服务。抓好研究室（所）、实验室的规划和建设，有条件的医院争取创建省部级以上的重点研究室和实验室。
拓展符合中西医结合医院特点的临床成果转化途径，展现中西医结合的技术创新与临床成果，促进中西医结合新技术、新方法、新药物的临床推广使用。
五、考评和激励
健全科研业绩考评制度，建立符合中西医学结合特点的临床和科研相结合的综合绩效考核体系。根据从事研究工作量和研究成绩（包括学术论文、科技奖励、科技成果、承担项目、申请专利、成果转化等），建立结果考核与过程评价相统一、业绩考核与奖惩紧密挂钩的业绩考核制度。加强科研激励机制，制定有利于中西医结合临床研究的科研优惠和奖励政策。
（第六部分）药事管理
中西医结合医院的药事管理以提供安全洁净、质量可靠、调剂科学的中西药物为核心，以满足临床需要为宗旨。
一、药房设置
中西医结合医院的药房包括中药房、中成药房和西药房。中成药房和西药房可以设在一起，但应分区域，面积符合规定，并满足医院临床需要。