曾国藩去世的消息传出，举朝震惊。清廷追赠“太傅”，照大学士例赐恤，赏银三千两治丧。恩赐谥号“文正”，入祀昭忠、贤良二祠，并于湖南湘乡、江宁金陵建立专祠。生平政绩事实，宣付国史馆。
曾国藩小时候患有癣疾，类似于今天的牛皮癣，很难治愈。他在三十五岁时癣疾一度发作，奇痒难当，彻夜不得成寐。曾国藩一生勤勉，积劳成疾，五十九岁时又染上肝病，致使右目失明。1871年11月25日，曾国藩回任两江总督，其时已届花甲之年。他是因处理“天津教案”不利回任江督，心情十分不快。在给弟弟的家信中，他吐露心声：“余两次在京，不善应酬，为群公所白眼；加以天津之案物议沸腾，以后大事小事，部中皆有意吹求，微言讽刺。陈由立遣发黑龙江，过通州时其妻京控，亦言余讯办不公及欠渠薪水四千不发等语。以是余心绪不免悒悒。”
1872年元旦，两江总督府整修一新，迎接就任不久的曾国藩。曾国藩则无心过年，心情抑郁，身体、精神状况急转直下。几天后，他与友人闲谈时忽然右脚麻木，颓然坐地。三天后，他和老友重逢，一时激动，口不能语。他似乎也对自己的死有所预感。在去世前五天的日记中，他写道：“近年或欲作诗文，亦觉心中恍惚不能自主，故眩晕、目疾、肝风等症，皆心肝血虚之所致也，不能溘先朝露，速归于尽，又不能振作精神，稍治应尽之职责，苟活人间，惭悚何极！二更五点睡。”
1872年3月12日，南京城天气阴霾，下着密密的小雨。曾国藩在儿子曾纪泽陪同下，于总督府西花园散步。曾国藩突然感到两脚发麻，舌头僵硬，忙令曾纪泽扶他回去休息。曾纪泽将父亲扶至书房，端坐桌前。三刻钟后，曾国藩气绝身亡。
曾国藩去世的消息传出，举朝震惊。清廷追赠“太傅”，照大学士例赐恤，赏银三千两治丧。恩赐谥号“文正”，入祀昭忠、贤良二祠，并于湖南湘乡、江宁金陵建立专祠。生平政绩事实，宣付国史馆。一等侯爵即着子曾纪泽承袭。
曾国藩的师友亦纷纷表示哀悼，挽联、祭文一时堆积如山。由于人数众多，祭奠活动足足持续百天才告结束。可见曾门弟子之盛。其中，左宗棠、李鸿章和郭嵩焘题写的挽联尤为中肯，大可概括曾国藩的一生。
谋国之忠，知人之明，自愧不如元辅；同心若金，攻错若石，相期无负平生。
——左宗棠师事近三十年，薪尽火传，筑室忝为门生长；威震九万里，安内攘外，旷代难逢天下才。
——李鸿章论交谊在师友之间，兼亲与长，论事功在宋唐之上，兼德与言，朝野同悲为我最；考初出以夺情为疑，实赞其行，考战绩以水师为最，实主其议，艰难未预负公多。
——郭嵩焘