宇宙，诞生于虚无。
古代圣人兰姆-伊森在古著《暗黑之书》中记述了宇宙的起源——一颗存在于虚空之中的巨大珍珠。而在其中，沉睡着一位强大而高洁的灵体，创世神艾努。
艾努的体内蕴藏着宇宙的一切，无论是正善，光明的，还是腐恶，黑暗的物质和能量。然而，艾努希望自己成为纯洁的存在，不断排斥着一切负面能量。最终，包含着愤怒，恐惧，毁灭的七种负面能量的汇聚，在艾努的体外诞生出了邪恶的七首龙，塔沙密特。它与艾努注定是死敌。
无尽的对决因此在珍珠内展开。漫长的争斗里，艾努和塔沙密特均无法取得优势。在最后一次决战中，创世神和七首龙不约而同地用尽了全力。而带来的后果，是两具伟大躯体的双双毁灭。
然而，他们的斗争，却没有结束。
塔沙密特的碎片沉入宇宙的底部，形成了血海。邪恶的魔物源源不断地从此滋生。七颗头颅化为七魔王御统着烈焰地狱。艾努的碎片则浮上宇宙之巅，化为高等天堂。体内的五美德化成五大天使，眼睛成为宇宙的基石——世界之石。而他的脊骨，则成为不断诞生出天使的光之拱门。
艾努和塔莎密特的争斗因为高等天堂和烈焰地狱的诞生而延续下去。而双方在这场斗争中实力旗鼓相当，几乎无法分出胜负。战争持续了一个又一个千年，被后人称为“无尽之战”，即永无止境的战争。
直到有一天，一股天使和恶魔都无法理解的神秘力量干涉了这场战局。
在无尽之战中，即使是拥有无尽寿命的天使和恶魔，也渐露疲态，对看不到尽头的争战早已厌倦。大天使议会的幕僚，泰瑞尔的副将兼亲信，依纳瑞斯，作为疲倦者的一员，在无尽之战中萌生了退出的念头。恰在此时，他结识了憎恨之王的女儿，莉莉丝。她因长久地收到父亲的折磨，早已产生反叛之心。两人之后竟产生了禁忌之恋。这一切促使着依纳瑞斯进行他那改变世界格局的计划——盗取世界之石。
世界之石为于天堂和地狱的中间，它被泰瑞尔率领的天使军团重重守护。在它的外围，一座牢不可摧的据点，混沌堡垒因此而生。然而泰瑞尔尽管知道这个圣物所能做到的事，并为此做出种种防御措施，却从未想到副将依纳瑞斯对圣物的觊觎之心，直到依纳瑞斯用盗来的世界之石创造出第三世界，圣休亚瑞大陆。
依纳瑞斯，莉莉丝，在各自的领域中，渐渐笼络到一批志同道合的战友，在大天使和魔王的眼皮底下，他们进行了大胆的计划：天使方面引开混沌堡垒守军的注意力，而依纳瑞斯则率领着恶魔冲入堡垒带走世界之石。依纳瑞斯更改了世界之石的序列，利用它打造出了圣休亚瑞大陆。天使恶魔联军一同隐匿在新的世界中，用世界之石的圣力让圣休亚瑞完全匿迹。
此后，天堂和地狱双方都产生了困惑，在世界之石不知去向的情况下，双方默契地停止了战火，开始搜寻世界之石的所在。
然而，尽管世界之石的力量足以让天堂和地狱永远无法发现圣休亚瑞的存在，让大陆永远存在于安详和平之中，但依纳瑞斯却犯下了一个大错——过于相信自己的爱人，女恶魔莉莉丝。
和平安逸的生活，让依纳瑞斯他们没有了后顾之忧。他和莉莉丝相爱后产下了后代。在他的影响下，圣休亚瑞出现了越来越多的混血种。这些后代即是暗黑宇宙的第三种族，人类的先祖，奈法陵。
奈法陵继承了天使与恶魔双亲的特性，体内同时混合着善与恶，光明与黑暗，这与创世神艾努相类。双亲都为奈法陵的体内不同于自己的特性感到焦虑。而在此时，奈法陵天生的强大力量，渐渐为身为天使和恶魔的父母们所知，也成为圣休亚瑞悲剧的伏笔。
被后人称为”远古人“的第一代奈法陵，并不像无所事事的双亲。他们热衷于探索世界之石打造的大陆。圣物的力量绝对超乎天堂和地狱的想象，它所创造的世界也蕴藏着不可计数的秘密。因此，远古人开始四散在圣休亚瑞大陆上，并产生了不同的信仰。
德鲁伊的古典《久远之迹》中，记载了许多关于远古人的事。远古人中有一位名为布尔凯索的领导者，他崇尚武力，有着巨大的身躯和强壮的肉体，内心中有无限的勇气与刚毅，被亚瑞特山的野蛮人尊为“不朽之王”。而他的弟弟，瓦希利，则是不修边幅，蓬头垢面，却与大自然有着不知名的亲近。许多人相信瓦希利是德鲁伊的先祖。
伊苏，一名强大的女奈法陵，她能够从强大的自然元素中汲取能量。追随她学习的人成为了令人畏惧的凯吉斯坦女巫。
拉斯马，一个孤独的隐居奈法陵，一生都在探索着暗黑宇宙最深奥的秘密——生死学。他常年居住在地穴中，追寻人类生死的极限，并将这些知识传授给敢于进入他的地穴的人。这些人后来成为死灵法师。
奈法陵的强大远远超出了天使和恶魔的预期，这些叛逃的父母开始担心奈法陵的力量会威胁到他们并且会让天堂与地狱注意到圣休亚瑞的存在。一旦高等天堂和烈焰地狱发觉了他们的踪迹，他们必将受到严酷的刑罚。于是这些父母中出现了内讧。一部分认为，应该立即摧毁奈法陵，另一部分却认为，不应该剥夺奈法陵的生存权利。
困惑的依纳瑞斯本是静观其变的，然而，当得知天使与恶魔议会的结果，将杀死自己的孩子时，莉莉丝却变成了一个血腥的刽子手——开始屠戮那些赞成消灭奈法陵的追随者。依纳瑞斯，则不得不拿起武器面对自己过往的爱人。
最终，依纳瑞斯击败了莉莉丝，但却没能痛下杀手，而是放逐了她。然后，依纳瑞斯唤醒世界之石，启动了对奈法陵的封印，这种封印将一代一代地削弱奈法陵的后代。之后，依纳瑞斯消失在圣休亚瑞中。
千年后，强大的奈法陵相继辞世。即使是“不朽之王”布尔凯索，也只能被时间的钢轮碾碎。伟大的远古人，天使与恶魔，逐渐被他们的后代忘却。而那些后代，则成为了如今的人类。
依纳瑞斯的封印并未遏制人类数量的增多，也未阻止人类在圣休亚瑞的扩散。瓦希利的德鲁伊后代到史加斯葛兰之森开始隐居。拉马斯的弟子建立了一个巨大的地底王国。伊苏的女巫们建造了凯吉斯坦魔法学校。各种宗教也开始在圣休亚瑞兴起，神秘的法师宗族塔安和史凯兹密在东方崛起。所有的信仰被后世归为两大系统：神秘学与信仰学。
神秘学钻研“驾驭”的方法。人们想要藉由魔法及科学掌握这个世界。而信仰学则相反，他们相信命运，将自己的命运交给未知的力量来主宰，并建立一系列的道德与行动准则。
神秘学是圣休亚瑞历史上延续最久的学问之一。在凯加，凯吉斯坦魔法学校逐渐壮大，成为三个广为人知的魔法宗族：维兹贾瑞，安尼德和安姆特。其中，维兹贾瑞对圣休亚瑞之外的地方展现出浓厚的兴趣，他们相信灵魂的存在，并认为存在与其沟通的可能。因此他们热衷于研究召唤术。但由于世界之石的屏蔽，维兹贾瑞对德鲁伊及死灵法师召唤魔法的研究并不成功。
恰在此时，出现了一位得以突破瓶颈的人，贾拉·哈勒许。
贾拉是维兹贾瑞的一员，才华并非十分突出，却野心勃勃。然而命运一直不尽人意。直到有一天，他的父母，妹妹一同死在与安姆特的战争中，他心中长久以来积蓄的挫败感终于在愤怒下爆发。充满怨念的他使用了召唤术，竟成功召唤出了恶魔！
贾拉意识到了不详的征兆，他封印了那只恶魔并立即禀报维兹贾瑞长老会。但人类对力量的贪婪战胜了一切。长老会达成的共识是：将贾拉的恶魔召唤列为机密，在内部加以研究。他们妄图在造成不可挽回的灾难后撇去自己的罪名。此后，维兹贾瑞成为著名的灵魂宗族。
但他们不知道的是，因为贾拉的恶魔召唤，圣休亚瑞已经被地狱的三魔神所察。
起始，维兹贾瑞仅是不断召唤出恶魔，希望从恶魔那里学习到未曾出现在圣休亚瑞的魔法。但人类的贪婪是无止境的。随着维兹贾瑞对恶魔了解的加深，他们竟自负地妄图操纵这些恶魔，作为征服圣休亚瑞的工具。维兹贾瑞的巫师们都忽略了一个事实：每一只到过圣休亚瑞的恶魔，都把所获取的大量情报，上呈给了三大魔神。
三大魔神终于看清了人类的潜能。他们知道，人类将成为结束“无尽之战”的关键。
跨越千年，圣休亚瑞的危机终于来临！
三大魔神的肉体无法直接进入圣休亚瑞，于是它们决定使自己的意识侵入人类的梦境或是对人类产生神秘的耳语，为一些意志不够坚定的人描绘出美好的愿景。人们开始信仰这种神秘，相信它能为人类带来全新的希望和救赎。它们分别是：决心之神迪亚布罗（Diablo)，博爱之神墨菲斯托，创造之神巴尔······可笑的是，它们的真实身份为：恐惧之王迪亚布罗，憎恨之王墨菲斯托，毁灭之王巴尔。
由此，“三位一体”教成立。它们的领导者是墨菲斯托之子，路西安。在凯加，一座雄伟的神殿拔地而起，人们在其中膜拜三位一体的伟大“神灵”，浑然不知三大魔王正在烈焰地狱中嘲笑这群无知愚昧的人。
三位一体教崛起的如此迅速，以至于人们蜂拥而至，希望成为其中的一份子。但是，只有三位一体教的高层才知道他们的真面目。
三大魔神将注意力转移到圣休亚瑞里，不再多关注与高等天堂的战争。不过，三大魔王不信任他们三个以外的任何人，他们甚至没有将圣休亚瑞的秘密告知另外四大魔王。
然而烈焰地狱的魔首亦不知，圣休亚瑞中，仍存在能与他们抗衡的英灵。他就是叛变天使依纳瑞斯！