海顿的音乐征服了欧洲，包括一心想要征服世界的拿破仑。
拿破仑和海顿生前并没有任何交往，但海顿的音乐让拿破仑着迷，他对海顿极为崇拜。
1800年12月24日的圣诞节，海顿的歌剧《开天辟地》在法国巴黎首演，拿破仑在去剧院看戏的途中，在圣尼斯大街遭到暗杀，在离他二十米远的地方发生了爆炸，屋顶飞上了天，炸死随行人员四十多人，到处血肉模糊，但拿破仑却安然无恙。
暗杀并没有动摇拿破仑去看海顿歌剧的念头，他仍若无其事地去剧院观看歌剧去了。
1809年5月31日，海顿在维也纳与世长辞。这时，拿破仑的军队已经占领了维也纳。当拿破仑得知这一消息后，马上命令部队在维也纳施达茵街十九号海顿的家门前排起军队仪仗队为海顿的逝世致哀。
拿破仑还命令在圣施达芬教堂为海顿举行隆重的葬礼。他的棺椁十分豪华，拿破仑的军队握剑侍立，在莫扎特的《安魂曲》中，维也纳市民向海顿的遗体告别。他的遗体被安葬在芬兹特尔玛墓地。