在全面内战爆发前，何香凝声切切、意拳拳地呼号和平。全面内战爆发后，她竭尽全力坚决反对蒋介石国民党发动内战，谴责美国政府援蒋内战的政策及美国在华的种种暴行，旗帜鲜明，态度坚决，言词激烈。对蒋介石国民党的种种倒行逆施，更是义愤填膺，无情鞭挞。1946年11月15日—12月25日，由国民党一党包办的“国民大会”在南京举行，通过了《中华民国宪法》。中国共产党和各民主党派、各人民团体均严正声明不予承认。何香凝在1947年元旦国民党公布伪宪法之时，与彭泽民等致电宋庆龄、毛泽东、张澜、李济深、马叙伦、陈嘉庚暨全国同胞，无情揭穿了蒋介石炮制的“伪宪法”的实质。然而，蒋介石无视中国共产党和何香凝等民主派人士及全国人民的同声“棒喝”，又在美国的授意下玩弄所谓改组政府的把戏。1947年4月18日，蒋介石在南京改组其“国民政府”，抬出御用的民社党、青年党作点缀，装潢门面，给国民党一党专政“披上一件伪装的‘民主’外衣”，便宣布蒋介石的国民政府已是“自由主义政府”或“多党政府”了。这出戏刚一开锣登场，何香凝即与李济深等16人联合发表声明，深刻地揭露国民党反动派行“扩大内战”之实的阴谋。
何香凝多次理直气壮地谴责蒋介石背叛孙中山、背叛三大政策的劣迹，得到了国民党民主派人士的赞同和支持，国民党内越来越多的有识之士认清了蒋介石的反动面目，纷纷脱离蒋介石，站到人民立场上来，站到拥护共产党、反对蒋介石反动派的立场上来。1947年3月9日，李济深在香港发表对时局的意见，历数蒋介石、国民党的一系列罪状，并提出了停止内战、重开政协、成立民主联合政府的七项主张。何香凝搜集到各报登载的有关李济深《意见》的报道，“仔细研读”，并接受《华商报》记者的采访，发表谈话。当记者问及“国民党当局是否会考虑李将军的意见，是否愿意和平”的问题时，何香凝直言不讳地认为，反动分子愿意和平的希望是“那么微末”，并肯定国民党反动分子不会放弃内战政策，“我要说的话已说过好多次了，再说也不过如此，而且国民党主党政的人要接受也早就接受了”，表达了她对蒋介石、国民党反动派完全绝望的心情，充分体现了她大无畏的革命精神和为国为民的崇高思想境界。
解放战争时期，何香凝与蒋介石、国民党的一切倒行逆施行为作斗争。她揭穿蒋介石、国民党的任何花言巧语；她声援、支持反蒋求民主的爱国运动；她保持与中国共产党许多领导人的通信联系，关心中国共产党人士的安全。她实际上在反蒋的第二条战线上，配合着中国人民解放军的军事行动，并支持、指导着国统区人民反蒋斗争，为中国人民解放战争的最后胜利贡献了自己的力量。同时，何香凝争取和平民主，反对内战、独裁的主张，基本上与中国共产党的方针政策是一致的或相近的，并坚定地与中国共产党站在一起，是共产党人的好朋友，她的心是与共产党人相通的。
早在1946年12月1日，中国人民解放军总司令朱德60寿辰这一天，为了表达对朱总司令的敬意，表达对中国共产党的敬意，何香凝与彭泽民等联名于11月30日致电朱德，“欣逢六十荣寿，普海同钦”，同人“遥申庆祝之诚”，“谨电驰贺，并祝民主胜利”。何香凝在联名致电后，仍觉意犹未尽，于是，画了一幅傲雪耐霜的梅花，并题诗一首，为朱总司令贺寿。诗云：“将军花甲寿，敬贺一枝梅。凌霜兼耐雪，铁骨占花魁。春到和平日，新生万物回。”该诗发表在12月25日的《新华日报》上。这不仅是对朱总司令一人的祝福，也是对中国共产党人梅花“铁骨”精神与送冬迎春的战斗风貌的赞颂，也表达了她与共产党人的友谊。中国共产党人对何香凝也是十分尊重的。在1947年何香凝70大寿时，共产党人也积极为她祝寿，周恩来、董必武还为她送去寿轴，颂扬其高风亮节及追随时代前进的精神。何香凝常指着寿轴对人说：“他们对我很关心，很尊敬。”“我也是他们的好朋友，我敬重他们！”
蒋介石国民党穷兵黩武，疯狂向解放区和人民解放军发动全面进攻，但很快遭到失败。1947年6月30日，刘伯承、邓小平率领的晋冀鲁豫野战军主力突破黄河天险挺进中原，从而揭开了人民解放军战略反攻的序幕。何香凝观察着战场上的急剧变化，预言蒋介石“卖国求荣的霸业”必遭崩溃，而对共产党人“有力回天”兴邦充满了自信。何香凝自1927年蒋介石叛变国民革命之后，一直高擎着孙中山三民主义的大旗，主张联合共产党人。她的言行都表明了这一点。到中国国民党革命委员会成立前夕，她甚至说：“要搞就必须与共产党合作，如再搞分裂，我就不干了。”
随着中国革命形势的发展，国民党内部的不断分化，爱国民主力量逐步集结和联合，何香凝等人决定成立中国国民党革命委员会（简称“民革”）。何香凝不仅自始至终参与、指导了“民革”创建的全过程，而且一直是“民革”的主要负责人之一。何香凝、李济深等筹建的国民党民主派组织最初定名为中国民主促进会。何香凝强调，不要离开中国国民党这个名义，在她的“力争”和说服下，最终定名为中国国民党民主促进会（简称“民促”，1946年3月成立）。后又经过何香凝、李济深等人的长期酝酿、讨论和准备，在中国共产党的关怀和宋庆龄的支持下，1948年1月1日，中国国民党革命委员会在香港正式成立。大会选举了中国国民党革命委员会中央委员会，推举宋庆龄为名誉主席，李济深为主席。何香凝同冯玉祥、李章达等为中央常务委员。
民革的成立标志着在中国人民解放战争胜利在望的历史性时刻，在推翻蒋介石、国民党反动统治的共同目标下，国民党各民主派别和其他爱国民主分子实现了大联合。它继承孙中山爱国、革命和不断进步的精神，在政治和组织上同国民党反动统治集团实行公开决裂，使国民党反动势力更加孤立。
1948年4月30日，中共中央根据中国革命的历史进程和全国人民的愿望，发布了《五一劳动节口号》，提出：打到南京去，活捉蒋介石，扩大反帝反封建反官僚资本的统一战线，何香凝在香港立即表示响应。她同李济深、沈钧儒、章伯钧等12人分别代表民革、民盟、民促等民主党派和无党派民主人士，向全国联名发出通电表示竭诚拥护。
在中国共产党周密安排下，各民主党派和民主人士的代表自1948年8月起，陆续到达解放区，参加新政治协商会议的筹备工作。
当蒋介石最终拒绝在《国内和平协定》上签字时，毛泽东与朱德于1949年4月21日发布了向全国进军的命令。何香凝次日即发出通电，拥护人民解放军向全国进军，彻底消灭反动派。这期间，她还动员了一些深明大义的国民党将领宣布起义。同月，应中共中央电请，何香凝由女儿廖梦醒陪同，携孙子、孙女离开香港到达北平。在北平火车站受到朱德、周恩来、邓颖超等人的热烈欢迎。当晚，毛泽东特意在中南海怀仁堂设宴招待何香凝，欢迎她的到来。此后，何香凝在中国共产党的直接领导下，与其他民主党派人士一道，参与了缔造新中国的工作。
1949年6月15日新政协筹备会成立后，何香凝积极参加了筹备新政协的各项活动。