“我儿，娘只你一命……”身在屏幕后观看了魏泽父子对话许久的魏夫人，一见儿子将要去替死，不免心痛如刀绞，忙冲出来拉着儿子哭道。
“妇人不识大体，有何可泣？立马退出！”魏泽一见急忙冲来，压低声音向夫人吼了一声，并推倒夫人，同时送出儿子。
“此少年正是方才你藏来的孽子？”高煦如获至宝，连忙将魏子一把抓了过来，并且冷笑着问魏泽。
“王子还要抓谁人？”魏泽问。
“不用了，人犯已获，就此问斩……”高煦再三冷笑答道。
同时，高煦走到门口，接着挥刀向那少年砍去，只听那魏子惨叫了一声，倒在门边血泊中，死去了。魏夫人见了疯狂大哭起来，接着，魏泽等全家人都齐声号啕起来。高煦遂率着兵将离开了魏泽县衙，押着方府一门四百余口人犯，得胜回朝去了。
方中庸自被魏泽救后，又由天台山的义士余学葵转移到松江华亭青村，由方孝儒早年的门生俞允收养，后与俞女成婚，再转至余学葵从弟的白沙里村隐住，改姓余氏，埋名隐数代，直到明朝万历才得平反昭雪。
建文四年七月初，在京城。
孝儒的门生廖镛、廖铭等近百人，也纷纷被抓捆着押到牢中。
次日黄昏，在京城皇城外的刑场四周，人山人海。
方孝儒的父母、四个住在外地的子女、兄弟、姐妹、本家叔伯、堂兄弟、岳父母等九族共约七百余人悉数被陆续带到京师；
孝儒的门生故旧三代近二百人也已陆续被带到；
……其他未能降燕的建文旧臣人犯们也都被一个个、一批批地带到。
接着，一群宫廷仪仗队出来，在华盖下，成祖向行刑官和锦衣卫士吩咐一阵后，人马车轿从正阳门，开始向聚宝门拥去。
南京城万人空巷，从五龙桥外到正阳门转弯过通济门，再达聚宝门口，到外都是聚集和涌动的人潮，人们纷纷向前挤来，唏嘘不已，哭声震荡天地。兵士们疯狂地吆喝着，紧张地马来抢去，无法拦挡。
建文七月初。南京聚宝门前，华表高耸入云。
方孝儒头破血流，全身伤裂，被五花大绑、捆在聚宝门刑场门口，刽子手们每抓来的一个孝儒家的亲人，都要在孝儒面前被执行杀戮，几个时辰后，在孝儒的脚下，陈尸无数，是处已成一遍尸山血海。
“燕贼疯狂，无视天理国法，逆我先皇太祖，屠我朝臣国民，残无人道，旷古难见……”孝儒张着破裂的血口，含糊不清地愤怒地叫骂道，“燕贼行径，天理不容！”
“罪臣且住口……”刽子手们狂叫道，并以绳子勒住孝儒的脖子，以尖刀挡着他的咀。
孝儒的弟弟方孝友雄纠纠、气昂昂地也被捆拉着，推到孝儒的面前。孝友也将要在孝儒的面前被试斩杀。
“孝友，吾的贤弟……”孝儒见了，急忙挣扎着向弟哭道，“恕为兄不能为家光宗，却让举族蒙难！”
“仁义兄长何出此言？方家能有兄长这般大忠大义之人，万世留芳，我等死无遗憾……”孝友激动地说道。
“好……贤……弟……”孝儒断断续续地说。
“兄长且听小弟口占一绝：
‘阿兄何必泪潸潸，取义成仁在此间。
华表柱头千载后，旅魂依旧到家山。’”
孝友激动地高声吟诵道。
“我京城之内，好一对勇烈的兄弟……”人群中，突然爆发出一阵激昂的喝采声。
“待燕贼亡命之后，国人当为我而唱前朝文丞相名篇：
‘人生自古谁无死，留取丹心照汗青！’”
孝儒挣脱缚索，激动地说着，并手指华盖下的成祖，张着血口叫骂着。
“方孝儒如今幡然悔过，尚可留下性命，倘若一意孤行，朕将叫你血溅南门也！”成祖向孝儒叫道。
“忠臣……何惧生死……”孝儒继续用右手指着成祖喊叫着。
“将他的右手剁下！舌头割下！让他再指、再骂……”成祖叫道。
刀斧手上来，砍去了孝儒的右手和舌头。孝儒已成了个残缺不全的血泪人。
接着，孝儒被回拉到午朝门口。这里已陈列有三百具血肉模糊的尸体，大部分都是孝儒的亲人。孝儒被绑缚在金水桥前的一块大青石板上。他望着亲人们的尸首，仍在咆哮着，披发长啸着，向成祖哭骂着。
“将他千刀万剐……”成祖继续大声叫喊，“再施以车裂酷刑……”
于是，众刽子手一拥而上，同时举刀向孝儒斩剌。孝儒已被完全割下了双脚，只剩下一段呼呼流血的左臂还在肩下摇晃，一颗头胪挂在血肉模糊的躯干上，口里却仍在“呼呼”地溅血哭骂。
在挣扎中，由于孝儒的右手已被砍去，所以其左手镣铐铁链已经自然脱落，孝儒似乎在挣扎着往上爬。此时，一个刽子手见状突然冲上来，举刀砍下了孝儒的双腿，于是，孝儒轰然倒在地上，全身血流如注。他一边骂着，一边抬起残存的左臂，蘸着地上的鲜血，“嚓！嚓……”地在地上一口气写下十三个“篡”字后，才渐渐气绝。
“尔胆敢说朕篡夺？”成祖一见，更加气急败坏，而且又气又怕，忙疯狂地叫喊起来，“……将他车裂……”
于是，刽子手们七手八脚，将淹淹一息的方孝儒杠缚在五马绞架上。随着一声大喝，五马急向五方拉去，孝儒的残躯骨肉在刑架上，被撕扯得丝丝作响，顿时分成数块。他的血浆一股股地从其口中和腔中喷出，洒在那块大青石板上。那青石渐渐由青变红，后来竟变成了鸡血色，直到侍从清扫擦洗路台时，它仍不能恢复原色，最后竟完全变成了一块用人血染成的巨型晶莹剔透的红色人血石。
至今，此人血石仍伏在明故宫中，供世代游人观赏。人们都视之为宝石，也有人认为此石价值贵过了价值连城的“鸡血石”。
方孝儒终于成尸数块，倒在血泊中，壮烈地为国殉难了。其尸体同其他烈士的尸体一起，被兵卒们车拉人扛，穿过正阳门，越过外秦淮河，被推到聚宝门外报恩寺下的万人坑中。
当天深夜，三山门外“清明”书楼的陈老先生，含悲忍泪，将方孝儒先生的尸体拉到聚宝山下，含悲忍泪，细心地将他埋葬在万木丛中。
埋好了孝儒，陈老先生扯下自己身上的白布，盖在孝儒的坟头上，并且大哭着，咬开自己的中指，用鲜血在白布上写出一副对联：
“血染雨花鲜为痛忠魂埋十族，
声凄云树劲长留正气炳千秋。”
在葬毕孝儒之后，陈老先生慢慢抬起头，离开了聚宝山。他因连日来数起悲惨事情的剌激，已觉身心疲惫，神情恍惚。到次日凌晨，浑身疲困的陈老先生，竟手持方孝儒的绝命遗书，拖着破烂长袍，一边行走，一边大念大唱起来。那绝命词道：
天降乱离兮，孰知其由？
奸臣得计兮，谋国用犹。
忠臣发愤兮，血泪交流。
以此殉君兮，抑又何求？
呜呼哀哉！庶不我尤。
陈老先生行吟道上，神态憔悴，衣裳褴褛。他从聚宝门、抱恩寺，走到十八坊，穿过鸡鸣寺，上了旧台城，逶迤来到了神策门城楼之上。
“老先生何故如此模样？千万不能……”在城楼边，一位穿戴笠帽簑衣的渔翁见其欲纵身跳城，忙惊问道，“世事虽乱，我辈亦不能轻生！”
“世事混浊，吾心已碎，蝼蚁无力，何可救之？”陈老先生慢慢起抬头，漠然反问道。
“君不闻：虽是山河破碎、乾坤倒置……”那老翁又慨然说道，“然而，金瓯可补，乾坤终有扶正之日也……”
“唉，老丈之言差也！天缺一片有女娲，心缺一角何可补？”陈老先生凄惨地叹道，过了一会，又远望前方，叫道：“哎呀，危楼远眺，浓云谲变，水天一色，无边无际……，这一具残躯何用……”
说罢，陈老先生急步登上楼台之巅，低下头，俯瞰玄武湖水荡漾，再抬头茫茫然远望。
“呜呼，出师未捷身先死，长使英雄泪满襟……”陈老先生忽然披发大叫，叫罢，遂翻身跃入城下湖中。
此时，那渔翁闻声，悚然回头，翻身扑来，然而，其为时已晚！待那老者赶到城头女墙旁边时，陈老先生已入水中，不见身影。老者唯见目下的湖面掀起了一阵波浪，接着又慢慢地平静下来。
“苍天哪……”那渔翁也大哭着，咆哮起来。此时，一条闪电穿过长空，划破东方，然而，玄湖依旧霪雾浓浓，蒋山依旧暗云沉沉。