此外，分配给留守人员的粮食、“中储券”（中央储备银行券）、枪支、弹药和其他必需物资，则分别交给有关留守人员妥善收藏，以备应用。
收兑抗币是新四军取信于民的一项重要工作。抗日战争时期，抗日民主政府和带有准政权性质的行政机构发行了抗币。在镇江、镇句、茅东、江镇、丹阳等地流通的抗币有四种：镇（江）句（容）金（坛）丹（阳）四县抗敌委员会发行的流通券，苏皖区党委在苏南地区创建的惠农银行发行的惠农券，苏浙军区江南银行发行的江南银行币，还有苏中第五行政专员公署发行的流通券。这些抗币，既在市场流通，也可以向新四军交粮纳税，深受群众信赖。
新四军北撤时，即以粮食或银元按比率将抗币全部兑换收回，以保证群众不受损失。
三、确定留守人员
新四军北撤后，接踵而来的是如何坚持斗争。斗争需要力量，经过慎重挑选的少量留守人员和没有北撤的众多党员，便是坚持斗争的主要力量。认真做好这方面的工作，是坚持斗争取得胜利的组织保证。
留守人员不在于多，而在于精。苏中五地委召开的北撤会议精神要求：
1.除少数面目不红的党员干部和精干的武工队员留守原地坚持斗争外，所有党政军人员全部撤到苏北解放区，有的面目较红的不脱产党员可自行设法转移到外地隐蔽。
2.撤销县区党政组织，改设特派员制和留守处。并建立甲、乙两种党的组织系统，分别开展活动，以利于隐蔽坚持，保存力量。
3.选派留守人员必须具备下列几个条件：政治立场坚定，思想作风正派，斗争经验丰富，还要有较好的群众基础和社会基础。
根据上述留守人员条件，镇江县选派周忠（原任县委组织部长）等12人留守坚持，其中2人有社会职业作掩护。此外，又挑选了有社会活动能力、在镇江城里有隐蔽生存条件的朱亮，送至苏中五地委城工部短期集训后，派往镇江城里开展合法斗争。丹阳县的留守人员有宦德胜等11人。茅东县留守人员有张仲英（原任县委副书记）、薛晓春等8人。1946年2月张仲英被捕后，薛晓春任茅东县武工队长，负责茅东县的留守坚持工作。镇句县由于国民党军队已经进驻，来不及从容部署，只留了胡英（即左冰，女）等5人留守。10月，江镇特区工委建立乙种党组织，由秘密党员坚持原地斗争。1946年1月29日，陈冀（原任中共江镇特区工委书记兼办事处主任）率7名北撤干部和江都县（1945年上半年由江都河南地区与江镇地区合并建立）县总队第二连部分战士回到新老洲开展活动。
对于没有北撤的党员，其组织形式有两种：“甲种组织”镇江等县称党的“单线组织”；江镇办事处称党的“乙种组织”，由秘密党员方海清在新坝镇（今属邗江县）开设的方记源裕荣杂货店为秘密联络站，联络线有23条。和尚洲的乙种党组织联络员是倪其明。镇江等县的单线组织严格规定，党员之间只准发生纵的个别联系，不准发生横的共同联系。这种单线组织，在原党支部因斗争形势严峻而无法开展集体活动时，党的单线联络员可以通过个别联系的方式，配合留守人员开展个别的秘密斗争活动。党的单线联络员名单，由各区区委报送县委组织部审查批准后个别通知任命。
（第三节北撤路线、次序和过程
一、北撤路线
丹北和江镇两个地区的大小渡口甚多，是新四军南下北上的桥梁。为了有利于调配船只，防止行军过程中个别渡口发生拥挤现象，规定了有关县的北撤路线（特殊情况例外）。镇江、镇句、丹阳的北撤干部，从镇江县大港镇以东的王家山嘴和龟山头附近渡江。经新老洲到达苏北的兴化县集中；茅东县的北撤干部，由常州越过沪宁铁路，经丹阳界牌镇黑木桥渡江，至苏北泰兴县黄桥镇集中：江镇办事处的北撤干部，直接在其辖区内的新老洲渡江北上。
二、北撤次序
丹北和茅山地区的北撤次序，先路（铁路）南，后路北；先武装部队，后地方干部；先地级机关，后县级机关。每个县的北撤工作，则根据各自北撤人员的具体情况，依次进行。镇江县的北撤工作，先后分三批进行：第一批是怀孕的、有孩子的女同志和生病的同志，他们由地级机关的后勤部门统一安排后，于10月15日随同县独立团撤离县境，这批人员为数不多。第二批人员最多，于10月中下旬撤往苏北。镇江县委书记程中和县长赵文豹因为要接送过境的人员，所以最后北撤，同行的有警卫、后勤等约20余人。他们分乘两条小木帆船，由王家山嘴渡江，经高桥撤往苏中二地委驻地兴化。
三、北撤过程
10月3日，苏浙军区部队及地方干部开始北撤，首批经扬中渡江，到泰兴县天星桥附近各港口登岸。一时间，长江岸边，百余艘船扬帆北渡，江面上百舸争流，往返不息，日夜不停，构成一幅壮观的新四军北撤画卷。扬中组织专门工作班子，日夜忙碌，为北撤转运服务。为加快渡江速度，“中安号”客轮日夜来往于中心沙与七圩港之间。10月15日，转运工作即将结束，“中安号”客轮满载苏浙军区第四挺进纵队政委韦一平率领的党政军干部、战士、民工近千人，由荫沙口开往七圩港，因船体陈旧、舱底漏水，加之超载，不幸在距天星桥西南约4华里的江中沉没，除少数人泅水上岸外，韦一平等800余人遇难。“中安号”客轮翻沉以后，扬中县委、县政府立即组织木船，加紧渡江转运。
苏浙军区大部队5万余人渡江后，10月下旬，钟国楚率苏南一分区指战员从新港过江到扬中，再从万福桥北撤，在江都嘶马上岸。10月31日，丹北地区党政军人员开始北撤。当日，韦永义率领第五分区特务一团、特务三团和各县独立团大部撤至江都境内待命。《前进报》社和军分区设在扬中的榴弹厂、被服厂、烟草厂也随同北撤。11月5日，扬中北撤人员开始行动，午后，扬中独立团指战员和扬中县直机关一部、三区党政干部在长旺扁担沙集中，一、二区北撤人员在指定地点集中，等候大部队途径时插入一同北撤。北撤前，扬中有不少有志青年积极要求参军，全县上下掀起参军热潮，扬中独立团一下子扩大到700多人。
11月5日，正好是农历十月初一。丹北地区有个风俗，称这一天叫“十月朝”。“十月朝”，家家吃红豆糯米饭或糍粑。扬中人民这天用糯米糍粑、红烧羊肉送别亲人。许多村庄里都飘散着一阵阵糯米糍粑的香味，弥漫着香喷喷的红烧羊肉的肉香。乡亲们与北撤人员在一起边吃边依依话别。吃过午饭，县独立团、县直机关和部分区干部600余人组成的北撤队伍，集中出发，部队浩浩荡荡经老郎街、兴隆镇、三茅镇、公信桥、新坝镇，向万福桥码头及其附近港口进发。沿途百姓，扶老携幼，送别亲人。这中间，有不少是父送子，妻送郎，亲切话别的场面十分感人。有位叫王德文的触景生情，作七言律诗一首，由王坚挥笔书写在三茅镇原伪县政府的墙上。诗日：
征途尘土蔽斜阳，战马奔腾士气昂。
群雁南飞黄叶落，三军北渡赤旗扬。
当年浴血开新宇，今日挥戈过大江。
若果和平遭践踏，誓除顽贼再还乡。
傍晚时分，北撤队伍到达江边。夜色中，队伍分别在万福桥、丰乐桥、戚家港三渡口上了木船。北撤人员站在船头上，与送行的乡亲挥手告别。船工扯满风帆，船队向北驶去。至11月中旬，苏中第五地委、第五专署、第五分区胜利完成北撤任务。
镇句县紧靠南京郊区，斗争形势变化特别快。9月下旬，县委在召开向各界人士告别会议时，会未开完，国民党军队已到达镇句县。在紧急情况下，由县委组织部长贝纹（女）化装成农村妇女，前往句七区、宝华区通知北撤，这两个区的干部没能按原线路北撤。只能兵分3路绕道上海、安徽明光、丹北撤往苏北。
至11月中旬。镇江地区各级党政军机关干部、战士与抗战八年中并肩战斗的镇江人民挥泪告别，分两批基本北撤完毕。北撤干部2000余人，武装部队3000余人，全部到达苏北。