初十日，藩与左武卫林胜密议：『先取许隆（龙），牵其船只，破其巢穴，免其出没海上，使我师北征有南顾之虑』。胜曰：『然』。即令林胜密寻向导，以胜澄海人，隆（龙）近邻也。传令行军北征。中后提督并右武卫首程，先行俱泊围头，本藩同左武卫、左右虎卫等镇开至浯洲，星夜溜下，不及会〈舟宗〉，恐许隆（龙）侦知逃走，出其不意故也。许隆（龙）敢于作逆，以港门内深外浅，非深识港路，船多阁破。此日洪水〔不知〕缘何涨满，藩督舟师直捣其港，各镇至次日方知溜下，惟亲军镇先到，所得辎重米粟不计，船只分发各镇配兵，许隆（龙）仅只身率众而逃，焚其巢穴而回。时军中谣曰：『亦衆亦溜，后行先到，铁人着做，一出便好』。以本藩实有意披挂也。时后到诸镇获粮未（无）几，藩令各师沿路取粮，并令攻克澄海县。虏守将刘进忠、副将高进威等率兵千余献城迎降。知县祖之麟、典史江景云亦揭家投诚，藩加（嘉）纳之，随驾回思明，各赏赉有差。随以刘进忠任后冲镇事。时后冲镇华栋病故，令进忠任后冲镇事。忠系辽东人，入满籍，藩恐未知我军中事宜，令材官曾馗管坐营中军事。
五月，藩驾驻思明州。
初二日，通行各提督统镇自行挑选兵将，出征大举，谕云：『本藩选将选兵，用心有素。察现在官兵，俱京（经）挑选训练，随征多年，个个堪以自信。但精而益求其精，选之中又加选。兹大举杀虏，对垒在刻，思临敌之际，成败呼吸，惟前驱首当其锋，胆勇成列，则心力俱齐，无坚不摧，何敌不克。今再行精选，分为三等：以最上者为上上，又上次之，上中次之。平日区别既定，临机便于调拨，此是制胜要着，大家功名富贵所系，定限甘结回报』。
初六日，又再通行选将，谕云：『兵之勇怯在乎将领。如将领稍却，则兵虽勇，亦不肯向前。如将领敢勇，虽弱兵必勉力赴敌。所谓强将之下无弱兵是也。故兵贵精而将尤贵乎选，最为当今切要。本藩屡京（经）通行面谕挑选矣，但恐有一二徇情，明知不十分胆勇，而故旧牵挂，不忍摆换。夫知故则可优以赏赉，别行委任，至于管兵，万万不可轻易。兹特着各提督、统镇再加察选，将领要以胆勇为上，束兵次之。互相公结，如有十分胆勇，不敢保结，即详换补。至于临敌之时，将领退却，将原结连罪重处。各取其结回报存案』。
传各提督、统领整备船只、器械、粮食，以便听令北征。以前提督黄廷总督防守思明州军机事务，与兵官忠振伯计议而行。其兵粮移居守户官郑泰支给候报。吊（调）左军辅明侯林察为居守工官。时左军官兵分配水师，冯工官已吊（调）出征，故令林察为居守工官。其防守海门、新城、泉港等处，俱照原防守镇而行。拆白沙城，令援剿前镇戴捷官兵配船，仍旧防守白沙等处。
初七日，重布出军严禁条令传示：
『照得恢复伊始，信义为先，故逆者剿之，顺者抚之，剿抚分明，所以示大信、伸大义于天下，此诚今日之要着。如严禁奸淫、焚毁、虏掠、宰杀耕牛等项，本藩已刻板颁行谆谆，不啻再三。尔提督统领镇营，劳征苦战，十有余年，所为何事？总从报国救民起见，亦为勳名富贵、后来子孙计。况奸淫焚掠等项，皆犯造物所忌。为将者积阴德于冥冥之中，为子孙长久之计，不特为救民地，又是自家分内事耳。虽兵丁繁众，纷纷不一，然在上之戒缉必严，则在下之奉行惟谨。如提督用心禁缉，各提督循而行之，各镇营又从而效之，以至副翼及大小将领，莫不整顿遵依，且互相告诫，互相结获，如是而令无不行，禁无不止，四方闻风向化，百姓壶浆迎师，仁义何尝不利乎？若泛视悠息，以致兵丁违犯，归罪于上，累及身家，明有王法，幽有鬼责。繇（由）此观彼，果孰得而孰失？从今之后，尔提督统领镇营，凡京（经）过及屯札地方，务要遵依明禁，翕然画一，以共奏恢复之大业，而享无疆之福泽。今将历颁条禁，开列于左。本藩令重如山，有犯无赦，各宜着实凛遵，毋得狃为故套也！
计开：
一、就地方取粮，亦不得已之役。官兵只准取粮，不准奸淫掠掳妇女。如有故违，本犯立即枭示，大小将领一体从重连罪；不论镇营官兵役伙人等，有能拿报首明者赏银五十两。
一、攻剿地方，有附虏十分顽抗负固者，攻破之后，明令准掠妇女，以鼓用命，以示惩创，不在禁内。如系虏据不服，百姓罪有可矜，如无发明令掳妇女者，不准掳妇女在营在船。如有故违，本犯枭示，大小将领一体从重连罪。不论官兵役伙，拿解首明者赏银三十两。
一、掳掠妇女在营，必难瞒同窝铺之人，如致察出，本犯枭示，同班同队连罪，尽行枭示。若班队中能攻击首举，不但免罪，仍照格给赏。
一、掳掠妇女在船，必难瞒在船之人，如致察出，本犯枭示，本船舵梢尽行枭示。若本船能攻击首举，不但免罪，照格给赏。
一、发剿抢地方，非奉明令焚毁，一切严禁，不许擅毁居屋。敢有故违，本犯枭示，大小将领一并连罪。不论镇营官兵役伙，拿报首明赏银二十两。
一、出征船只，各舵梢俱要请给号布，以防混冒。如无号布，将船没官，舵梢枭示，家属发配。有能拿报首明者，赏银十两。
一、发剿地方，非奉明令，不准掳掠男子为伙兵。如有故违，本犯枭示，将领连罪。有拿首明者赏银二十两。
一、严禁混抢。沿海地方，多系效顺百姓。官兵登岸之时，不准混抢，致玉石俱焚。须明听号合。如有未令，敢有擅动民间一草一木者，本犯枭示，大小将领连罪不贷。
一、禁宰牛。农业，民生大本；牛畜，耕穑重资。若肆牵宰，民将失业，不惟百姓俯仰无资，而且军糈重赖。自今以后，不许牵取宰杀。敢有故违，本犯枭示，将领连罪。
一、官兵出征，派有船只载运，各官兵不许借坐给牌商船。或奉本藩吊（调）借，公事完毕，立即放回，毋得刁难。如违，致船户禀报，本官兵枭示，将领连罪不贷。
以上禁条，如荒淫、掳掠、焚毁、假冒等项，诚恐巡缉官兵耳目不周，另悬赏给。至于混抢、宰杀等项，已着各镇营轮流巡缉，难以漏网。但有能拏报禀明者，亦分别录赏。各项禁条有犯，断断无赦。但官兵不识字，着副翼司哨书记逐队解说晓谕遵守』。
十三日，藩督师思明，开驾北征，缘阻风逐浪衆上。至二十一日，驾到沙关，风雨未顺，驻札十数日，官兵乏粮，议就温州界属登岸，攻复郡邑，取足粮食。
是月十四日，行营潘户官跟〈舟宗〉北征，船到围头阁礁，溜回思明备整。至夜分，搬移女眷上山，遇前提督守水兵盘问，语言来往不逊，疑为回来搬眷归虏。中军翼将郑进随报前提督，将潘户官并家眷船只羁留，驰报本藩。藩疑信参半，赏郑进银五十两，前提督壹百两，以防守严谨，令押送户官到军前，其家眷谕令照护，不阿不纵可也。自是文武不和矣。
六月初四日，藩督师从前歧港登岸进取，繇（由）分水关达平阳县，县界有大溪，达金乡卫入海，流水湍急，先令小艍船渡载过江。
初七日，大师进至平阳县，传令冲锋架梁，副锋取粮，并办攻城器梖。藩了见伙兵至城下，拆料造云梯，守虏并无发铳，随集诸将议曰：『此城可无容攻，招之必降。不然，岂有听我兵搬取城下乎？此城若降，瑞安咫尺相望，必无拒理，省了一番残害，我兵亦得取粮足食，亦云幸也』。即发谕令张五军同马提督招之。
十一日，守将车任暹果献城投诚，城中抚绥，草木不动。随师进札瑞安县，令车将招之。
十三日，艾诚祥率部窦奉先、杨志道等亦献瑞安城纳款。藩喜二将胞厚雄大，善骑射，有福将器，甚礼待之。
是月十四日，行令各官兵，取足七个月粮食。仍着监督监营传取足额，以城邑归附，不用防备杀虏，且近水易载。候十五日有令，载往三盘卸贮。如无足七月之粮，究处将领，后各镇俱报足七个月粮。
铁骑镇把臣兴病故，以黑云祥管铁骑镇事。
十六日，藩督师进围温州，虏坚守不敢出敌。是月风雨大作，藩驻营温之南门外高山古塔边。一日，同各镇在塔前设酒议事，会风雨大作，方宴毕起送各镇归营，忽一迅雷从塔前筵边奋起，烟黑震动，移时方散，打死本处民夫二名，藩与我众官兵俱无碍。传闻温州城内，亦知天意所钟，侦报颇有顺意，诸将俱加额庆贺。是晚，藩出营边，闻民夫答语此一老人云：『此亦天意有在，若尤（犹）宴聚不动，恐亦难矣』。藩闻语会意。次日，集各镇议改温州之围，亦以民夫「亦难」之语述之，随传令收军下船。
二十六日，前提督报：『虏来札白沙，意欲窥犯思明，被援剿前镇率兵杀败，获马匹、军器不计，自是虏不敢犯，无烦藩主南顾之忧。居守一勳，合启请赏』。
七月初二日，藩督师开驾往舟山驻札，官兵出征日久，未有操练，遂令各镇逐日就舟山教练。委礼都事蔡政办祭戎政陈六御、前镇英义伯阮骏等并阵亡将士，仪礼备至，三军感泣。
初九日，陞赏车、艾二将帽靴、斗牛服、玉带各一，俱都督同知职衔，花红银各四百两。部将窦奉先、杨志道、姚来太、崔官、王虎、史大盛等，各陞赏有差。
十八日，藩移师食盐澳驻札操练，以风信不顺，特移师候风。
八月初九日，藩驾至羊山。先数日前，问引港都督李顺，水路远近，港门山屿流水何如？顺曰：『舟山至羊山，鸡鸣开驾，好西南风，午后便到。此处有二山，不甚高；一名猴山，俱系猴而无羊；一名羊山，系羊而无猴。无人居住，有一古小庙迹，传称祀羊山王，囗灵应，每泊船必祭祀』。又称：『海中有蒙、瞽二龙，泊船不可金鼓献纸，恐其惊动翻觉也。凡有泊船，不祭而金鼓献纸，船多不平安』。藩曰：『焉有此理？光武涉滹渡之河，金人渺混洞之水，天意有在，岳渎为之效灵。我提师望复神京，以为社稷，涉历波涛有年矣，未见如此妖氛也』。不信之。是早鸡鸣开驾，风平浪恬，至午果到羊山。传令寄泊候〈舟宗〉。坐驾泊山下。越初十日午，各提督来见。藩过六中军船议事，见黑云微起，风转不顺，催各镇归船，传令小船阁山、大船多寄椗湾泊去后，藩随过新中军船。不移时，即风起浪涌，迅雷电闪，雨大如注，昏黑，对面亦不相见，只闻呼死呼救、拆裂冲击悲惨之声。时管船都督陈德跪告曰：『六中军近在此边，今不见矣。风涛异常，本船囗棕椗三条俱断，今卸一旧草椗去，未知何如？藩主上应天生，请上拜棚拜告，看囗风息浪，救此数万官兵』。藩叱之。以天意有在，岂人所能求祷？移瞬，椗手又报草椗又去一股。时太监张忠等与各官俱跪求哀劝，藩姑从，就船四拜，随云收雨息，波浪稍恬。自午至酉，方始霁静。遂令人查访，六中军船已不见，惟船枋漂阁在岸矣。船中失去六妃嫔并二〔舍〕、三舍、五舍三位，余男妇老幼梢兵计二百三十一人，俱没水中，惟存一老婆及老梢浮水逃生。藩发一笑，令各收尸埋葬。
次日，天气清光，有报失船失兵者，有报失将者，有报漂流未知去向者。现在澳没失左冲镇林灿、行营兵官史兴明、正典膳洪涓，余如副翼司哨，生死未知者尚多。遂请各提督统领来会，有称坐驾阁破在山、衣食飘流无存者，有称逃过小船、坐驾漂出、未知存没者。时见各提督统镇呵惨之情，藩令太监张忠、王守礼将所带行营衣服，一尽付出，分送各一二件、三四件不等，仍分发南将金二锭、北将金三锭，以慰劳之。言曰：『前李顺对我言羊山之怪，我不信之，今岂是也？以后传如李顺而行，宁信有、勿信无也』。又曰：『今船只兵器损失，长江难进矣。须溜回舟山收拾，再作区处。其失船官兵须并载而去。马载不去者，暂寄山养饲，候明年来牵，尤肥壮些。速归收拾』。仍令各差小哨，逐屿巡视，有官兵阁破漂上山屿者，逐一载来。限次日起程。
十四日，藩督师回到舟山。时各船有被飘先至者，有别屿随后收入者，逐一查点时，未见七中军船、灵熕船，并报左虎卫左协黄安未到。藩曰：『此人沉厚温默，尤未可量，岂至死耶』？次日，林胜报黄左协坐船杠梖俱失，飘二日夜入普陀港。藩令随囗船往载之至，随委署左冲镇事。管七中军船欧秉敬来见，责以离〈舟宗〉私逃，杀之。并杀练勇营廖达，以其在船同逃也。达系平和人，自关中跟随，颇晓操练教法，凡军中教操艺，俱委任，至是杀之。管灵熕曾铣报船阁破羊山外屿，其灵熕被泥压没不见。藩委阮美等拨赶缯捞拾得之。曾铣并杀，以儆不谨。此灵熕重万斤，红铜所铸，系外国夷字。戊子年杪，定国府入揭阳港，夜半发芒光，定国见而疑之，至次夜又见，定国随令善没者入捞之，出云：『一条光物，约丈余，有两耳，其大难量』。定国再令善没者详视，出回云：『系熕铳，两耳二龙』。随传令船中用〈糸索〉绞起，顷刻即进船上。定国即造熕船，载运教放。容弹子二十四斤，击至四、五里远。祭发无不击中。揭中顽寨并门辟虏炮城俱被击碎，远近闻风，俱云神物，后送归藩，多助效灵。
九月，藩驾在舟山，集各将议曰：『官兵船只破损，粮食不足，须溜入温、台各港，夺船取粮，再图进取』。诸将各依而行。遂传令初七日开驾，初十日至象山县取粮，令谕守将归降，不降则攻破屠略。其温守将、徐县官即遣里老生员送猪酒犒师，并具启陈禀云：