新疆者，位于西藏、青海之北，有天山横贯其中央。天山以北曰伊犁，与俄之中亚细亚诸部毗连。回酋白彦虎倡乱之时，俄遂乘机掠其地。伊犁之乱方亟，俄商适有被害者，俄乃甘言告清廷曰：“回逆暴动，杀害商民，恐伤两国友爱之谊。俄为保护商民起见，不得不设重兵以镇压之。”旋命哈夫士克将军抵伊犁，时用威杀，时而恩抚，各路士民畏其威而怀其恩，渐入其牢笼而往归之。俄既占据伊犁，又甘言告清廷曰：“回逆未靖，恐不免扰累边界；暂领伊犁，事后当归还也。”同治七年，左宗棠率湘淮劲卒勘定陕甘，乘胜出关，克复乌鲁木齐以扼重要，克复吐鲁番力争南路诸隘，剿抚兼施，诸城次第平靖。乃创规复伊犁之议，促驻札边境之俄官将伊犁交还。俄官背负前约，左公挟兵力以争之，留守新疆，历久而不能决。清廷乃于光绪五年，遣全权大臣崇厚使俄议索回伊犁事。两国使臣会议于拉哇基，崇厚为俄使所胁，允割伊犁南境之天曀须河流域归俄，且偿军费银五百万卢布。及崇厚还京，朝议哗然，左公尤赫然震怒，会同廷臣交章论劾，谓崇厚奉使无状，擅订割地之条约。乃立逮崇厚治罪，改派曾纪泽为全权大臣，赴俄廷再议。
是时俄人增兵伊犁，而遣军舰游弋海上，声言决裂以为要挟地。而李鸿章力主割地，痛诋左公昏耋，酿成兵战之祸。俄将考夫门力主还地，建言索取赔款，以充铁路之用。曾氏意见，又与李氏大相反背，逆揣俄人之必不出于战，坚执索还伊犁之说。左公亦日治战备，扼住俄舰之东下。英相格兰斯敦劝清廷议和，且以俄国东方之兵力与其制胜手段来告，清廷允其请。然俄卒不敌左公强硬对外之主义，仅以九百万卢布赎还伊犁，而两国之和议乃成。其重要条件如下：一清俄二国境界，从白奇脱岭沿克尔俄斯河，自此河而进至注入伊犁河之处，更进至横断伊犁河而达于南方之乌森脱岭；二清国偿还俄国占领费用九百万卢布；三俄国于清国各地得有设置领事之权，且俄国人民于伊犁得有土地权，与各种贸易所有特权。