正当卡耐基的事业欣欣向荣之际，南北战争爆发了。南北战争打响于1861年，结束于1865年。它是美国历史上的又一个重要里程碑，是林肯总统领导的解放黑奴的一场战争。
美国到南北战争前夕的1860年，工业总产值已跃居世界第四位，仅次于英、法、德三国。北部逐渐形成了以雇佣劳动为基础的资本主义制度。盛产棉花的南部则是以黑人奴隶劳动为基础的种植园奴隶制度。两种制度的冲突，导致了南北战争。
南北战争的南指维护奴隶制的各州，它们从美利坚合众国分裂出去，组成一个“邦联”；北指反对奴隶制的各州，又称“联邦”。战争以南军战败告终，从而废止了奴隶的制度，所以这一战争又称为奴隶解放战争。内战后随着黑奴的解放，南方的种植园大部分遭到了破坏。这样就为在南方建立工业创造了条件。不久南方就出现了许多纺织厂和其他工厂。从内战到第一次世界大战之间，美国的工业惊人地发展起来。在那半个世纪里，美国成了世界上领先的工业国家，比任何其他国家生产更多的煤，更多的铜、铁和钢，在棉纺织工业方面胜利地向英国的领导地位挑战；铺设起比欧洲全部铁路更长的铁路。马克·吐温在小说中称这段时期为“镀金时代”。
在这种大好形势下，卡耐基大显身手，大力投资制铁、炼钢业，后来，他掌管的工厂生产的钢铁占全美国总生产量的一半以上，从而获得“钢铁大王”之誉。卡耐基的事业就是在内战后50年中，蓬勃发展起来的，这半个世纪是美国的十分光辉灿烂的时代。
由于宾州位于北军的辖境，战争一爆发，宾州铁路公司的员工有许多被征募入伍，卡耐基和司各特先生都在其中。司各特在军中被任命为陆军运输部副部长，卡耐基奉命担任他的助理。他们一起到了华盛顿，这里是j匕军的大本营和首部，紧靠弗吉尼亚州东北边境。当时卡耐基的工作是负责军用铁路和军用电信的管理和营运，同时也必须将参军的铁路员工编入铁路部队。
战争进行得如火如荼，形势千变万化。临近战线的边境马里兰州虽然留在北方的联邦内，但有许多支持分裂的奴隶主在这个州内暗中活动，他们主要是破坏桥梁及铁路，使北方无法运兵上前线。有一天，一列满载北军部队的火车通过马里兰州的巴尔的摩时，就遭到南军游击队的袭击，游击队还破坏了铁路，切断了巴尔的摩通往华盛顿的交通。北军肃清游击队后，卡耐基立刻率领铁道兵赶到现场抢修铁路，经过几天不眠不休的奋战，火车终于能够畅行无阻。卡耐基坐在修复后第一列开往首都华盛顿的火车的机车内，注意前方的路况。突然他发现两旁的电线被人用木棒钉在地上，这一定是南军游击队为了干扰北军的电信而故意做的，卡耐基立刻命令停车，跑下去想拿掉那些木棒，由于电线拉得太紧，当他拆木棒时，电线突然向上弹了起来，猛然地打中了他的脸部，他被打倒在地，脸上流了很多血。
经过紧急治疗后，火车继续前进，终于到达了华盛顿。卡耐基虽然受了伤，但他内心感到十分光荣，因为他像前方的士兵一样，为国家流了血。战争开始后不久，南方邦联就将南方的首都从阿拉巴马州韵蒙哥马利迁至弗吉尼亚州的里士满，新都在华盛顿以南仅160公里的地方，因此成为北方联邦的首要攻击目标，弗吉尼亚州也成为南北战争的主要战场。
随着北方军队向弗吉尼亚州推进，卡耐基也带领一队铁道工兵来到弗吉尼亚州的亚历山大城。这时，第一次牛奔河之役爆发了，这次战役是南北战争中第三次战役，也是主要的大战役之一，当时北方人民的战斗情绪很高，他们要求林肯政府迅速开始军事行动。报纸上提出“向里士满进军”的口号。1861年7月中旬，一支3.5万人的北方军队，在麦克道尔将军率领下，离开华盛顿向南进军，目标是里士满，但为了保护其后卫军，必须先攻占马纳萨斯铁路交会点，此地位于北方首都华盛顿西南48公里处，南方邦联透过华盛顿的情报得知麦克道尔的意图，早已完成了军事部署。南军将领博雷加德率军二万人驻守马纳萨斯，另一南军将领约翰斯顿率九千人驻在温切斯特，两军相距50公里，互相呼应。
1861年7月21日拂晓，北军进攻马纳萨斯的战斗开始了，战斗在牛奔河畔展开，故称牛奔河大激战，这次战役在历史上极为著名。最初北军的进展颇为顺利，士兵大多数表现得很勇敢，所以博雷加德的部队在北军的攻势下几乎招架不住了。但是由杰克逊将军所统率的弗吉尼亚军队以及驻守温切斯特的约翰斯顿部队突然赶来援救。南军马上振作起来，特别是杰克逊指挥的军队像“石壁”一样挡住了北军的猛攻。结果南军转败为胜，北军匆忙撤退，由于军队缺乏训练，这场撤退变成了大溃退，死伤惨运。但由于天气恶劣，南军没有乘胜北上直取华盛顿，坐失良机，这是南军犯下的一个致命错误。
卡耐基率铁道兵参加了这次战役。北军战败时，他为了疏运逃命的士兵，动员了所有的火车头和车厢开往前线，这时候他的部下个个豪勇奋战，毫不退缩，因而救出许多将官士兵，获得上级的赞扬。
这次战役后，北军内部产生了两派意见，一派主和，一派主张继续战斗。战事一度沉寂了下来。卡耐基再度回到华盛顿，与司各特先生一起在陆军大本营服务。当时卡耐基负责铁路及电报两部门的工作，因而有机会经常和林肯总统晤面。
林肯是一位伟大的美国总统，他在美国历史上最危急的历史关头和最艰苦的条件下领导美国人民进行一场维护进步与统一的斗争，推动了美国社会的发展。
林肯坚持奉行一切人生而平等的原则。倡导“民有、民治、民享，其思想闪烁着民主主义的光辉。他坚定不移地反对奴隶制度，发布了废除奴隶制的“解放宣言”。林肯还具有坚韧不拔的精神力量，他勤奋好学、谦虚诚实、克己奉公、平易近人。卡耐基对林肯的印象是，这位总统无论和任何人谈话，态度都很平易自然，而且语气也极为亲切柔和，即使办公室的工友，他也一视同仁。曾有一位官员说：“没有任何人能够当林肯先生的仆从，因为他立刻就会变成林肯的朋友。”
卡耐基认为林肯的五官极为奇特，是他所见过最丑陋的人，但是当林肯遇到兴奋或激动的事情，或为某件事沉思时，他的眼睛就会流露出智慧的光芒，下巴收缩，而变成世上难得一见的美丽脸庞。
与公众尽快结束战争的愿望相反，南北战争变成了一场消耗人力和资源的持久战。宾州铁路公司也因为战争的影响，业务十分繁忙，一直盼望司各特和卡耐基赶快回去。于是他们向华盛顿政府申请复员，不久获得批准，他们便分别回到了原来的工作岗位上。
卡耐基回公司后，因为从军时过于劳累，身体十分虚弱，因而患了有生以来第一次严重的疾病——日射病。患这种病的病人天气酷热时不能外出，不然的话，就会昏倒。于是，卡耐基向公司请假休养一段时间，公司批准了。卡耐基便携同母亲于1862年2月，回家乡苏格兰养病，因为当地夏天气候很凉爽。
他抵达故乡丹芳林后，第一个感觉是所有的景物都比他想象中的小，街道上的房屋好像小人岛上的房子，这也难怪，他离别家乡是个13岁的小孩，可现在已长大成人了。
只有一样东西没有变小，那就是那栋古老的大寺院，它仍1日那么巍峨庄严。寺院的钟声把他的心灵拉回到了值得怀念的童年时代。
他们回故乡就住在罗达叔叔的家里。叔叔仍毫无改变，他是安德鲁·卡耐基的精神启蒙导师，使他在8岁时，就成为幻想家、爱国者，甚至是诗人。
在故乡休养一段时期后，卡耐基恢复了健康，他和母亲告别罗达叔叔和其他的乡亲，搭船返回美国。
卡耐基回到宾州铁路局匹兹堡管区的那天，受到盛大而热烈的欢迎。管区的铁路人员整齐排列在铁路的沿线上，当他乘坐的火车通过时，他们不停地大声欢呼，迎接他的归来。平素，卡耐基待下属十分友善和关怀，所以他们利用这次的机会来表示感谢。俗话说：“爱人者人恒爱之”，这真是千古不易的真理！
首次创办实业
从1864年开始，卡耐基除了在铁路公司服务外，还一边自己创办工业。他选择投入的是冶铁业，这是因为他所在的宾夕法尼亚州是美国最早建立冶铁业的地区，早在1728年，宾夕法尼亚州就出口了274吨生铁。而他居住的匹兹堡市位于苏必利尔湖富铁矿和宾夕法尼亚无烟煤矿之间，是最适宜发展冶铁业的地点。内战末期，美国一半以上的钢铁和三分之一左右的玻璃，都是匹兹堡生产的。卡耐基这一着棋的确走对了。这证明他有超人的见识和犀利的眼光。在匹兹堡发展冶铁业占尽了“地利”的优势。
他在美国内战行将结束之时，就创办现代大工业，也占尽了“天时”的优势。这个时期是百年难遇的发展工业的大好时机，南北战争一结束，遭受战争破坏的南部急需重建，由于有北方的雄厚工业基础，南部地区迅速实现了工业化，从此美国出现了一个工农业和科学技术发展的狂飙时期。到19世纪末，美国的工业总产值就超过了英国，跃居世界第一位，1890年美国生产总额占全世界生产总额的百分之三十一，钢产量达到434.5万吨。在这30余年间，美国工业增长率始终保持在4%—5%之间，在当时西方列强中首屈一指。到1900年，美国人均国民生产总值已达1000美元。钢产量达到1000万吨。由此可见，美国的真正的工业革命，是19世纪五、六十年代开始的，而结束于19世纪末和20世纪初。卡耐基投身办工业之日，正值一个伟大历史阶段开始之时。他的事业与美国的真正工业革命相终始，任何一部美国工业发展史都载有他的名字，被称为“美国钢铁业奠基人”。