蒋介石接着召开了裁军会议，要求所有非他嫡系的部队大规模裁员，各路将领们看穿了蒋介石裁军的把戏，进行了联合抵制。
1930年3月，阎锡山、冯玉祥和桂系李宗仁在秘密中结成联盟，发出通电逼蒋介石下野，由阎锡山任中华民国陆海空军总司令，冯玉祥、李宗仁和张学良为副总司令，领导反蒋。4月1日，阎、冯、李分别通电就职，而张学良却没有表态。蒋介石亦随即通电对阎、冯、李进行讨伐。蒋介石同冯、阎军在豫皖苏鲁中原大地展开激战，桂系李宗仁军则联合张发奎从广西北上攻入湖南。双方在东起山东，西至襄樊，南达长沙，绵延数千公里的战线上展开了混战。
孔祥熙为帮助蒋介石取胜，利用他的北方祖籍，在冯、阎军内部寻找朋友，拉拢他们背叛上司，暗中投靠蒋介石。
孔祥熙派人找到了冯玉祥部的师长何其巩、丁春膏，转达了孔祥熙的意向：“何师长，你们家乡可是风水宝地，孔部长为国计民生考虑，有意在你们家乡投资发展现代工业，不知何师长意下如何？”
“有这种事？”何其巩半信半疑。
“是啊。孙总理在世时早已讲过，民族民权问题已经解决，唯有民生问题需不断努力。孔部长上任以来，念念不忘的就是如何解决民生问题。像师长家乡那样的地方，只要投入资金，定会很快富足起来，支援整个国家。不知师座对此有意合作否？”
何其巩大为振奋，如果真能办成这样一件大事，自己在家乡父老面前将不仅何其巩，而且是何其光（彩）了，那比官升几级都更有面子。何迫不及待地问：“如果我同意合作，怎么个办法？”
“孔部长已经把项目启动资金交我带来了，如果师长愿意合作，就交你先找人进行勘察设计，一俟目前的战乱结束，资金立即可以到位，不出一年，一个现代化的大项目就可以矗立在你家乡的土地上了。”
何其巩早已忘记了自己是冯玉祥的部下，正在同孔祥熙所在的蒋介石南京政府进行生死决战，乐颠颠地签上自己大名，拿了“项目启动资金”10万元。
于是何其巩、丁春膏同孔祥熙函电交驰，讨论战事进展情况，探讨怎样尽早结束这场蒋、冯、阎大战。不知不觉当中，何、丁把冯部兵力部署、作战意图报告了孔祥熙，让蒋介石得到了对方最核心的作战机密。而何、丁也盼望战争早日结束，并且由蒋介石获胜，好把大笔金钱拿到手，在家乡办几件实业。
蒋介石得到何、丁的情报，连连夸奖孔祥熙：“庸之兄，真有你的，想不到一个实业部长胜过参谋总长的作用，啊！”
孔祥熙美滋滋的：“花了政府不少的钱哪。”
“哈，咱们的政权保住了，要多少钱有多少钱；政府完蛋了，还有什么钱？有钢用在刀刃上，有粉搽在脸蛋上嘛！啊？”蒋介石大度得很。
“委员长不怪罪就好。”
战局朝着有利于蒋介石的方向悄悄转化。
战局扑朔迷离之际，孔祥熙又拉住了张学良。张学良以调停为名，派出10万大军入关，攻占了北京。北京是冯、阎政府所在地，当初阎锡山特意选了9月9日9时9分在北京宣誓就任主席，想用这个谐音把他的政府久久维持下去，不想他的副帅张学良一入关，反把老窝给踹了。冯、阎军受到蒋、张南北夹击。
11月，冯、阎战败，蒋介石意欲穷追清算，驻在山西阳泉的冯玉祥部下29军军长宋哲元，想向蒋介石表示效忠，继续保持完整的军制而不得。宋哲元找到丁春膏请求帮忙，丁春膏想了半天还是走孔祥熙的路子可靠，就介绍了肖振瀛去求孔祥熙。
肖振瀛跑到南京孔祥熙府里，一见孔祥熙就扑通跪到地上，涕泪俱下地说：“我今天来见孔部长，不是为个人私利，而是为了团体，为了朋友，请孔部长一定帮这个忙，设法保全29军！”
孔祥熙在屋内踱着方步：“哎呀，不是我不帮你，难办哪！这些家伙当初气势汹汹，逼委员长下台，今天他们被打败了，委员长就是想饶他们，委员长手下的那些将军也不干哪！”
“我们知道孔部长待人一向宽宏大量，又是委员长身边的智囊人物，委员长对您可是言听计从的。你看在我们同是北方人这点上，就帮宋军长说说好话吧，宋将军今后不论遇到什么情况，绝对永远效忠蒋委员长！而且对你这个救命恩人，也会感恩戴德、永志不忘的。孔部长，你想想这一回要把所有参战部队都灭了，你今后在军界想听个家乡话都难啦……”
“你先起来，让我想想。”
“孔部长不答应救弟兄们，我就永远不起来！”肖振瀛倒意志如铁。
“哈呀，你先起来嘛，万一有人来了，看见我这里还有人跪堂，传出去还不把我当成清朝贪官呀！”孔祥熙有些着急。
“你先答应了，我才能起来。否则，救不了弟兄们，我回去也是死，倒不如跪死在孔部长这里，叫弟兄们知道以后有事不要往这里走……”肖振瀛的激将法使出来了。
“光叫我答应，总得有办法才行嘛。”
“我这次带来了10万元，是给部长做活动经费的。事成之后，宋军长自然还有答谢。”
“保全一个建制军，还得给他们一块地盘，嗯，这恐怕是需要10万元的。不过，光有钱也不行，还得有说辞，能用道理打动人……”
“道理咱们有啊，你想想，晋系的商震、徐永昌部虽已投降，可是赵承绶、杨爱源、王靖国都还有实力，如果孔部长能扶持宋军长，宋军长今后对委员长定是忠贞不贰，不可以对晋系部队有所牵制吗？”肖振瀛早想好了说辞。
“着！”孔祥熙一掌拍在茶几上，震得杯子乱晃，“就这一条道理，即使不用钱，也……”
“部长说什么？”肖振瀛抬起了头。
“嗯，我是说，如果从这个角度讲讲道理，钱再多一些，也许可以一试。”
“谢谢孔部长，我代表29军全体弟兄给孔部长磕头谢恩了。”
“好了，快起来吧。朋友之间嘛，谁没有用着谁的时候，我能帮上的忙，绝不会推辞的。”
孔祥熙向蒋介石进言。讲了几句以宋制阎的道理，蒋介石认为大有道理，不仅答应了保全宋哲元的建制，还一次拨给宋部50万元军饷，要他好好看住阎锡山，别再让这个土皇帝出娘子关图谋不轨。
孔祥熙为蒋介石出了力，也在北方军队中博得了好名声。“有事找孔部长，还是咱北方人好说话。”这句话竟然传诵一时。
拿得起、放得下，誓与蒋介石共进退
1931年11月，国民党在南京召开“四全大会”，蒋介石要求会议补选孔祥熙为中央执行委员。
“党内老资格的同志和有贡献有能力的这么多，为什么孔祥熙要进中执委？是否因为他是谁的亲戚？”和上次推荐孔任部长时的情形差不多，孔祥熙又一次遭到一些人的抵制。
这次蒋介石学乖了，他不再以高压相逼迫。而是娓娓动听地讲了一番道理：“各位，请注意这样一个事实，国民革命先在南方发动起来，因此看看我们决策层中，大多是南方人，这不足为怪，因为大家最先觉悟、最早投身革命嘛！不过，看看今日中国，北方也崛起不少实力派人物，对他们的力量和作用，诸位不可小觑噢！庸之兄出生在山西，又为孔子后裔，对党国忠心耿耿。他进中执委，完全可以利用他的北方祖籍和孔圣人后裔的优势，为我们做很多疏通联络工作，这是一方代表、一个名额能发挥这么大作用，为何不肯通过？如果大家还有这样有代表性的人选，不妨也提出来，比较一下再定。你们有没有这样的人选？”
蒋介石讲的还真有几分道理，其他人无法反驳，孔祥熙于是当选国民党中央执行委员，真正成了蒋家王朝的股肱之臣。
但是孔祥熙的高兴劲还没过去，党内的反对派就分别在上海、广州也召开了“四全大会”，再一次逼迫蒋介石下野，改组南京政府。
蒋介石无法抵挡，只好在1931年12月15日通电辞去国民政府主席、行政院长和陆海空军总司令之职。
在蒋介石危难之际，孔祥熙再次表现出了与蒋介石共进退的姿态，立即宣布辞去实业部长职务，以示对蒋介石的支持。
孔祥熙很显示了一番英雄气度。他在把实业部长的大印交给继任的陈公博以后，当众发表了一篇讲话。他说：“我们平常不都标榜‘拿得起、放得下’的精神吗？我觉得拿得起的时候，应该以天下为己任；放得下的时候，应该弃天下若敝屣。这才合乎政治家的风度。不管什么人上台下台，政府还是国民政府！”孔祥熙的这番宏论赢得了一片掌声。
孔祥熙辞职，确实是一种高明之举。一方面表明了他追随蒋介石的决心，一方面也使自己从繁忙的政府公务中解脱出来，既有时间又非常方便地四处活动。他为蒋介石拉拢势力，对反蒋派进行分化瓦解。为蒋介石的再次出山和自己进一步在未来的政府中取得更加有利的地位，奠定了根基。
取蒋介石而代之的孙科，早就被一些外国记者描绘成“无能的忧郁者”，他上台之后，蒋介石操纵自己的嫡系人马，处处给他下绊子。原来政府中的要员纷纷辞职，而仍然留下来的，有的则是专门为了与他捣乱。加上此时的中国，内忧外患严重，孙科上台一个月，拿不出一件治理国家的像样方案，下达的政令处处受阻，根本无法行使职权。这时，那些反对派又一次看到了，在国民党内，蒋介石的位置是不可替代的，没有他，别人什么事也办不成。1932年1月24日，孙科被迫宣布下台。
经过孔祥熙的积极活动，蒋介石于1月28日再次像凯旋的英雄一样，从他的老家溪口（蒋介石自1927年上台到离开大陆，先后5次辞职下野，每次都是回到溪口，遥控局势，然后又从那里出发复职）出来，到南京主持召开国民党临时中政会。在会上，汪精卫被选为行政院长，蒋介石被推举为军事委员会委员长兼军事参谋部参谋长。蒋介石又一次独自掌握了军权。而在当时的中国，军权是权中之重，谁有了军权，谁就几乎可以操纵一切。
蒋介石一上台，立即委任孔祥熙为“中华民国考察欧美各国实业特使”。这个特使，实质是为了蒋介石进一步加强军事力量，向欧美各国洽谈购买飞机军械的采买大员。
孔祥熙虽然多次出国，但那都是自费，且以个人名义进行的。这一次却是作为国家特使，由各国政府接待，经办政府事务，还可以名正言顺地偕夫人一起观光游览。在他要访问的国家里，他就可以代表民国政府发言表态，决定购买哪家的产品，位尊权重，一时成为各国军火商人巴结的热点人物。得到任命的孔祥熙，也自有一股无上荣耀和重任在肩的感触。