细菌是一类单细胞的微生物。由细菌侵染花卉引起的病害称为细菌性病害。细菌侵染主要通过气孔、蜜腺、伤口等途径，一般借助流水、风雨、昆虫、土壤以及病株残余体等来传播。细菌病害的主要症状类型有腐烂、坏死、肿瘤、畸形和萎蔫等。其主要表现特征是受害组织呈水渍状，在潮湿条件下常从发病部位向外溢出细菌粘液，出现“溢脓”现象。这是识别细菌病害的重要依据之一。
常见的细菌性病害有软腐病、根癌病、细菌性穿孔病、细菌性叶斑病等，现分述如下。
（1）软腐病一般多危害根茎、球茎、鳞茎、块根等营养器官，也有的危害叶片或茎部。通常受害部位最初呈水渍状，后变为褐色，最后变为粘滑软腐状。在湿度较大的条件下，变成腐臭的浆状物；在干燥情况下，病部失水呈粉状干瘪。软腐病主要危害球根花卉以及君子兰、仙人掌等。
防治方法：剪除病株，剪口涂硫磺粉或代森锌；病根、病叶烧毁；实行轮作，栽植前进行土壤和繁殖材料消毒，可用1％福尔马林或链霉素1000倍液。
（2）根癌病病菌多侵染根须部，形成不规则的肿瘤，初期呈淡褐色，表面粗糙，柔软或呈海绵状，后期颜色变深，内部组织木质化，成为坚硬的瘤状物，发病严重时导致整株死亡。根癌病主要危害梅花、樱花、菊花、月季、大丽花、香石竹、天竺葵、秋海棠等。
防治方法：栽种无病苗木或实行轮作；发病后立即切除病瘤，涂硫磺粉或0.1％升汞水消毒。
（3）细菌性穿孔病主要危害樱花、梅花、碧桃、杏等叶片，枝梢和果实也有时受害。发病初期叶片上出现淡褐色水渍状、近圆形或不规则形病斑，周围有淡黄色晕圈，以后病斑不断扩大，变成深褐色或紫褐色，病斑边缘木质化，引发穿孔。
防治方法：发病前喷65％代森锌600倍液预防；及时清除受害部分并销毁；发病初期喷洒50％退菌特800～1000倍液。