花卉病害对花卉根、茎、叶等任何部位引起的损伤，都会影响花卉的正常生长发育，降低观赏价值，有些还能导致局部或整株死亡。
（1）病害对根部的影响：不少花卉因根部受害，造成根部腐烂，破坏了水分的吸收和养分的输送，引起植株生长衰弱，甚至全株死亡；有的根部膨大形成瘤状物，影响根部吸收作用，导致植株矮黄、生长停滞等。白绢病、立枯病、根腐病、根结线虫病、根癌病等都是由于根部受病原物侵害所致。
（2）病害对茎部的影响：有些花卉因病菌堵塞或破坏寄主维管束的水分运输，造成植株萎蔫、死亡；有的茎部病害引起枝条溃疡病；有的病害造成根茎部皮层腐烂等。常见的有枝枯病、萎蔫病、菌核病、腐烂病等都是由于茎部受病原物侵害所致。
（3）病害对叶部的影响：多种花卉叶片感病后出现黄化、花叶、皱缩、病斑或焦枯等症状，严重时造成落叶，影响光合作用，降低花卉的观赏效果。常见的有各种叶斑病、叶枯病、炭疽病、白粉病、锈病、煤烟病等。花卉叶部病害是花卉上流行最广的一类病害，其种类多于根部病害和茎部病害。这与叶片的保护组织比较柔嫩脆弱，易被侵染，病原物适宜广泛传播等因素有关。但叶部病害对花卉造成的为害一般不如其他两个部位病害严重。此外，一些花卉感染病毒病后，影响花卉正常生长和发育，降低观赏价值；有的花卉病害，引起花腐，影响开花和结果。