台湾特种部队的士兵主要从志愿兵中精心挑选意志坚强、身体强健、反应敏捷、纪律性强、能吃苦耐劳、敢于“玩命”、大专以上文化程度、有5年以上军龄、精通战术技术、训练成绩突出者；军官要通晓特战理论原则，观察、分析、判断和独立组织训练、指挥作战能力强。入选者无论从事过何种兵种、有何专长均需经过6～9个月的初期训练，并采取严格的全程筛选，淘汰率达80%，尔后进入特种作战训练中心进行强化“地狱”式的封闭训练，毕业后分配到陆、海、空特种作战部队服役。此训练期为45周左右。
训练上，台湾特种作战司令部官员宣称：“超常的战斗力来自超常的训练，只有经过严格的‘地狱’式训练，才能完成神圣的使命。”其训练内容主要有：
1士兵基础训练。一般为期3个月，在远离城镇的荒山野岭进行各种轻武器射击，为飞机、战舰、导弹、火炮指示目标，修正弹着点，判定方位，选定攻击路线、目标、战术技术等科目训练，以实地演练操作为主，其中夜间训练占总训练时间的1/3。
2军官（军士）训练。主要进行学习基本指挥理论原则、程序方法，快速用、标图，战术想定作业，实兵实地指挥，组织展开侦察、获取、分析、传递使用情报，组织通讯联络、作战协同和各种战术技术训练，目标识别训练，运用“敌我识别系统”识别敌各类目标，并进行用肉眼快速识别敌机、舰、火炮、车辆等目标的训练，要求队员对不同角度、不同形态、经过伪装的运动目标能在10秒钟内识别出目标的数量、性质、方向、速度和企图等。
3海上训练。主要进行对海战兵器、海岸岛屿、军港码头、战斗设施的爆破，高难度潜水，海上机动工具操纵，水中射击，擒拿格斗，判定方位，定点机降，水中自救，武装泅渡，夜间通讯等科目训练。
4特种技能训练。主要在深山老林、丘陵地训练武装越野，钻管道、涵洞，走圆木、三角木，使用绳索，攀登，越墙，排雷破障，徒手夺枪（刀），监视、追踪捕杀对力要员，审讯俘虏，搜集整理情报资料等。
5求生训练。到荒无人烟的深山老林、江河湖泊、高山平原、泥泞沼泽等各种地形训练单兵净水取火防寒保暖、采食野生动植物、无烟野炊，并将队员空投到台湾东部人森林和鲨鱼出没的海域，不发给食物进行绝地求生训练。
6伪装训练。利用伪装网、套、衣、罩、涂料等制式器材和树木、竹枝、草皮、岩洞等简便器材和地形伪装身体和武器装备；夜间构筑工事、掩体、藏身洞，要求50分钟构筑完毕、1.5米内不被人察觉且不露痕迹。
7战术训练。主要进行游击战与反游击战，破袭与反破袭、侦察与反侦察、追踪与反追踪，搜剿与反搜剿、渗透与反渗透、攻击与反攻击、追击与反追击、堵截与反堵截、包围与反包围、伏袭与反伏袭等战术训练，并进行严格考核。为提高训练质量，台军特种作战部队每年均派遣官兵到美国等西方发达国家的特种作战部队训练中心（基地）“加钢淬火”，取经学艺。
武器装备
经过一番疯狂采购，台湾特种部队的武器装备在近几年有了较大飞跃，而各特种部队的军营俨然成了世界先进武器装备的展览馆。特种作战部队的武器装备形成了种类多、性能优、精度高、速度快、体积小，重量轻、抗干扰、威力大等特点。目前，台军特种作战部队的武器装备主要有：（1）各种轻型火炮、单兵导弹、轻重机枪、微型（声）冲锋枪、手枪、匕首枪、磁性及胶贴定时炸弹、瞬发手雷、地雷等：如购置的美制M733突击枪、格洛手枪，以色列制造的“迷你”型乌兹冲锋枪和瑞士制造的SS-2000狙击步枪等。（2）武装直升机、轻型运输机、两栖装甲输送车、侦察车、轻型舰船、微型潜艇、橡皮舟、翼型伞、滑翔、滑水器等。（3）高频发收信机、多功能电台、盔式通话器、袖珍报话机、超远长距照相机、侦测雷达、战场监视、传感目标测向、跟踪定位仪、夜视镜、窃听仪，如购进的摩托罗拉2000型耳膜无线电、TAC -VI型战术背心、德国制造的奔驰3000运输防暴车。（4）雷障探测仪、攀登越障、泅渡、防鲨枪、刀、潜水和美制LAR5型封闭式纯氧水下呼吸器等。
“台湾魔鬼战士”——余奎麟
2004年8月3日，台湾“国防部”举行了一次特殊的记者招待会，一名从美国“学成归来”的台湾海军陆战队两栖侦搜大队队员余奎麟，在台湾当局的安排下，到“国防部”接受岛内记者的采访。
这次记者招待会立即成了岛内最热的话题。据台湾媒体报道，2003年9月16日，台湾海军陆战队选派两栖侦搜大队的余奎麟前往美国，接受美军“海豹”突击队的特种兵作战技能培训。在长达7个月的时间里，余奎麟先后参加了体能训练、战斗潜水、陆地小部队战斗三个阶段的训练。台湾《中国时报》等报道说，余奎麟靠着“不怕苦、不怕难、不怕死”的精神，每天训练12—16小时。其中体能训练阶段被称为“地狱周”，长跑、游泳及驾舟的时间长达112小时，而睡眠时间只有5个小时，“把人类的潜能发挥到极致”。在冬季进行的蛙训中，习惯了台湾南部高温天气的余奎麟，长时间身处温度低于5摄氏度的海水中，“更是饱受失温及意志力打击……”多数台湾媒体都在报道中强调，共有123名学员参加了这次培训，能够坚持到最后的只有11人，余奎麟是其中唯一的外籍人士。
余奎麟家住台湾花莲，现年28岁，毕业于台湾陆军军官学校，曾任排长等职。在接受美国“海豹”突击队训练之前，他还曾两次赴美国参加陆战队两栖侦察班及陆战队初级班的训练。美军“海豹”突击队训练艰苦、淘汰率高，余奎麟能够坚持完成训练的确不易。不过，在台湾一些媒体的宣传中，余奎麟彻底被神化，在两天时间内，就由一名普通低级军官变成了“台湾魔鬼战士”、“台湾悍将”等等，就连台湾特种部队的整体战斗力，也因余奎麟而陡然在宣传中被“提升了一大块”。
不少分析人士指出，台湾特种部队自组建以来，一直处于机密状态，很少出现在媒体面前，即使台湾发生了自然灾害，台湾“国防部”也严禁特种部队参与救灾。台军这么做，目的是要保持特种部队的秘密，以期在关键时刻发挥“撒手锏”的作用。这一次，台湾当局一反常态，为一名普通的特种部队士兵安排专场记者招待会，甚至允许媒体进行渲染性的报道，“状况实属少见”。分析人士认为，台湾“国防部”刻意编排这么一场戏，必有深刻的背景和用意。
据台湾《东森新闻报》报道，8月3日，台湾“国防部”官员公布了几项重大决定：第一，1999年被裁撤的台湾陆军空特部特勤队、海军陆战队特勤队都已恢复建制。第二，要继续加强与美军的合作，全面培训台湾的特种部队，“未来甚至不排除派遣班级以上建制人员，以反恐名义前往美军特战基地协同演习”。第三，基于“决战境外”的战略考虑，下一阶段将扩编目前的特战部队，“以进行跨海及要点突击”作战。这名台军官员还解释了他们扩充特种部队规模的原因：一是“台湾长期面临大陆强大的军事压力”；二是特种部队是实施“决战境外”的重要参与者。
据美国国防部的军力报告透露，台湾特种部队在正规军中的比例接近千分之一，这一比例居世界第一。美国尽管极为重视特种部队，但这一比例也只有十万分之一；而全球80%以上的国家和地区至今仍没有特种部队。由此可见，台湾当局对特种部队有多么重视。
然而，令人觉得困惑的是，台湾当局重视的只是特种部队，并不重视其特战队员。在台湾高官们的眼里，特战队员不过是一种工具而已。有一次，台军的某个总司令视察海军陆战特勤队时竟然公开对大家说：“你们是一群最便宜且最优秀的杀手。”辛辛苦苦在长官面前操练了半天的“甲等作战单位”竟落得如此评价。这位高官的讲话立刻在陆战队特勤队中引起了轩然大波，队员们都表示了极大的愤慨和委屈，情绪受到了很大的打击。此外，在台湾军队中外行领导内行已经不是什么新鲜事了，在特种部队内也不例外。一些从未干过特战的人通过拉关系等手段混入特种部队，然后就为所欲为，这些都极大地影响了部队的士气。这些都是阻碍台湾特种部队发展的负面信息。