雅各宾派争得了通过成立革命法庭的法令；他们利用人们对罗兰的不满，把它逐出内阁，最近又战胜了迪穆里埃。现在，他们只剩下夺取吉伦特党的最后一个阵地——国民公会了。他们是在4月10日开始这项活动的，到6月2日结束。
罗伯斯比尔在国民公会上指名控诉布里索、加代、韦尼奥、佩蒂翁、让索内；马拉则在群众中谴责这些人。马拉以雅各宾派主席的资格向各郡发出一项宣言，要求各郡发动声势浩大的请愿和控诉运动，反对卖国贼和那些主张以人民判决或有期监禁来拯救暴君的不忠诚的议员。国民公会中的右派和平原派感到有联合的必要，他们把马拉送上了革命法庭。这个消息使各俱乐部、群众和公社大为不满。
当马拉被革命法庭判处无罪时，吉伦特派就陷入了被动。6月2日，马拉在市政厅敲响警钟，号召群众集结，雅各宾派组织了8万人围攻了国民公会。虽然其中大多数人根本不知道自己是来干吗的。
马拉代表雅各宾派要求国民公会宣布拘留的吉伦特党人有让索内、加代、布里索、戈尔萨、佩蒂翁、韦尼奥、萨尔、巴巴卢、尚邦、比佐、比罗朵、李敦、拉博·拉苏斯、朗热内、格朗热纳夫、勒阿底、勒萨日、卢韦、瓦拉泽；勒布伦、克拉维埃和十二人委员会的成员：克尔维勒冈、加迪安、拉博·圣艾蒂安、布瓦洛、贝特朗、维热、莫勒沃、亨利·拉里维埃、哥麦尔和贝戈安。6月2日之后，吉伦特派土崩瓦解了，其他党人纷纷逃离了巴黎。而夏洛特·科黛为了拯救共和国刺杀了马拉。
同时，里昂发生了暴动，马赛和波尔多也出现了武装叛乱，除了北部和东部法国。并有三十多个郡响应了暴动。
保王党特别想领导里昂的暴动，把里昂变成南方的行动中心。这个城市是非常留恋旧秩序的，那里的丝绸厂、金银刺绣厂、奢侈品贸易，都使它依附于上层阶级。因此，它很早就反对那打乱旧关系、贬低贵族和僧侣的地位、破坏工厂的社会变革。
当巴黎6月事件爆发后，且传来了卡尔瓦多斯郡暴动的消息，里昂人受到鼓舞就不再犹豫地举起反叛的旗帜。他们在全城设防，构筑工事，组成了一支两万人的军队，收留了逃亡分子，把军队交给保王党普雷西和维里欧侯爵指挥，并与撒丁国王共同策划军事行动。
土伦，尼姆、蒙托邦和南方的主要城市很快地采取了同样行动。自从皮塞侯爵率领少数军队混入吉伦特党以后，卡尔瓦多斯郡的暴动也有了保王的性质。当时，波尔多、南特、布勒斯特、洛里昂各城，都同情6月2日被处死的人。
旺代军初步获胜后，占领了布雷絮尔、阿让通、土阿尔。他们在完全控制本境以后，企图占据边境关隘，打开通向革命的法国以及同英国取得联系的道路。6月6日，由四万人组成的旺代军在卡特利诺、莱斯居尔、斯托夫莱、拉罗什雅克兰的指挥下向索谬尔进发，猛力攻下该城，并准备攻占南特，以期更加稳固地保有旺代郡，控制卢瓦尔河。卡特利诺率旺代军在索谬尔留驻部队后，继续进占翁热，渡过卢瓦尔河，佯作进攻图尔和勒芒，突然转趋南特，然后从右岸配合夏雷特从左岸同时向南特进攻。
国民公会的军队在诺尔郡和比利牛斯山地区节节失利，同时，中部受着里昂军威胁，南部有马赛军压迫，西部则有吉伦特党和旺代军分别进逼，还有两万皮埃蒙特军侵入了法国。
自迪穆里埃与雅各宾派摩擦后，军队与政府不和，已经出现了武力反抗。而这位总司令叛变以后，情况就更为严重。军事行动再也不是一个整体，军队中不复有高昂的士气，内讧不休的国民公会和失意的将军们之间也毫无和衷共济可言了。
从敦刻尔克到吉维这一段边境受到优势军队的威胁。虽然迅速将居斯蒂纳由摩泽尔河调到北路军来，也未能挽回颓势。美因兹方面由于敌人和饥饿的双重压迫，又由于摩泽尔河方面军已被压缩得不能行动，无法前来增援，终于无力坚持而投降了。最后，英国政府看到饥馑可以使巴黎和各郡陷于绝境，就在5月31日和6月2日事变之后宣布封锁法国所有港口，没收驶往法国运送粮食的中立国船只。
而对于路易。查理来说，他之前两年通过商业联盟囤积的粮食。和通过拉瓦锡、拉马克对农作物的研究，发现了氮、磷、钾对作物的影响后，已经开始制作原始的肥料来提高田地的产量。因此英国人的粮食封锁对北部、东部法国一点影响都没，但路易。查理并不打算把粮食交给国民公会。而是要求商业联盟直接发一部分粮食来取代工人的工资。
但这种情况确实使国民公会措手不及。国民公会已濒于解体，它刚刚结束了斗争，胜利者一方还没有时间来建立一个政府。为了拉拢共和派，雅各宾控制的国民公会迅速通过了1793年宪法，它确立了纯粹的群众政权：它不仅承认人民是一切权力的源泉，而且也把一切权力交给人民行使。这部宪法规定，最高主权不受任何限制，各级官员可以随时撤换调动，人人参加直接选举；它规定初级议会不必召集，而是定期举行；由初级议会选任国民代表，并监督代表们的行动；它规定国民议会每年改选一次，适切言之，国民议会不过是初级议会的一个委员会。由于这部宪法规定由群众执政，把政权机构完全分散，以致在任何时代也不能付诸实施，在全面作战时期更不能实施。山岳党所需要的不是极端的民主，而是最严格的独裁。宪法刚刚制定，便予以搁置，统治者保持并加强了革命政府，直到和平恢复。
为了对付内外敌人，丹东要求国民公会颁布法令，授权给初级议会的代表向全国征集武器、粮食、军需品，号召人民踊跃捐输，发动公民的力量，征集四十万人的军队。巴雷尔提出全民皆兵。最后国民公会宣布凡年满十八至二十五岁的法国人都武装起来；以征集的新兵补充军队，用征来的粮糈供应军用。共和国一时遂拥有十四个军，兵额一百二十万。
而此时商盟开始反对国民公会这样征用粮食和征集新兵的方式，这完全破坏了商盟主导下的经济体系。商盟会长弗勒塞尔向路易。查理诉苦，路易。查理告诫他：“商业联盟需要忍耐，山岳党人这样的疯狂是支撑不了多久的。而且商业联盟现在应该主动响应，控制北部和东部的新征集部队，以待有变。
劳动党领导下的工会和农会也开始公开在内部反对国民公会的新政策了，这相当于是在抢劫农会的财产，而工人们则是反对这种不加区别的征兵制度。路易。查理告诫全党，现在是党最艰难的时刻，山岳党人已经是最后的狂欢了，只要度过黎明前最黑暗的时刻，胜利必将是属于劳动党人的。随后路易。查理要求征兵应当由工会、农会自己组织部队成建制应征，绝不能单独应征。各级党组织要安排好服兵役家庭的生活，此外各工厂的骨干技术人员不得应征。
在国民公会聚集起如此强大得力量后，卡尔瓦多斯的叛乱分子被轻而易举地压制了。在韦尔农初度交锋，叛军立即溃散。温普芬企图纠集残部，卷土重来，但未能得逞。从前极力维护吉伦特党的温和阶层表现得软弱无力，并无斗志。另一方面，卡尔托将军率领若干部队进攻南部的叛军，曾两次将他们击败，并尾追到马赛，乘势进占马赛。如果不是失败后逃到土伦的保王党向英人乞援，并且把法国的这个重镇交给英国人，普罗旺斯也会和卡尔瓦多斯一样被制服的。［英国的］胡德海军上将以路易十七的名义进入土伦，他宣布路易十七为法国国王，解除了法国舰队的武装，并从海道运来八千名西班牙军队，占领附近各要塞，迫使向土伦进军的卡尔托退回马赛。
这个消息传来让路易。查理破口大骂，这英国搅屎棍简直是嫌自己命太长了。虽然有议员想借此向国王一家发难，但在倾向路易。查理议员的阻拦下，终于不了了之。
国民公会的军队孤立了叛乱的势力。他们根据山岳党专员的命令，进攻了叛乱的各重要城市：罗贝尔-兰代进入了冈城，塔利安进入了波尔多，巴拉斯和弗雷隆进入了马赛。现在，只有土伦和里昂两城尚待攻克，南部、西部和中部的联合和进犯，均已不足为患，国内只有处于守势的敌人了。里昂已被阿尔卑斯方面军的将领克勒曼包围。里昂叛军受到压力，失去了前沿阵地。城内绝粮，士无斗志。保王党首领们知道继续顽抗已无济于事，就弃城出走。共和军进入里昂，在那里等待国民公会的命令。
旺代叛军在进攻南特的战斗中败北，兵员损失重大，他们的统领卡特利诺战死。这次进攻是旺代叛乱得势和外侵行动的终结。保王党再次渡过卢瓦尔河，放弃了索谬尔，退回原来的营地。但他们的力量仍是很可怕的，追击他们的共和军到了旺代境内又被叛军打败。
但是努瓦木提埃岛的失陷，当地将领夏雷特的部队的溃散，以及拉罗什雅克兰之死，使共和军控制了旺代全境。救国委员会认为，敌人虽被击败，但并未屈服，为了防止他们死灰复燃，就采取扫荡歼灭的极端手段。旺代郡叛军仅有的十六个设防阵地，被杜罗将军全部包围，名为“凶狠纵队”的十二个别动队，踏遍全境各地，搜索森林，纵火焚烧，驱散所有聚集一处的人，并且实行劫掠破坏，在这个不幸的地区造成了恐怖。
外国军队在攻下瓦朗西安、孔代并包围莫伯日和勒盖斯努瓦之后，就在约克公爵指挥下向卡塞尔、昂德斯科特和伏尔内方向进攻。但他们被乌夏尔将军在昂德斯科特击败，并被迫退却。儒尔当接任北路军的指挥，获得在瓦迪尼击败科布尔亲王的重大胜利，解除了莫伯日之围，并且在这段边境再度采取攻势。在其他各边境地段，法军也采取了攻势。于是揭开了1793和1794年的不朽的战役。儒尔当在北路军所做的，奥什和皮什格鲁在摩泽尔方面军照样做了，克勒曼在阿尔卑斯方面军也是一样。敌人到处败退，到处受制。
国民公会大获全胜之后，决定用共和历代替基督教历，用旬代替星期；规定休息日不在星期日，而在每旬的第十天。******始自共和国奠定之日，即1792年9月22日。一年分十二个月，每月各三十日，从9月22日起，依以下顺序排列：葡月、雾月、霜月为秋季；雪月、雨月、风月为冬季；芽月、花月、牧月为春季；获月、热月、果月为夏季。每月三旬，每旬十日，每日按它在旬中的位置分别定名为第一、第二、第三、第四、第五、第六、第七、第八、第九，第十来复日。另外有五日在一年之末，属于全年，称为“无套裤日”，第一日至第五日分别定为“才艺节”、“劳动节”、“行动节”、“报偿节”、“舆论节”。