1582年2月，秀吉率领6万大军，从姬路出发。大军一到冈山城，秀吉立刻命令蜂须贺彦右卫门及黑田官兵卫为使者，到高松城劝城主清水宗治投降，但遭受断然拒绝。不得已的情况下，秀吉决心攻击高松城。这时候，信长率军5万攻进甲斐，在天目山大破武田军，胜赖战死，名门武田家灭亡。
听到这一好消息的秀吉，振奋不已。心想必须早日攻陷高松城，以便进攻广岛。高松城位于冈山平原正中央，四面丘陵环绕，一看便知甚易攻陷。城内守兵2000名，却收容了辖下老百姓3000余人，不但无益于作战，反而增加了粮食的消耗。
但前往劝降的黑田官兵卫及蜂须贺彦右卫门，回来后都向秀吉报告说：“清水宗治是极具胆识的勇将，恐怕不易攻陷该城。”
秀吉听了之后说：“对！我也听说过。虽然是小城，绝对不可以轻视。”
于是秀吉巩固阵地，一步步向前推进，慢慢缩小包围圈，其间也曾发动两三次猛攻，高松城却屹立不动。白耗了两个月，到了雨季。雨中，双方又交战了多次，守军的士气却越来越旺盛，反击猛烈。
一天，望着连绵雨天的秀吉，忽然想到一个计谋，于是对黑田官兵卫高声地说：“官兵卫！有一个计策可攻陷高松城。”
“臣也想有一计。”
“好。写下来看看。”
于是两人都取来纸笔，写下来后，互相交换。一看，都是写“水攻”。
秀吉哈哈大笑，说：“官兵卫，好！就这么办吧。”
所谓水攻，就是在外围贮积大量雨水，将其灌入高松城所在的冈山平原，化平原为湖泊。这个大计划立即实行了。包围高松城用以连接各山之间的堤防，全长3公里，堤高7米，宽10米，是件大工程。秀吉召集数千名工人，搭建数百间小屋后，开始轮班工作，昼夜不停地筑堤。工事于5月7日开始，终于在第十四天完成了。
明智光秀的背叛
不久，高松城附近7条河流的水，一齐被引进冈山平原内。一天夜里，高松城主清水宗治听到摇撼大地的大洪水声，急忙起身，跑上城楼。
洪水从四面八方向高松城滚滚而来，吞没了道路、房子、田野、树林等平原上的一切东西。又惊又怒的宗治，气愤地说：“可恶的羽柴！竟然采取‘水攻’。” 一夜之间，高松城变成湖中的孤城。而且水位还在不断地升高。
当秀吉全力攻打高松城的时候，京都却发生了事变——明智光秀的突然背叛。
在秀吉完成3公里堤防的那一天，信长在安土城大摆筵席，招待由冈崎城来访的德川家康。这一次的飨应奉行（飨应是招待，奉行是主管）是明智光秀。
当天晚上，信长和家康坐在大堂的上座，下方左右两列并坐着其他重臣，每个人的面前各有一方盘，盛有山珍海味的晚膳。当信长在用筷子吃烧烤鲜鱼的时候，忽然眉头一皱，怒声说：“好臭！”众人目光都投向信长。
“光秀！臭鱼怎么能吃？”被信长怒目而视的光秀，面露愧色，俯首不住告罪。时值梅雨季节，天气非常闷热，以致特地从大阪买来的鲜鱼中有些腐腥气味。这对于身为飨应奉行的明智光秀来说，是一大耻辱。
这个时候，信长脾气火爆，丝毫没有为光秀的颜面着想，想到什么就说什么。
“光秀！你是飨应奉行，竟拿臭鱼待客。简直是混蛋！”信长斥骂之后，抓起面前的膳盘，掷向光秀，刚好击中光秀前额，光秀额破血流。
“晚膳全部换掉。光秀免除飨应奉行一职，明天率军驰援秀吉，听令于秀吉！”
“是！”光秀血也不擦，俯首行礼。回到宅邸之后，一人呆坐看，不知夜已深。想到自己仅仅为了一条鱼，遭受这种奇耻大辱，光秀不禁咬牙切齿。他觉得信长虽然是主人，也未免大过分了。20年来辛苦的工作，没有功劳也有苦劳，否则织田家哪有今天？这样对待功臣的主人不要也罢。愤恨之下，光秀萌生了背叛之心。
10天后——1582年6月2日，明智光秀率领着他的部将1.3万人，来到山城国附近。这里有两条路，向右前往备中，向左则前往京都。在叉路的明智光秀，回转马首，焦急地眺望来路，只见一骑飞奔而来。骑士到光秀身旁，焦急地问道：“情况如何？”
“信长公确实已于上月的29日入京。现在住在本能寺，没有兵将随行，只有侍臣和侍卫二三十人。”
“好！”
夕阳西下，群山被染得通红。全军齐整，静待着命令到来，大家都已经感觉出一种异样的气氛。光秀大声宣布：“众人听好！想必各位都已经听说了，我前几日任飨应奉行，招待德川家康，遭受右大臣信长的侮辱。至今前额尚有伤痕，是可忍孰不可忍？大丈夫不能忍辱吞声，血债必须血还，我决心今日袭击信长！”
接着又喊：“众将士听着，进攻本能寺！”
1.3万精兵齐声呼应，声势惊天动地。当时日本的武士精神就是以君耻为己耻，所以明智军敌忾同仇，士气高昂。全军向京都本能寺前进。
魂断本能寺
从少年时代起，百战沙场，历经危难的信长，有异于常人的敏锐感觉。他忽然醒来，直觉得感到空气中有某种异常的气氛向他逼近。信长翻身而起，远方传来震撼大地的步伐声，黑暗中弥漫着杀气。
信长大声叫人。走廊上传来一阵疾跑的脚步声，大声叫喊：“主上！”
原来是侍卫森兰丸。
“兰丸进来。”应声入内的森兰丸，报告道：“主上，真可恨！明智光秀背叛了！”
“什么？”
“我听见远处传来的行军声，所以跑上钟楼观看，明智光秀的旗帜正逐渐靠近。”
信长勃然大怒地说：“心胸狭窄的光秀，竟然记恨前日之事！”
话刚说完，本能寺四周已响起了士兵的冲锋声。信长一听，知道已无法逃生。已知必死的信长，平静地对兰丸说：“你是16岁吧？”
“是的。”
“我原本希望看到你长大后成为英雄，不幸遭逢这个变故，你才16岁，我真是对不起你。”
“主上！您怎么这么说，臣……臣……”森兰丸呜咽不止，泣不成声。
“这也是武士的命运……战斗吧！至少可让后世称赞森兰丸英勇护主。”
“是。”
兰丸应声而起，快步跑到走廊，大声下令：“众侍卫！守住所有门口，不要让敌人接近主上！”
明智军已如波涛般拥进寺内。二三十名织田家的侍臣，挥舞着刀枪迎敌，却如螳臂挡车，不消多时，即被杀死。明智军的甲胄武士，就像疯狂的野兽往正殿和客殿的走廊冲。接着，弹箭也四下飞来。
信长上身穿白色小袖衣，下穿紫裙，手持钢刀，出现在走廊。明智军一见，都争先恐后叫喊着向他冲去。只见信长大喝一声，钢刀一闪，攀上走廊的武士，惨叫一声后，翻身倒下。信长左右的森兰丸、森力丸、森坊丸三兄弟，以及其他侍卫，都拼命抵抗。发结断落，头发披散的信长，有如传说中的白狐化身，妖异慑人。每逢信长一喝，必有敌人流血倒地。大约杀了十来人时，一支飞箭射中了信长肩膀。晃了一下的信长，摇晃中仍挥下一刀，砍到正要攀上来的一个敌人。
一见情况紧迫，信长弃刀迅速跑进自己的居室。身为右大臣，首级如果被无名士兵取得，将是身后一大耻辱。所以他跑进自己的居室，打算切腹自尽。此时，由四面八方纵放的火越来越盛，黑烟弥漫。黑烟中依稀可见人影缠斗。
森兰丸守在信长居室的门前，持着枪就像屹立不动的磐石。他要给主人争取时间，使他能从容自尽，并防敌人取其首级。走廊也冒起黑烟了。忽然烟中跑出一名武士，大声喊问：“右大臣居室在这里吗？”
“退后！无耻的叛徒！”兰丸一喝，枪尖对准武士。
“我是明智家三勇士之一——安田作兵卫。看刀！”
“试试森兰丸一枪！”
兵刃相接，火花四迸。森兰丸乘隙，一枪刺中安田作兵卫的胸膛。
这时，信长清朗的声音从里面传来。
“兰丸，再见。”兰丸一听，立即跪拜在地，然后飞身跃起，推开纸门。只见信长俯伏着，白衣染满了鲜血。于是他立即推倒纸门，覆盖在遗体上面，并点火燃烧。见到居室火焰熊熊之后，兰丸盘坐在走廊中央，追随信长自尽了。一代英雄织田信长，就此魂断本能寺。
将高松城变成湖波中水城的秀吉，设营帐于石井山山麓的一间寺院，耐心等待清水宗治投降。
6月3日晚上10点左右。秀吉听到急促的脚步声传来，还以为清水宗治终于投降了。哪知蜂须贺彦右卫门气急败坏地跑进来说：“主上！京都发生大事了！”
“什么事？”