紧接着，他又跨入了外交政策领域。在圣诞节那天，他不顾外交惯例，向英王乔治三世和奥皇弗朗西斯送交了私人信函，认为以现状为基础，和平解决一切争端的时机已经成熟。他暗示奥军要按坎波一福米奥条约所确认的那样撤回到阿迪杰河一线。然而只要看看他在同一天向部队发布的文告，他那爱好和平的伪善姿态便昭然若揭：
军人们！再也不要求你们保卫边疆了，我们必须打到敌国去！
同一天，他还任命他的弟弟吕西安为内政部长，以便把警察、国内治安和新闻检查牢牢控制在自己手里。
按照拿破仑的原定计划（该计划已于3月22日通知贝尔蒂埃），预备军团应自日内瓦湖上溯罗纳河上游谷地，穿过圣戈塔德山口，再取道马乔列湖进入伦巴第平原（这与俄将苏沃洛夫1799年的那次行动路线正好方向相反）。然而，过了一周他就修订了这个计划，把圣七戈塔德山口划给莱茵军团。
4月6日，预备军团新任司令贝尔蒂埃命令参谋长杜邦将军在第戎建立预备军团司令部。他自己则前往巴塞尔与莱茵军团司令莫罗会晤，以便协调在未来的攻势作战中各自的行动。指挥莱茵军团右翼的蒙塞奉命率一个师穿越圣戈塔德山口，与米兰附近的预备军团会师。与此同时，莱茵军团的余部则入侵黑森林并在那里与克赖将军指挥的奥军交战。
4月18日，贝尔蒂埃从巴塞尔返回后，总揽了预备军团的指挥权。拿破仑早已在那里集结了3万2千人，组成了4个师分别由包德、沙布南、罗森和华亭指挥，而以缪拉指挥的骑兵师为核心。
作战的第一阶段是要把全军向南移动120英里到达日内瓦湖附近一个新的集结地域，然后再由那里沿日内瓦湖并岸行军56英里经洛桑到远端的维尔纳夫。辎重等军需品则用船从日内瓦运往维尔纳夫。独立的日内瓦共和国已于两年前法国强行兼并，并成了法国的莱芒行政区。
同时，13个中立的瑞士州也被拿破仑吞并了，成了法国的一个卫星国。
1800年5月，拿破仑领两万人马，出敌不意地穿越险峻的大圣伯纳德山口，冒着随时会发生雪崩的危险，沿着脚下就是万丈深渊的羊肠小道，只花了7天时间，就翻越了阿尔卑斯山，进入意大利境内。奥军司令梅拉斯大惊失色，仓促迎战。6月14日拂晓，双方主力在马伦哥相遇，经过一天激战，法军大获全胜。意大利北部又重新被拿破仑占领，反法同盟军一年来所取得的成功迅即化为乌有。
俄国的退出和奥地利的失败，使英国陷于孤立。而英国此时也因连年战争，国库濒于枯竭，不得不大举国债和增加捐税。1799年的灾荒，又使粮价飞涨，民怨沸腾，工人区多次出现“要和平和富裕”！甚至“面包或血”！这种威胁性的标语。为了暂时平息危机，主和的阿丁顿政府上台后，即于1802年3月25日同法国签订了《亚眠和约》：法国同意从埃及和罗马撒军；英国则承认法国在欧洲占领的领土，同意撤出马耳他岛和地中海上的其它岛屿，并把在战争期间夺取的大部分殖民地归还法国及其盟邦西班牙和荷兰。
《亚眠和约》的签订，意味着第二次反法同盟的彻底垮台，意味着法国最富裕、最顽强、最危险的敌人也不得不承认拿破仑的一切胜利了。这一辉煌成就使得举国欢腾，拿破仑成了空前的民族英雄。元老院乘机提议拿破仑为终身执政以示“感谢”。这当然正中独裁者下怀，可是他还假惺惺地装出一副勉为其难的样子，声称如果人民的愿望命令他这样做，那么，他将再次为人民作出牺牲。于是，自5月起开始举行公民投票，结果3568885票赞成，8374票反对。8月2日，元老院宣布拿破仑·波拿巴为法兰西共和国的终身执政。巴黎证券交易所的股票价格一下子提高了6倍，仅从行情看涨这一点，便可说明了大资产阶级对自己的“佩剑人”是何等地满意和信任了。
波拿巴担任终身执政，是他扼杀共和、走向帝制的重要信号。从此，在法国的官方文件中，开始出现了“拿破仑”这一鼎鼎大名。
1802年8月15日，是拿破仑33岁生日，又是圣母升天节和批准《教务专约》的周年纪念。在这个喜庆的日子里，巴黎圣母院的塔楼上高高地闪耀着一颗巨星，巨星中心刻有标志拿破仑出生时刻的天体形象。成千上万的巴黎市民仰望着被火树银花般的焰火照得五彩缤纷的塔楼，为这颗给法国带来光荣与和平的巨星雀跃欢呼。
为了给自己的登极称帝增添隆重、神圣的光彩，拿破仑特邀罗马教皇庇护七世前来巴黎参加他的加冕典礼。1804年12月2日，空前豪华的盛典在巴黎圣母院的大教堂举行。拿破仑身着带貂皮的紫色天鹅绒长袍，皇后约瑟芬身披镶嵌金银丝边的白缎长袍——光是这两身皇袍就耗资1123000法郎！庇护七世郑重其事地在他们的额上涂上“圣油”，并表示祝福，然后颤颤巍巍地拿起皇冠准备给皇帝加冕。不料，拿破仑突然劈手夺过皇冠，自己戴上了。接着，他又拿起另一顶较小的皇冠戴在约瑟芬的头上。拿破仑这一使全场愕然的戏剧性举动，无非是为了向天下告白：尽管教皇的在场和祝福，证明他这个皇帝已得到上帝的认可，但这顶象征无限权力的皇冠却不是出于任何人的恩赐，而是他自己凭双手赢得的。
从此，法兰西共和国变成了法兰西帝国，当年那个瘦小的科西嘉少年如今成了备极尊荣的拿破仑一世。
违心退位
拿破仑在战场上是一头猛狮，但这头猛狮也有跟斗紧随其身，更有似蚊子一般狡猾的敌人，使他的一切辉煌被风雪冻灭了。
1812年6月，拿破仑御驾亲征，61万大军越过涅曼河，侵入俄国，并于8月17日晚攻占通往莫斯科的重镇斯摩梭斯克。俄军在撤退前炸毁了军火库，只见烈焰腾腾，火光冲天，街道上尸积如山，几千名伤员的呻吟声响彻全城。拿破仑一边巡视，一边问他的亲随科兰古：“你认为这景色怎么样？”科兰古回答：“可怕！”拿破仑露出得意的微笑：“不！记得罗马皇帝曾说过：‘一具敌人的尸体总是好闻的。’”他回到驻地，就把佩刀扔在桌上，说道：“1812年的战争结束了！”他满有把握地认为，用不了多久，就能打断亚历山大的脊梁骨。
可是，拿破仑高兴得太早了。俄军统帅库图佐夫为了保存有生力量，尽量避免决战，主动撤退，坚壁清野。所以当9月14日法军抵达莫斯科时，发现它竟是一座死寂的空城！第二天半夜又忽然狂风肆虐，四处火起。风助火威，火仗风势，直烧得莫斯科红光满地，烈焰弥天。大火烧了三天三夜，城内四分之三的建筑被焚毁。拿破仑待在克里姆林宫，凝望着窗外的一片火海，脸色变得煞白，沉默了好久才喃喃自语道：“多么可怕的景象！”他再也笑不出来了。