HBVDNA称为乙肝病毒脱氧核糖核酸。病毒从结构上分为两类一类是RNA病毒（核糖核酸病毒），另一类是DNA病毒（脱氧核糖核酸病毒），乙肝病毒属于后者。病毒与细菌不同，细菌体内含有两种核酸（RNA和DNA），而病毒体内只含有一种核酸，或RNA或DNA。核酸是病毒的核心部分，病毒的基因都在这里，没有核酸，病毒就不能复制。因此，检测HBVDNA是判断乙肝病毒有无复制的“金指标”。
有人会问，检测乙肝“二对半”已能反映乙肝病毒有无复制，有无传染性，为何还要检测 HBVDNA呢？这是不是重复检查，增加了病人的负担？可以肯定，检测 HBVDNA是必需的，不是重复检查，原因如下：
1.如果乙肝病人是“小三阳”，一般说这是乙肝病毒进入非复制状态，传染性消失或很低，病情也应当趋于稳定。但实际情况并非如此，有时病人的转氨酶仍然反复波动，甚至出现黄疸，这是怎么回事？经检测HBVDNA发现其为阳性，可以肯定，病毒仍复制活跃，病情不稳定与乙肝病毒活跃有关。“小三阳”乙肝因其HBEAG阴性，被医师称为“HBEAG阴性肝炎”，这是由于病毒“变异”造成的。对此型乙肝不能掉以轻心，病情可能更重。
2.在检测病人“二对半”时，仅发现其中1项阳性，如HBSAG阳性或单一的抗－HBC阳性，这并不能说明病人体内的病毒有无复制，必须检测HBVDNA，一旦阳性，就可肯定仍有病毒复制，也有传染性。
3.有一些肝炎病人的“二对半”5项全部阴性，甚至甲、丙、丁戊型肝炎病毒标志物也是阴性，但病人的转氨酶却很高，有黄疸、肝功能损伤明显，这是怎么回事呢？通过测 HBVDNA后，可能发现为阳性，就此可断定这种肝炎叫“慢性隐匿性乙肝”、在不明原因的肝炎中，此类型肝炎占30%～60%。
4.有的乙肝病人竟被检测到抗－HBS，这是保护性抗体、它的阳性说明感染结束，但为什么病人的病情依旧，并无好转迹象？如HBVDNA阳性，问题又解决了，这叫“抗－HBS阳性乙肝”，也是病毒变异惹的祸。