1939年3月9日，木村兵太郎被任命为日本侵略军第32师团师团长，从此他开始步入了职业军阀生涯，开始了对中国人民生命的践踏。
木村兵太郎上任后不久，就立即准备对我国山东抗日根据地进行疯狂扫荡。1939年4月14日木村兵太郎率领8000多名日军对鲁南抗日根据地进行扫荡，在他率队“出征”前对部队下达命令要不惜一切代价全歼八路军及根据地，还要施行“三光”政策。但是，当日本侵略军进入根据地后就遭到了我八路军第115师的游击战的重创，气急败坏的木村兵太郎便命令日军士兵对手无寸铁的中国老百姓进行血腥屠杀，并将2000多名老百姓关押在新华院集中营做苦工。
从此，这座新华院集中营就成了中国劳工阳间的“阎王殿”，很多山东劳工在被掳略至日本和东北的伪满洲国之前，都会被送到新华院集中营进行“训练”。每一个被送到这里的劳工，每天都会被抽出200cc的血，日军欺骗劳工们说是做化验，其实是供日军伤员输血，有很多人都因抽血过多而致死。有些反抗者会被严刑拷打，甚至被放出的狼狗撕咬。集中营的墙上围着高压电网，很多逃跑的劳工都被电死在上面，而被抓回来的，也会被日军使用极其残忍的手段杀害。
死去劳工的尸体会被剥去衣物，用车拉到济南西郊的“万人坑”。但是济南的这座“万人坑”不过是日本侵略者在中国制造的无数“万人坑”的一座很小的而已。木村兵太郎命令伪满洲国的关东军将劳工送到矿区，矿区周围围着高压电网，并且命令劳工们在矿山附近挖“万人坑”，因疾病、矿区事故、劳累等各种原因死去的劳工就被埋在这些“万人坑”里。在吉林、辽宁、山西等地都有很多座埋着成千上万中国劳工尸体的“万人坑”。
除了为人熟知的“万人坑”，侵华日军还“发明”了“炼人炉”、“骨河床”、“烧火场”、活埋、培植疟疾细菌等杀害中国劳工的残暴手段，这些都是日本侵略者暴行的铁证，是血的证据。
木村兵太郎不仅在中国欠下累累血债，在日本侵略军入侵东南亚国家时，木村兵太郎也率领着日军在东南亚犯下滔天罪行。1944年木村兵太郎在日军面临全面溃退的“危急”时刻被派任驻缅甸方面军司令官。木村到任后立即制定了三个作战方案：一是试图切断中印之间的地面联络；二是攻击曼德勒及伊洛瓦底江畔；三是抗击印度洋沿岸登陆的美英部队。
1944年10月，木村兵太郎指挥驻缅日军大举向中国远征军发起进攻，但是，在中国远征军的猛烈打击下，日军丢盔卸甲，四下逃窜。受到如此惨败，木村兵太郎在日本大本营前丢尽脸面，于是将一肚子的火气撒在了缅甸老百姓和俘虏的身上，命令部下对他们进行虐待与屠杀，一手制造了仰光大屠杀。
在战后接受审判时，木村兵太郎被揭发，在缅甸战争挫败后向部下下达了屠杀的命令，对部下樱井省三说日军损失多少士兵就两倍于这个数字的去屠杀缅甸百姓，当时，日军损兵6300多，照这样计算，被屠杀的缅甸人民和战俘就至少达1.6万多名。被杀的战俘中有中国的士兵，也有英美军队的士兵。从此，这个杀人魔头得到了“缅甸屠夫”的恶名。