咽炎有急性咽炎和慢性咽炎之分，急性咽炎可因病毒（以柯萨奇病毒、腺病毒、副流感病毒为主）和细菌（以链球菌、葡萄球菌及肺炎链球菌多见，其中以A组乙型链球菌感染者最为严重）感染以及环境因素（如高温、粉尘、烟雾、刺激性气体等）导致，如属于病毒感染或环境因素导致者，不用抗生素治疗；若属于细菌感染或病毒感染合并有细菌感染者，要选择适当的抗生素治疗。抗病毒药可选用如吗啉双胍，0.1克每次，每日3次；或选用阿昔洛韦0.2克每次，1日4次。对细菌感染较重者，要选用抗生素或磺胺类药物治疗，常用的有阿莫西林（羟氨苄青霉素）0.5克每次，每日3次，本药口服吸收良好，常用于溶血性链球菌、葡萄球菌及肺炎双球菌等所致的咽喉感染，但该药可发生过敏反应，故青霉素过敏者禁用，偶见荨麻疹或麻疹样皮疹，此时应停药。也可用头孢氨苄，0.25每次，每日4次；环丙沙星0.25克每次，每日2次，注意该药18岁以下患者禁用。急性咽炎属于风热型及火热型者，可服用牛黄解毒片，每次4片，每日3次；亦可复方板蓝根片，每次4片，每日3次，或板蓝根冲剂，每次1包，每日3次。也可用六神丸或喉痛解毒丸，每服10丸，每日3次。银黄注射液和板蓝根注射液都有一定的抗菌抗病毒作用，也可酌情选用。局部用药给予复方硼砂溶液含漱；或以溶菌酶含片、度米芬喉片、碘喉片或薄荷喉片含服，每天4～6片。复方克菌定（得益含片）有杀菌、消炎作用，每2～3小时含服1片。发病初期也可用1%碘甘油或2%硝酸银液涂擦咽壁，以助炎症消退。如果因咽痛而影响进食者，应给予静脉输液，补充营养。咽痛剧烈或体温较高者，可口服复方阿司匹林（APC），每次0.5g，或肌内注射阿尼利定、柴胡注射液等。
慢性咽炎一般不需要使用抗生素治疗，因为慢性咽炎并非细菌感染。然而，在门诊，许多确诊为慢性咽炎的病人坚决要求医生给予抗生素治疗，部分病人甚至自行到药房购买抗生素服用。这样滥用滥服抗生素有害而无益。因为滥用抗生素可能导致咽喉部正常菌群失调，引起二重感染。慢性咽炎的治疗主要针对病因，如戒烟戒酒，积极治疗急性咽炎及鼻腔、鼻窦、扁桃体的慢性炎症，改善工作和生活环境，避免粉尘及有害气体的刺激。加强锻炼，增强体质，预防感冒。病人如有咽干、咽痛可选用一些含片，如华素片、草珊瑚含片、银黄含片、泰乐奇含片、西瓜霜含片等，以减轻或解除症状；也可选用各种中成药，如万应胶囊、清咽利喉颗粒、一清胶囊、十味龙胆花颗粒。如果患慢性肥厚性咽炎，咽干、咽部异物感明显时，可采用分次激光、冷冻或电灼治疗。此外，保持室内合适的温度和湿度，空气新鲜，是防治慢性咽炎的有效措施。早晨、饭后及睡觉前漱口、刷牙，可以保持口腔清洁。同时，防治口鼻疾病，消除炎性病灶，对防治咽炎也不容忽视。需要注意的是，慢性咽炎极易反复，症状常发生在疲劳、受凉、烟洒过度、进刺激性食物、气候突变及吸入寒冷空气后。若病人咽干、咽痛较为剧烈，部分病人还有发热，检查常可见咽部黏膜急性充血、肿胀，血常规检查白细胞增高，中性粒细胞百分率增高，可在医生指导下使用广谱抗生素治疗或根据药敏试验选用敏感的抗生素治疗3～5天，急性症状消失后马上停药。同时，病人需休息，多饮水及进食流汁饮食。