封建政权不能得以长久统治天下的原因，关键在于统治者没有调节好内部矛盾，使得各自的利益相冲突。崖海之战，标志着赵氏家族的灭亡。赵氏家族的“祖宗法度”束缚了许多想有所作为的领导者，“安内终于攘外”的统治策略终结了家族的统治。
元军下定决心斩草除根，步步为营，对南宋小朝廷紧追不舍，宋军已陷入三面包围之中。硐洲地处雷州半岛，而雷州具有重要的战略地位，对战局的发展有着至关重要的作用。在元军的猛攻之下，雷州失守，小朝廷形势非常危急。张世杰数次派军想夺回雷州，但都未能成功，于是将流亡政权迁至崖山。
小朝廷到达崖山时，尚有正规军和民兵20万人，而进攻的元军只有数万。仅就兵力而言，双方相差悬殊，且元军不善水战，宋军无疑在这方面占有优势。但张世杰已经对前途不抱希望，放弃了对崖门入海口的控制，把千余艘战船背山面海，用大绳索连接，四面围起楼栅，结成水寨方阵，把木制战船两侧用衬垫覆盖，以防御元军的火箭和炮弩，赵昺的御船居于方阵之中，打算在此死守。张世杰此举有两大失误，一是放弃了对入海口的控制权，也就等于把战争的主动权拱手交给了对方；二是把千余战船贯以大索，结成水寨，虽然集中了力量，但却丧失了机动性，相当于把宋军主力暴露在敌人面前，任人攻打。
祥兴二年（1279年）正月，元军都元帅张弘范从广东由海路到达崖山，包围了张世杰的部队。宋军陷入孤立无援的境地，在10多天的防御战中，将士们只能以干粮充饥，饮海水解渴，饮过海水的士兵呕吐不止，战斗力严重削弱。
同年六月二日，元军向崖山发起总攻。元将李恒指挥水军，利用早晨退潮、海水南流的时机，渡过平时战舰难以渡过的浅水，从北面对宋军发动了一场突袭，到中午，北面的宋军已被元军击溃。南面的元军又在张弘范的指挥下，利用中午涨潮、海水北流的时机，向宋军发动了另一次进攻。宋军南北受敌，士兵又身心疲惫，无力战斗，全线溃败。战斗从黎明进行到黄昏，宋军多艘战舰被毁。张世杰见水师阵脚大乱，战船为大绳索连贯，进退不得，这才下令砍断绳索，率10余战舰护卫杨太后突围。
张世杰率船杀到外围，见赵昺的御船过于庞大，被外围的船只阻隔在中间，无法突围，便派小舟前去接应。当时，天色已晚，海面上风雨大作，对面不辨人影，陆秀夫唯恐小船为元军假冒，断然拒绝来人将赵昺接走。张世杰无奈，只得率战舰护卫着杨太后杀出崖门。宋军败局已定，陆秀夫知道已没有逃脱的可能，便把自己的妻儿赶下大海，接着对赵昺说：“事已至此，陛下当为国捐躯。德佑皇帝受辱已甚，陛下不可再辱！”赵昺身穿龙袍，胸挂玉玺，随陆秀夫跳海自尽。至此，延续了近320年的赵宋王朝正式结束。
这是一场少见的残酷战役，战斗结束时，海面上到处漂浮着尸体。文天祥此时正在崖山元营，亲眼目睹了这一惨状，他在诗中写道：“羯来南海上，人死乱如麻。腥浪拍心碎，飙风吹鬓华。”数天之后，陆秀夫尸体浮出海面，被乡人收葬。元军在清理战场的时候，发现一具身穿黄衣的幼童尸体，身上带有玉玺，上书“诏书之宝”四字，送交张弘范，经确认是赵昺所带玉玺。等张弘范再派人寻找赵昺尸体时，已下落不明。
晋祠侍女像加图：《二十四史》p463的S1708张世杰带着杨太后冲出重围。听到赵昺的死讯后，杨太后失声痛哭，投水自尽。张世杰收拾残部，逃亡海上，突遭暴风雨，张世杰仰天大呼：“我为赵氏已经尽心尽力了，一君亡，又立一君，如今又已亡矣。如今遭逢大风，不知天意如何？若老天不要我存复赵氏，就让大风吹翻我的船吧！”话语刚落，狂风大作，船便沉于海中。
崖山之战，是元军消灭南宋最后一战，流亡近三年的南宋小朝廷灭亡。张世杰、陆秀夫等人的部署失误，是崖山之战失败的重要原因。但即使如此，他们所表现出来的民族气节，仍不能不让人叹服。