小儿慢性腹泻常导致营养不良，进而引起死亡。全世界每年约有500万儿童死于这种情况，成为儿童死亡的第一位原因。在我国北京地区，小儿慢性腹泻主要由沙门菌引起，并同时伴有肠道功能失调。急性菌痢转为慢性菌痢者占10%～15%，小儿患慢性腹泻时首先是实验室检查。
（1）实验检查：首先要进行细菌培养及大便常规检查。弄清腹泻原因，有针对性地进行抗菌治疗。
（2）调整饮食：大部分腹泻患儿有双糖酶水平的下降。如果禁食，可以减轻腹泻但饥饿更加重营养不良；如不控制饮食，必然加重腹泻。此时需要有一个饮食调整阶段，对大部分患儿效果十分明显。饮食的配制，主要采用脱脂奶、米汤及糕干粉。
（3）提高免疫：慢性腹泻患儿的肠黏膜及大便中免疫球蛋白A含量明显下降，是腹泻慢性化的原因。常采用胸腺肽等免疫调节剂，必要时输新鲜血，并注意给患儿补充钙、钾及各种微量元素。