根据使用抗甲状腺药物治疗甲亢，可以根据患者甲状腺肿大程度、甲亢类型、症状控制、甲状腺功能以及免疫指标等情况，对长期疗效进行预测判断。
1.甲状腺肿大程度
甲状腺小或治疗中甲状腺明显缩小者则长期缓解的可能性大；而甲状腺肿大越显著或治疗中甲状腺肿缩小不明显者则复发的可能性大。
2.甲亢类型
毒性弥漫性甲状腺肿（Graves病）及T3型甲亢疗效相对较好，长期缓解的可能性大；毒性结节性甲状腺肿疗效相对较差，复发的可能性大。
3.症状控制
较小量的抗甲状腺药即可以控制病情者，长期缓解的可能性大。
4.甲状腺功能
甲亢症状控制后各项甲状腺功能试验结果始终正常者，长期缓解的可能性大。
5.免疫指标
毒性弥漫性甲状腺肿（Graves病）患者的TSH受体抗体在血中测得的时间较短，各项甲状腺自身免疫指标（TSI）恢复阴性者，则复发的可能性小。
6.吸131I率
抗甲状腺药物治疗1年后，停药做甲状腺片抑制试验，吸131I率在15%～35%者可停药观察，其中约80%患者可以维持缓解。
7.TRH兴奋试验
TSH对TRH有兴奋性反应者，长期缓解的可能性大。