底栖生物采样器包括底拖网、采泥器和柱状取样管。底拖网由长方形或三角形的架子和袋形网构成，用船拖曳在海底采集底栖生物样品。采泥器有蚌式采泥器、弹簧采泥器等，依靠重力或弹力将两个颚瓣插入海底表层沉积物内取样。柱状取样管靠降落时自身的重量插入底质中，采集小型底栖生物样品。
