基督教的新教徒接受希伯来《圣经》，并将其称为《旧约》，然后又加了27本书构成《新约》，以《马太福音》开始，《启示录》结束。罗马天主教接受希伯来《圣经》和《新约》，但是也加了七本书，名叫《次经》。东正教接受希伯来《圣经》和《新约》，但是在《次经》中又多加了四本书。因此，《圣经》对于不同的人而言，意味着不同的东西。
保留宗教作品的群体在决定哪些书是神圣的，哪些不是的时候，便产生了这些不同版本的《圣经》。这一过程发生在公元2世纪及以后，也就是死海古卷被存放入洞之后的许多年。
尽管现在《圣经》被作为一大本书（称为一个“汇编”）出版，但是在古代，《圣经》的每一本书都是单独抄写成卷的。有时，几部作品被抄写在一部羊皮卷上作为一本书。例如，12位小先知（从何西阿到玛拉基）的作品经常这样处理，然后被当作一本书看待。在库姆兰洞中，除了《以斯帖记》和《尼希米记》之外，人们发现了希伯来《圣经》其他所有书的羊皮卷残片，也发现了《次经》中的一些书，例如《托比特书》。这些羊皮卷对于《圣经》研究非常重要，因为它们比我们目前拥有的任何其他希伯来《圣经》版本都要早1000年。其中最古老的抄本之一是一部《出埃及记》的抄本，它的年代可以回溯到公元前250年。这些抄本向我们展示了在犹太人决定制定一本规范的《圣经》之前《圣经》是个什么样子。
学者想要知道的一个问题是，拥有死海古卷的犹太群体是否拥有一个和现在希伯来《圣经》相同的《圣经》或者规范。答案是：“并不完全如此。”该团体没有一份圣书的官方列表，即教规。但是，他们确实认为有些书是神圣权威的，如同现在的某个犹太群体认为希伯来《圣经》是神圣权威的一样。这些书中也包含被认为是该团体宗教信仰及实践基础的律法书（也称为摩西五经——《创世记》、《出埃及记》、《利未记》、《民数记》、《申命记》）。该社团的成员也认为先知书和其他的书例如《诗篇》也是神圣权威的。但是和现在的犹太人不同，他们认为《传道书》、《以斯帖记》或《雅歌》并不神圣，他们也可能对其他书存在疑义。因此，这一团体可能并不认为现在的希伯来《圣经》中的所有的书都是神圣的。
与此相反，这一社团确实认为有些书是神圣的，但是犹太人却拒绝这些书，这可能包括《以诺书》和《五十年节书》，在库姆兰洞穴中发现这两本书的很多抄本。因此，如果拥有死海古卷的社团有一本《圣经》的话，这本《圣经》也和现在的希伯来《圣经》不同。
现代《圣经》和《圣经》羊皮卷的另一个不同之处在于，现代《圣经》中的文章固定不变。如果你比较希伯来《圣经》（用希伯来语写成）的各种版本，你就会发现每一版使用的词语完全相同。死海古卷并非如此。比较一下同一卷书的不同抄本，你会发现各种各样的差异，有一些差异较小（例如是否有连词“和”），但是有一些差异大至改变整篇文章。
有些差异是由于抄写者在抄写羊皮时的笔误，但是，偶尔我们也会在羊皮卷上发现一个前所未有的好文本，可以对《圣经》文本加以修改。但是，有一些差异并非错误，而是蓄意改动，表明有些《圣经》中的书有两种或者更多的版本。《耶利米书》便是一个很好的例子。《耶利米书》有两种形式，一种比另一种长，章节顺序也不相同。尽管后来犹太人认为有必要从中挑选一种作为官方范本，但是拥有死海古卷的社团却喜欢保留两种形式。
死海古卷的《圣经》抄本告诉人们，在耶路撒冷重建期间，人们对圣书的理解和态度与今天截然不同。这些圣书并非从古代传下来的固定不变的遗产，而是具有生命的东西，在不断成长壮大。对于哪些文本是神圣的，他们的理解也比现在宽泛。死海古卷表明，《圣经》文本和教规随着接受它们的宗教团体而成长变化。